CuGenDBv2

Gene ID	CsGy5G008470
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Mitochondrial ribosomal protein L37
Genome location	Gy14Chr5:6463909..6464678
RNA-Seq Expression	CsGy5G008470
Synteny	CsGy5G008470
Gene Ontology terms	GO:0005762 - mitochondrial large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR013870 - Ribosomal protein L37, mitochondrial

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004144674.3 39S ribosomal protein L54, mitochondrial [Cucumis sativus]

4.30e-45

68.85

Show/hide

Query:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRRK
        ++Q+ LFRR+IIV+SK+ IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    +KHPPLS+LRRK
Subjt:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRRK

Query:  NIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        N ++L YADLKRF+KLDTRARI
Subjt:  NIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

XP_008442187.1 PREDICTED: 54S ribosomal protein L37, mitochondrial isoform X2 [Cucumis melo]

1.18e-47

70.97

Show/hide

Query:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR
        MGL+Q+  FRR+IIV+SKD IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DKHPPLS+LR
Subjt:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR

Query:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        RKN ++L YADL+RFVKLDTRARI
Subjt:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

XP_016899597.1 PREDICTED: 39S ribosomal protein L54, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo]

6.78e-48

70.63

Show/hide

Query:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK
        K MGL+Q+  FRR+IIV+SKD IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DKHPPLS+
Subjt:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK

Query:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        LRRKN ++L YADL+RFVKLDTRARI
Subjt:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

XP_038883606.1 39S ribosomal protein L54, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]

2.51e-46

70.63

Show/hide

Query:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK
        K M ++Q+ LFRRSI VNSKD IQLTS            GSKGGAA DAP+AS LSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY VWL    DKHPPLS+
Subjt:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK

Query:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        LRRKN++TL Y DLKRFVKLDTRA+I
Subjt:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

XP_038883607.1 54S ribosomal protein L37, mitochondrial isoform X2 [Benincasa hispida]

7.93e-46

70.97

Show/hide

Query:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR
        M ++Q+ LFRRSI VNSKD IQLTS            GSKGGAA DAP+AS LSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY VWL    DKHPPLS+LR
Subjt:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR

Query:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        RKN++TL Y DLKRFVKLDTRA+I
Subjt:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KYS4 Uncharacterized protein

1.47e-45

69.67

Show/hide

Query:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRRK
        ++QV LFRR+IIV+SK+ IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    +KHPPLS+LRRK
Subjt:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRRK

Query:  NIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        N ++L YADLKRF+KLDTRARI
Subjt:  NIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

A0A1S3B544 54S ribosomal protein L37, mitochondrial isoform X2

5.73e-48

70.97

Show/hide

Query:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR
        MGL+Q+  FRR+IIV+SKD IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DKHPPLS+LR
Subjt:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLR

Query:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        RKN ++L YADL+RFVKLDTRARI
Subjt:  RKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

A0A1S4DUD4 39S ribosomal protein L54, mitochondrial isoform X1

3.28e-48

70.63

Show/hide

Query:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK
        K MGL+Q+  FRR+IIV+SKD IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DKHPPLS+
Subjt:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK

Query:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        LRRKN ++L YADL+RFVKLDTRARI
Subjt:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

A0A5D3CXE8 39S ribosomal protein L54

3.28e-48

70.63

Show/hide

Query:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK
        K MGL+Q+  FRR+IIV+SKD IQLTS            GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DKHPPLS+
Subjt:  KNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS------------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSK

Query:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        LRRKN ++L YADL+RFVKLDTRARI
Subjt:  LRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

A0A6J1JQ61 54S ribosomal protein L37, mitochondrial-like

7.84e-41

65.85

Show/hide

Query:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS-----------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRR
        M ++Q+ LFRRS++ N+KD I+LT+           GSKGGAA DAP+ASILSKEV+STTVVGANILKEGADPK MAD EY  WL    DK P LS+LRR
Subjt:  MGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTS-----------GSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWL----DKHPPLSKLRR

Query:  KNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        K+ +TL Y DLKRFVKLDTRARI
Subjt:  KNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G01740.1 Mitochondrial ribosomal protein L37

2.0e-25

52.94

Show/hide

Query:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLT---------SGSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVW----LDKHPPLSKLRRKNIQ
        +N++ L R S   +SKD ++ T          G KGG A DAP+ S L+KE++STTVVGAN LK+G+DPK + D +Y  W    LDK P LS+LRRKN++
Subjt:  LNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLT---------SGSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVW----LDKHPPLSKLRRKNIQ

Query:  TLSYADLKRFVKLDTRARI
        TL Y DLKRFVKLDTR +I
Subjt:  TLSYADLKRFVKLDTRARI

AT5G14290.1 Mitochondrial ribosomal protein L37

1.2e-19

58.82

Show/hide

Query:  KGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYS--VW--LDKHPPLSKLRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI
        +G    DAP+AS LSKE++S+ VV AN LK+G DPK + + ++   +W  LDK P LS+LRRKN++TLS+ DLKRFVKLDTRARI
Subjt:  KGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYS--VW--LDKHPPLSKLRRKNIQTLSYADLKRFVKLDTRARI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGAGAATAAAAATATGGGTTTGAACCAAGTTAGTCTGTTTAGAAGGAGCATTATTGTTAATAGCAAAGACCCAATACAACTGACATCTGGGTCTAAAGGGGGAGC
AGCTGTTGATGCTCCTGAAGCATCGATTCTAAGTAAAGAGGTGAGGTCTACTACTGTAGTTGGTGCCAATATTCTCAAAGAAGGCGCAGATCCAAAAGGTATGGCAGACT
TAGAGTACTCTGTTTGGCTTGATAAACATCCACCTCTAAGCAAATTGCGAAGGAAGAATATCCAAACCCTTTCCTATGCAGATCTCAAACGCTTTGTTAAATTAGATACT
CGAGCAAGAATAGGAAAACAACTCTATCAGGACCAAGAACTGATGTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAENKNMGLNQVSLFRRSIIVNSKDPIQLTSGSKGGAAVDAPEASILSKEVRSTTVVGANILKEGADPKGMADLEYSVWLDKHPPLSKLRRKNIQTLSYADLKRFVKLDT
RARIGKQLYQDQELM

CsGy5G008470 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome