CuGenDBv2

Gene ID	CsGy5G018890
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23
Genome location	Gy14Chr5:25294644..25299373
RNA-Seq Expression	CsGy5G018890
Synteny	CsGy5G018890
Gene Ontology terms	GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domains	IPR021629 - Mediator complex, subunit Med23

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7016782.1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

0.0

95.93

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQ QRSSS+T VSTSRAYQFHPARAAI NLFDLYLGRSNRLK EDSAREPPNKAQKRV+AINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQF+D+DQL AVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPT-VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVS+GQGSQAAPT VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSP
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPT-VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP

Query:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKA
        AQSSIDP+SCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQG+EESENMKSWRPDKA
Subjt:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKA

Query:  LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSP
        LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLH PTFGTQRIFSQTMQNISGEAVAS R+SP
Subjt:  LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSP

Query:  ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSP+WWKRVLLVAPGYRS AQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

TYK30505.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]

0.0

98.44

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSI YINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL

Query:  PFIQRLSHDILYES
         FIQRLS  ILYE 
Subjt:  PFIQRLSHDILYES

XP_008467111.1 PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1 [Cucumis melo]

0.0

99.19

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSI YINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

XP_011655454.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 [Cucumis sativus]

0.0

100

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

XP_038875594.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 [Benincasa hispida]

0.0

97.96

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLK EDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQF+DHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSS+SSAEVS+GQGSQAA TVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASP P VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRS AQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KUT7 Uncharacterized protein

0.0

100

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL

Query:  PFIQRLSHDILYE
        PFIQRLSHDILYE
Subjt:  PFIQRLSHDILYE

A0A1S3CSR7 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1

0.0

99.19

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSI YINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

A0A5A7TSF1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1

0.0

99.19

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSI YINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

A0A5D3E5C4 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 isoform X1

0.0

98.44

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQRSSSLT VSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSI YINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP VHGISSPA
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPA

Query:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
        QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL
Subjt:  QSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKAL

Query:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
        IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI
Subjt:  IEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPI

Query:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
        TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL
Subjt:  TYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVIL

Query:  PFIQRLSHDILYES
         FIQRLS  ILYE 
Subjt:  PFIQRLSHDILYES

A0A6J1I8Y2 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23

0.0

95.73

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQ QRSSS+T VSTSRAYQFHPARAAI NLFDLYLGRSNRLK EDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQF+D+DQL AVTESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPT-VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP
        LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVS+GQGSQAAPT VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLP +HGISSP
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPT-VSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP

Query:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKA
        AQSSIDP+SCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVT ADIFSHMLNWMVNWDQRQQG+EESENMKSWRPDKA
Subjt:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKA

Query:  LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSP
        LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTL+LEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLH PTFGTQRIFSQTMQNISGEAVAS R+SP
Subjt:  LIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSP

Query:  ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSP+WWKRVLLVAPGYRS AQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
Subjt:  ITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

F4I4P3 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23

2.5e-172

63.96

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQR+ +  T S+SR+YQFHPARAAI++LF+LYLGR +R K ++S R+PPNK+QKRV A NR+LPPRNEQFLLDFE +Q+QF+D +QLR +TESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP
        LVVQCS H PRAEFLLFALR+LC I YINWDTFLPSLLSS+S+AE S+ QG Q AA T  ++  S   V+P            S NP S LP  HGI SP
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP

Query:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP
        + S +        S      ++  G     +A+R +  +R  A++SLRQL CKIIL G++  LKPVTHA+IF +M+NW+VNWD+R  G E+S   KSWR 
Subjt:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP

Query:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR
        +K L EWL SCLDV+WLLVEE + R+PFYELLRSGLQFI+NIPDDEALFTL++EIHRRRD MAMHM MLDQHLH P+FGT RI SQ   N+  EAV  LR
Subjt:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR

Query:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYN
        +SPITYPSVLGEPL+GED+A +I +G+ DWERA+RCIRHA+RTTPSPDWWKRVL+VAP YR S Q G  PGAVFTS+MICEA IDRI ELLKLTNSGN  
Subjt:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYN

Query:  FFVIL
        F + L
Subjt:  FFVIL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G23230.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mediator complex subunit Med23 (InterPro:IPR021629); Has 187 Blast hits to 184 proteins in 67 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 135; Fungi - 0; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink).

1.8e-173

63.96

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQR+ +  T S+SR+YQFHPARAAI++LF+LYLGR +R K ++S R+PPNK+QKRV A NR+LPPRNEQFLLDFE +Q+QF+D +QLR +TESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP
        LVVQCS H PRAEFLLFALR+LC I YINWDTFLPSLLSS+S+AE S+ QG Q AA T  ++  S   V+P            S NP S LP  HGI SP
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP

Query:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP
        + S +        S      ++  G     +A+R +  +R  A++SLRQL CKIIL G++  LKPVTHA+IF +M+NW+VNWD+R  G E+S   KSWR 
Subjt:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP

Query:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR
        +K L EWL SCLDV+WLLVEE + R+PFYELLRSGLQFI+NIPDDEALFTL++EIHRRRD MAMHM MLDQHLH P+FGT RI SQ   N+  EAV  LR
Subjt:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR

Query:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYN
        +SPITYPSVLGEPL+GED+A +I +G+ DWERA+RCIRHA+RTTPSPDWWKRVL+VAP YR S Q G  PGAVFTS+MICEA IDRI ELLKLTNSGN  
Subjt:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYN

Query:  FFVIL
        F + L
Subjt:  FFVIL

AT1G23230.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to salt stress; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mediator complex subunit Med23 (InterPro:IPR021629).

3.4e-172

64.31

Show/hide

Query:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS
        MDQSQR+ +  T S+SR+YQFHPARAAI++LF+LYLGR +R K ++S R+PPNK+QKRV A NR+LPPRNEQFLLDFE +Q+QF+D +QLR +TESVLIS
Subjt:  MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLIS

Query:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP
        LVVQCS H PRAEFLLFALR+LC I YINWDTFLPSLLSS+S+AE S+ QG Q AA T  ++  S   V+P            S NP S LP  HGI SP
Subjt:  LVVQCSGHVPRAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQ-AAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSP

Query:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP
        + S +        S      ++  G     +A+R +  +R  A++SLRQL CKIIL G++  LKPVTHA+IF +M+NW+VNWD+R  G E+S   KSWR 
Subjt:  AQSSIDPSSCTALSPIKSSDLSGTG---LPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRP

Query:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR
        +K L EWL SCLDV+WLLVEE + R+PFYELLRSGLQFI+NIPDDEALFTL++EIHRRRD MAMHM MLDQHLH P+FGT RI SQ   N+  EAV  LR
Subjt:  DKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRSGLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLR

Query:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS
        +SPITYPSVLGEPL+GED+A +I +G+ DWERA+RCIRHA+RTTPSPDWWKRVL+VAP YR S Q G  PGAVFTS+MICEA IDRI ELLKLTNS
Subjt:  YSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTTPSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQ-GLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGATCAATCACAACGATCCTCATCACTAACGACAGTCTCCACTTCCCGTGCTTACCAGTTCCACCCAGCTCGAGCTGCCATTGTCAATCTCTTCGACCTCTACTTAGG
AAGGAGTAATCGTCTAAAGCATGAAGATTCAGCTAGAGAACCTCCGAACAAGGCTCAAAAGCGTGTACTAGCTATTAACAGAGAGCTTCCTCCTCGAAATGAGCAATTCC
TTTTAGATTTTGAGCAAATTCAGAATCAATTTTCAGACCATGATCAGTTGCGTGCTGTGACTGAGTCTGTTCTCATCTCCCTAGTTGTGCAGTGCAGTGGTCATGTACCA
AGGGCAGAATTTCTTCTCTTTGCTTTACGGAGTTTATGCAGTATAGGTTACATCAATTGGGACACTTTTCTGCCATCCCTTCTTTCTTCAATCTCATCTGCAGAAGTTTC
CATGGGTCAGGGAAGTCAAGCTGCGCCTACTGTCTCAACAACAAATTTATCACAGTCTGGGGTGCTTCCATCCTCAAATCCAGTGCCTAATAGTTCTACCTTTCAGTCTT
CCAATCCTGCCTCTCCATTACCATTGGTTCATGGAATCAGTTCACCCGCTCAGTCTAGTATTGATCCATCTTCTTGCACAGCATTGTCACCAATCAAATCCTCTGATCTT
TCTGGGACTGGATTGCCATCTGCAGTTAGGGTCAATTCATTTTTGAGAAATAATGCAATAAGCAGTCTTCGTCAGCTTTGTTGCAAGATTATCTTAAGTGGTCTTAAATT
TGATTTAAAACCAGTGACTCATGCTGATATCTTTTCCCACATGCTCAATTGGATGGTTAATTGGGACCAACGGCAACAGGGGATGGAGGAATCTGAGAATATGAAATCCT
GGAGGCCTGACAAGGCTCTCATTGAATGGCTACATAGCTGTTTGGATGTAGTCTGGCTTTTGGTTGAGGAGAATAAATGTCGGGTGCCCTTCTATGAATTACTACGCAGT
GGTTTGCAATTCATTGATAACATTCCTGATGATGAAGCCTTATTTACACTCATGTTGGAGATCCATAGGAGGCGAGATATGATGGCAATGCACATGCAGATGTTGGATCA
ACACCTTCACAGCCCTACATTTGGCACTCAACGGATTTTTTCTCAAACAATGCAGAACATATCTGGTGAAGCAGTAGCAAGCTTGCGCTATTCACCAATCACATACCCAA
GTGTTCTTGGTGAACCTCTTCATGGCGAGGATATTGCATCTGCTATTCAGAGAGGAACTCGAGATTGGGAAAGAGCTATGCGTTGTATAAGGCACGCTCTTCGCACAACT
CCATCACCGGACTGGTGGAAGCGTGTGCTTCTTGTGGCTCCTGGCTATAGGTCTTCTGCACAAGGACTCAGTCCTGGTGCAGTTTTTACATCCGAGATGATATGTGAGGC
GACAATTGATAGAATATTTGAGCTTTTGAAGTTGACGAATTCAGGCAACTACAATTTCTTTGTTATTCTTCCTTTTATCCAGCGACTTAGTCATGATATTCTTTATGAAA
GTTGGTTTCTTGTAAAGAAAAATGTTAGATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAGACGAACACTGCCAAATTCCGAGTTCTTCAGTTCGTTGATTCCGGTTTCAAGTCCTGTGATTCTTCCTGAAATTCCAAGAGCTCGAGCTGTTGGAACTGGGAATGAG
AAGATGGATCAATCACAACGATCCTCATCACTAACGACAGTCTCCACTTCCCGTGCTTACCAGTTCCACCCAGCTCGAGCTGCCATTGTCAATCTCTTCGACCTCTACTT
AGGAAGGAGTAATCGTCTAAAGCATGAAGATTCAGCTAGAGAACCTCCGAACAAGGCTCAAAAGCGTGTACTAGCTATTAACAGAGAGCTTCCTCCTCGAAATGAGCAAT
TCCTTTTAGATTTTGAGCAAATTCAGAATCAATTTTCAGACCATGATCAGTTGCGTGCTGTGACTGAGTCTGTTCTCATCTCCCTAGTTGTGCAGTGCAGTGGTCATGTA
CCAAGGGCAGAATTTCTTCTCTTTGCTTTACGGAGTTTATGCAGTATAGGTTACATCAATTGGGACACTTTTCTGCCATCCCTTCTTTCTTCAATCTCATCTGCAGAAGT
TTCCATGGGTCAGGGAAGTCAAGCTGCGCCTACTGTCTCAACAACAAATTTATCACAGTCTGGGGTGCTTCCATCCTCAAATCCAGTGCCTAATAGTTCTACCTTTCAGT
CTTCCAATCCTGCCTCTCCATTACCATTGGTTCATGGAATCAGTTCACCCGCTCAGTCTAGTATTGATCCATCTTCTTGCACAGCATTGTCACCAATCAAATCCTCTGAT
CTTTCTGGGACTGGATTGCCATCTGCAGTTAGGGTCAATTCATTTTTGAGAAATAATGCAATAAGCAGTCTTCGTCAGCTTTGTTGCAAGATTATCTTAAGTGGTCTTAA
ATTTGATTTAAAACCAGTGACTCATGCTGATATCTTTTCCCACATGCTCAATTGGATGGTTAATTGGGACCAACGGCAACAGGGGATGGAGGAATCTGAGAATATGAAAT
CCTGGAGGCCTGACAAGGCTCTCATTGAATGGCTACATAGCTGTTTGGATGTAGTCTGGCTTTTGGTTGAGGAGAATAAATGTCGGGTGCCCTTCTATGAATTACTACGC
AGTGGTTTGCAATTCATTGATAACATTCCTGATGATGAAGCCTTATTTACACTCATGTTGGAGATCCATAGGAGGCGAGATATGATGGCAATGCACATGCAGATGTTGGA
TCAACACCTTCACAGCCCTACATTTGGCACTCAACGGATTTTTTCTCAAACAATGCAGAACATATCTGGTGAAGCAGTAGCAAGCTTGCGCTATTCACCAATCACATACC
CAAGTGTTCTTGGTGAACCTCTTCATGGCGAGGATATTGCATCTGCTATTCAGAGAGGAACTCGAGATTGGGAAAGAGCTATGCGTTGTATAAGGCACGCTCTTCGCACA
ACTCCATCACCGGACTGGTGGAAGCGTGTGCTTCTTGTGGCTCCTGGCTATAGGTCTTCTGCACAAGGACTCAGTCCTGGTGCAGTTTTTACATCCGAGATGATATGTGA
GGCGACAATTGATAGAATATTTGAGCTTTTGAAGTTGACGAATTCAGGCAACTACAATTTCTTTGTTATTCTTCCTTTTATCCAGCGACTTAGTCATGATATTCTTTATG
AAAGTTGGTTTCTTGTAAAGAAAAATGTTAGATGAGATAATAGTAAATCGACGTTCACCTCTAAACTTAAACTTGGTTAATCAATAATCTAACATGGTATCAGAACAAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDQSQRSSSLTTVSTSRAYQFHPARAAIVNLFDLYLGRSNRLKHEDSAREPPNKAQKRVLAINRELPPRNEQFLLDFEQIQNQFSDHDQLRAVTESVLISLVVQCSGHVP
RAEFLLFALRSLCSIGYINWDTFLPSLLSSISSAEVSMGQGSQAAPTVSTTNLSQSGVLPSSNPVPNSSTFQSSNPASPLPLVHGISSPAQSSIDPSSCTALSPIKSSDL
SGTGLPSAVRVNSFLRNNAISSLRQLCCKIILSGLKFDLKPVTHADIFSHMLNWMVNWDQRQQGMEESENMKSWRPDKALIEWLHSCLDVVWLLVEENKCRVPFYELLRS
GLQFIDNIPDDEALFTLMLEIHRRRDMMAMHMQMLDQHLHSPTFGTQRIFSQTMQNISGEAVASLRYSPITYPSVLGEPLHGEDIASAIQRGTRDWERAMRCIRHALRTT
PSPDWWKRVLLVAPGYRSSAQGLSPGAVFTSEMICEATIDRIFELLKLTNSGNYNFFVILPFIQRLSHDILYESWFLVKKNVR

CsGy5G018890 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome