; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G015590 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G015590
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionCoiled-coil domain-containing protein 86
Genome locationGy14Chr5:21733108..21733917
RNA-Seq ExpressionCsGy5G015590
SyntenyCsGy5G015590
Gene Ontology termsGO:0005730 - nucleolus (cellular component)
InterPro domainsIPR005579 - Cgr1-like
IPR026570 - Coiled-coil domain-containing protein 86


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143761.1 protein PXR1 [Cucumis sativus]7.77e-122100Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_008465532.1 PREDICTED: protein PXR1 [Cucumis melo]3.03e-11998.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_022939634.1 protein PXR1 [Cucurbita moschata]2.97e-10589.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SLPP   KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_022992739.1 protein PXR1 [Cucurbita maxima]4.21e-10589.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SLPP   KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_038874831.1 protein PXR1 [Benincasa hispida]8.61e-11294.76Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSL ITESENADT MEIDDSLPPP +KRSAIPSSENPDKPT+ NPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQK IKAAF+ERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNG5 Coiled-coil domain-containing protein 863.76e-122100Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A1S3CP36 Coiled-coil domain-containing protein 861.47e-11998.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A5D3BKZ5 Coiled-coil domain-containing protein 861.47e-11998.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A6J1FHS9 Coiled-coil domain-containing protein 861.44e-10589.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SLPP   KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A6J1JYC3 Coiled-coil domain-containing protein 862.04e-10589.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SLPP   KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G31410.1 unknown protein5.4e-5162.69Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKP---TYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSA
        MACT+DFR LDEGFGGKTYKRKRE  E++    E+   +  M+ID +  PP AKRSA+ SSENPDKP       PTYDGVI GKVSGR WKQ R HR+S 
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKP---TYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSA

Query:  MQVSRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKS-KQKKLLKVVPEDYI
          V  +    EE +RQ+ IK A+KER  ELKE+IR NKVEKRKK+EEREK+KKEN+LR+GTKLQKITNPKTLKKI+ S KQ+K LK +P++ +
Subjt:  MQVSRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKS-KQKKLLKVVPEDYI

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTGCACAATCGACTTCCGCCGCCTGGATGAGGGCTTTGGTGGAAAAACCTATAAGAGAAAGCGTGAAGAAGCTGAGAAAAGCCTCATCATCACTGAATCTGAAAA
TGCCGACACCGGAATGGAGATTGACGACTCACTTCCACCACCACCTGCCAAGCGATCCGCTATTCCTTCGTCGGAAAATCCTGATAAACCGACTTACGGAAACCCCACGT
ACGACGGCGTGATCGGGGGAAAAGTCTCCGGACGGAAGTGGAAACAGGCGCGGAAGCACAGGACGTCGGCTATGCAGGTGAGCCGTAAAGGCACGACGTTCGAGGAGAGG
GAGAGGCAGAAGATGATTAAGGCGGCGTTTAAGGAACGGAAGGAGGAATTGAAGGAGCAGATTAGGTTAAATAAGGTGGAGAAGAGAAAGAAGAGGGAGGAGAGAGAGAA
GAAGAAGAAGGAAAACATATTGAGATCTGGAACTAAGCTACAAAAGATTACAAATCCCAAAACGCTGAAGAAGATTGCTAAGTCTAAGCAAAAGAAGCTCCTCAAGGTTG
TTCCTGAGGATTACATCAAAAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTCAGCAGCTTCAAGCTCTGAAACCCTAATCCCCAAATCTCTTCCATGGCGTGCACAATCGACTTCCGCCGCCTGGATGAGGGCTTTGGTGGAAAAACCTATAAGAGA
AAGCGTGAAGAAGCTGAGAAAAGCCTCATCATCACTGAATCTGAAAATGCCGACACCGGAATGGAGATTGACGACTCACTTCCACCACCACCTGCCAAGCGATCCGCTAT
TCCTTCGTCGGAAAATCCTGATAAACCGACTTACGGAAACCCCACGTACGACGGCGTGATCGGGGGAAAAGTCTCCGGACGGAAGTGGAAACAGGCGCGGAAGCACAGGA
CGTCGGCTATGCAGGTGAGCCGTAAAGGCACGACGTTCGAGGAGAGGGAGAGGCAGAAGATGATTAAGGCGGCGTTTAAGGAACGGAAGGAGGAATTGAAGGAGCAGATT
AGGTTAAATAAGGTGGAGAAGAGAAAGAAGAGGGAGGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGGAAAACATATTGAGATCTGGAACTAAGCTACAAAAGATTACAAATCCCAAAAC
GCTGAAGAAGATTGCTAAGTCTAAGCAAAAGAAGCTCCTCAAGGTTGTTCCTGAGGATTACATCAAAAAATAGGTCCGTCGCTTTTGTTCTAAGGTTTTCCCACCATCTT
TAAATAGATTTATCAGTTTTGAATCTTGGAATTTTGACTGTAATCATAAAAATGTTAGCATAACAATATTAAAAATTTTGATTAAACATCTTATTCCGATCATTTATAAG
GCACAGCGATGGTACGTAATCTTAATGTTCGATGTTTCCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQVSRKGTTFEER
ERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK