; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G014113 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G014113
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationGy14Chr5:19281210..19281707
RNA-Seq ExpressionCsGy5G014113
SyntenyCsGy5G014113
Gene Ontology termsGO:0009791 - post-embryonic development (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032948.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 [Cucumis melo var. makuwa]8.59e-9283.64Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YKSQ+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F VLVST  S+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVE LICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

KAA0058814.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]3.36e-9183.03Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YK+Q+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F V VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEAL+CTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

KAA0062374.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo var. makuwa]2.07e-9084.24Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        M LYN YKSQ+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D FVV VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

KAE8648396.1 hypothetical protein Csa_008568 [Cucumis sativus]4.55e-115100Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

TYK05741.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]4.76e-9184.24Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YKSQ  D  FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F V VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SQX7 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 24.16e-9283.64Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YKSQ+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F VLVST  S+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVE LICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

A0A5A7UUF4 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like1.63e-9183.03Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YK+Q+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F V VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEAL+CTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

A0A5A7V549 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like1.00e-9084.24Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        M LYN YKSQ+D   FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D FVV VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

A0A5D3BDY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like3.12e-8884.24Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YKSQ  D  FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F V VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

A0A5D3C1C9 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like2.31e-9184.24Show/hide
Query:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK
        MRLYN YKSQ  D  FRNDL GQ VVCEQVESSD+L++LSS  T+ETDA CRVLSRYKR+RQ QNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLN  K
Subjt:  MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAK

Query:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP
        Y ILSKIA D F V VST AS+SAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI GKTTLLDLCP
Subjt:  YRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 18.4e-1338.54Show/hide
Query:  QVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAAS-KSAFS--TGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        ++  +   ++++++YL +       +FD+L WWKLN  KY  LSK+A D   + +S  +S  S FS  TG R+LD +RSS  P+ VEAL+C ++W+
Subjt:  QVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAAS-KSAFS--TGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

P03010 Putative AC9 transposase1.0e-1848.81Show/hide
Query:  NDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        N++D+Y+S+P  + + QFD+L+WW+   A+Y IL++IA D   + VST AS+SAFS GGR++D +R+ L  + VEALICT++W+
Subjt:  NDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

P08770 Putative AC transposase1.0e-1848.81Show/hide
Query:  NDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        N++D+Y+S+P  + + QFD+L+WW+   A+Y IL++IA D   + VST AS+SAFS GGR++D +R+ L  + VEALICT++W+
Subjt:  NDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 21.1e-1237.5Show/hide
Query:  QVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAAS-KSAFS--TGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        ++  +   ++++++YL +       +FD+L WWKLN  K+  LS++A D   + +S  +S  S FS  TG R+LD +RSSL P+ VEAL+C ++W+
Subjt:  QVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAAS-KSAFS--TGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

Q9M2N5 Zinc finger BED domain-containing protein DAYSLEEPER2.9e-1343.02Show/hide
Query:  LRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        L++++D+YL +       +FDVL WWK N  KY  LSK+A D   + VS AA    F    R +D +++SL P+TVEALIC + W+
Subjt:  LRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain4.9e-0829.9Show/hide
Query:  KRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        +RKR+   +  + +++ +YLS+    +  Q DVL WWK+N  +Y  LS +A D   V  ++AA +  F   G  +D  +  +   + +++IC ++WI
Subjt:  KRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain2.0e-1443.02Show/hide
Query:  LRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI
        L++++D+YL +       +FDVL WWK N  KY  LSK+A D   + VS AA    F    R +D +++SL P+TVEALIC + W+
Subjt:  LRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALDSFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGATTGTACAATTTTTACAAATCACAAGTTGATGACTCTGTCTTTCGCAATGATTTGCGTGGTCAAGATGTTGTTTGTGAACAAGTAGAATCAAGTGATAATTTGAG
ACTATTGAGTTCGAGAGCTACAGTGGAAACTGACGCGTGTTGTAGAGTATTATCACGCTACAAGAGAAAAAGACAAGTACAAAATACTTTAGAATTGAGGAATGATGTTG
ATCGGTATTTATCTGACCCTTGTGAGGAGTTAAATGATCAGTTTGATGTTCTAACTTGGTGGAAATTGAATGGGGCTAAATACCGAATTCTATCAAAAATTGCTCTAGAT
AGTTTTGTCGTTCTGGTGTCTACTGCGGCTTCTAAATCTGCATTCAGTACTGGAGGAAGGATTTTGGATTCTTTTAGGAGTTCTTTATCACCTAAAACAGTGGAAGCTTT
GATTTGTACACAAAACTGGATTTGTGGCAAAACAACCTTATTGGATCTTTGTCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGATTGTACAATTTTTACAAATCACAAGTTGATGACTCTGTCTTTCGCAATGATTTGCGTGGTCAAGATGTTGTTTGTGAACAAGTAGAATCAAGTGATAATTTGAG
ACTATTGAGTTCGAGAGCTACAGTGGAAACTGACGCGTGTTGTAGAGTATTATCACGCTACAAGAGAAAAAGACAAGTACAAAATACTTTAGAATTGAGGAATGATGTTG
ATCGGTATTTATCTGACCCTTGTGAGGAGTTAAATGATCAGTTTGATGTTCTAACTTGGTGGAAATTGAATGGGGCTAAATACCGAATTCTATCAAAAATTGCTCTAGAT
AGTTTTGTCGTTCTGGTGTCTACTGCGGCTTCTAAATCTGCATTCAGTACTGGAGGAAGGATTTTGGATTCTTTTAGGAGTTCTTTATCACCTAAAACAGTGGAAGCTTT
GATTTGTACACAAAACTGGATTTGTGGCAAAACAACCTTATTGGATCTTTGTCCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRLYNFYKSQVDDSVFRNDLRGQDVVCEQVESSDNLRLLSSRATVETDACCRVLSRYKRKRQVQNTLELRNDVDRYLSDPCEELNDQFDVLTWWKLNGAKYRILSKIALD
SFVVLVSTAASKSAFSTGGRILDSFRSSLSPKTVEALICTQNWICGKTTLLDLCP