; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy5G028270 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy5G028270
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationGy14Chr5:31953351..31953629
RNA-Seq ExpressionCsGy5G028270
SyntenyCsGy5G028270
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]1.46e-5997.83Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]4.54e-5491.3Show/hide
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XP_022989831.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita maxima]4.93e-5493.48Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]2.73e-5591.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor3.76e-61100Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 27.07e-6097.83Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 27.07e-6097.83Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like2.20e-5491.3Show/hide
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A0A6J1JL94 mini zinc finger protein 2-like2.39e-5493.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 19.4e-2273.44Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 37.7e-2464.04Show/hide
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        M+KRQVV+++ + S   + +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 19.4e-2273.44Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.4e-2558.76Show/hide
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        M+KRQ+V+++   +S          S +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 25.7e-3579.17Show/hide
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        MRKRQVVLRR+  EE SR  S ASS TVR+VRYGECQKNHAA VGGYAVDGCREFMAS G+EGT A LTCAACGCHR+FHRR++ TEVVCDC+S P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger5.5e-2564.04Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.0e-2658.76Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 244.2e-1767.31Show/hide
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        RY ECQKNHAA  GG+ VDGC EFM+SG+EGT   L CAAC CHR+FHR+++
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AT3G28917.1 mini zinc finger 24.0e-3679.17Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 222.5e-1767.31Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAATCCTCAAGGGATTCTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
CGCTGCCGGTGTCGGAGGGTACGCCGTTGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGA
ATTTCCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAATCCTCAAGGGATTCTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
CGCTGCCGGTGTCGGAGGGTACGCCGTTGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGA
ATTTCCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEESSRDSVASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTTAGLTCAACGCHRNFHRRQVGTEVVCDCSSSP