; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G007790 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G007790
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionMicrosomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)
Genome locationGy14Chr5:5505986..5508579
RNA-Seq ExpressionCsGy5G007790
SyntenyCsGy5G007790
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0045047 - protein targeting to ER (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037360.1 putative signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]8.73e-13197.46Show/hide
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XP_008463218.1 PREDICTED: probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo]2.66e-11389.85Show/hide
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XP_022996614.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucurbita maxima]2.09e-11086.8Show/hide
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]2.54e-11187.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KSD0 Uncharacterized protein1.69e-11187.82Show/hide
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A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 21.29e-11389.85Show/hide
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 24.22e-13197.46Show/hide
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 21.44e-11086.8Show/hide
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A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 21.01e-11086.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P58684 Probable signal peptidase complex subunit 25.4e-7575Show/hide
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        +YTKEKNAILFTYPP GSFTSTGL+VSSKLPRFSD YTLTI S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI  YA  EPKK K
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Q55E35 Signal peptidase complex subunit 22.3e-0927.23Show/hide
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        +  L D +++K  LD+S+ + VT+   Y ++ +L+  K++ G +   +A +AQFY   FP+N+  LI+ C +L            YVV + IL +I    
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        +K+ IL       S ++  + V++ L ++   Y + I ++   SI+    V F+KS+  +F   G  +E  F  D+     ++A+   K K
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 24.2e-1131.77Show/hide
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        K +  D  ++K+ LD++  +++  + GY+E   L + +L + TV  +  +VA    Y   FPE++  L     S             Y +  GIL     
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         KEKN  L      PAG        +SS L RF D YTL +S +D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  A E K
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Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 25.5e-1131.25Show/hide
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        K +  D  ++K+ LD++  +++  +  YVE+  L + +LI+ T+  + A+VA    Y   FPE++  L +   S             Y +  GIL     
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         KEK+  L  +   PAG        +SS L RF D YTL ++    K+  A    +FTKS+ R+F  +G LV  LF  +V  L D  A E K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)3.8e-7675Show/hide
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AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)5.2e-6566.16Show/hide
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        A+KN KK NLLDH ++KHLLDESVS+IVT+RGY EDVRLSNVK ++G +II++ALVAQFY KK           C    G+  ++ + GKYVV   ++Q 
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        I+Y KEKNAILFTYP  GSFTSTGL+VSSKLPRFSD YTLTI S+DP+SISA + VQFTKSVT+W TKDGVLVEGLFWKDVEAL+ EY  A EPKK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCAAAAATGCTAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCATCACTCTCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGATTGTCACCACTCGCGGCTATGTTGAAGA
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TGGAATGCAAATCGTTGGATGGTGTCTCTTATGTGATCTTTAACTCTGGCAAGTATGTAGTTTTTAATGGGATCTTGCAGTTTATTGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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