; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G003590 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G003590
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationGy14Chr6:3318052..3319147
RNA-Seq ExpressionCsGy6G003590
SyntenyCsGy6G003590
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]3.47e-175100Show/hide
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XP_008445737.1 PREDICTED: tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis melo]1.09e-15993.85Show/hide
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XP_022953248.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]3.77e-13278.85Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.04e-13278.71Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]1.91e-15188.85Show/hide
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        LTNALRGT+LM NIL+HPAF E+AIEEKGEEK+AG  ENGGLKKGLKSITER+FKRDYSF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein1.68e-175100Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic5.29e-16093.85Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein5.29e-16093.85Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like1.82e-13278.85Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like3.72e-13177.95Show/hide
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        LLIALAG+ A KRGYVYFSEVQFI++++LKAIDDLWQK+SDGKFGY VQKR+FEKVN+DFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTE+TPEG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf531.8e-1731.02Show/hide
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        L+PT           + A S +     G FS     +        ++ L+ LL A +F +A++ T+++L+ LAGE + +R ++YF++V  I  + +  ++
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Query:  DLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNH
         LW+ +S G FG+S+QKRI+  VNK++ K + K+GW+           +  +P EF+W +  + P GHLPL N LRG  ++  I ++
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P51202 Uncharacterized protein ycf532.0e-2137.09Show/hide
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        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG     R ++YF++++ I  EDL+ ID LW  HS GKFG+ VQ++I+  + K++ + + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNHPAF
           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG +++S + +H A+
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P72583 Ycf53-like protein1.8e-2540.99Show/hide
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        G F L S  +  I +  L   LG++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   A DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ+R++    K+FTKL+
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Query:  MKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNHPAFGE
         K+GW            +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG R+  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf537.4e-2439.07Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  +AD+ T++ LI LAG  A  R ++YF++++ I A+DL+ ID LW  HS GKFG  VQ++I+  V KD+ K + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNHPAF
           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG +++S +  H A+
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic4.3e-5650.57Show/hide
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        HS PS  H     HR NL   S    ++L LK PTS+   +   + ++ +SS +A +A S + +S T+  +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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        ++GE A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL ++TP GHLPL
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Query:  TNALRGTRLMSNILNHPAFGEEAIEEKGEEK------IAGVVENGGLKKGLKSITERLFKRDYSF
        TNALRGT+L+  +L+HPAF   A +  GE +      +A   E  G+        +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding3.1e-5750.57Show/hide
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        HS PS  H     HR NL   S    ++L LK PTS+   +   + ++ +SS +A +A S + +S T+  +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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Query:  LAGEGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPL
        ++GE A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL ++TP GHLPL
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Query:  TNALRGTRLMSNILNHPAFGEEAIEEKGEEK------IAGVVENGGLKKGLKSITERLFKRDYSF
        TNALRGT+L+  +L+HPAF   A +  GE +      +A   E  G+        +R+FK +YSF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAACTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGTCACTCTCTCCGCCATCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACC
AACTTCCTCCACCGCTGTCACCACCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCA
TCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGGCGCCAAAGACTTTCGGCAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGAAGGCGCCCTGAAAAGA
GGGTACGTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATCTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAA
ACGGATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGTTGGATGAAGAAGCTGGATACGGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCGA
CGGAGTTTATTTGGGAGCTGACGGAGGACACGCCTGAAGGGCATCTGCCATTAACTAATGCTTTGAGAGGGACACGGTTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCATTT
GGGGAGGAGGCCATTGAAGAGAAAGGTGAAGAAAAAATTGCAGGGGTGGTTGAAAATGGAGGATTGAAGAAAGGATTGAAATCGATCACTGAGAGGCTTTTCAAAAGAGA
TTATAGCTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAACCTCTCTTTTTCACATTTTCAATTTTCATTAACTCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCCCATGGCAACTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGTCACTCTCTCCGC
CATCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACCAACTTCCTCCACCGCTGTCACCACCACCACCACCACTACCGCCGC
CACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGGCGCCAAAGACTTTC
GGCAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGAAGGCGCCCTGAAAAGAGGGTACGTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGAT
CTGAAAGCCATTGACGATCTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACGGATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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