CuGenDBv2

Gene ID	CsGy6G014453
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Transmembrane protein
Genome location	Gy14Chr6:12728755..12731634
RNA-Seq Expression	CsGy6G014453
Synteny	CsGy6G014453
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008448398.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490597 [Cucumis melo]

9.41e-186

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XP_011657164.1 uncharacterized protein LOC101220684 [Cucumis sativus]

4.64e-202

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XP_022148495.1 uncharacterized protein LOC111017117 [Momordica charantia]

1.04e-140

74.59

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        LASSP S
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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.31e-137

75.16

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        PLFESSTD DL+RL+SSPPPKF+FLREAEEKLYR+LMEE+QKK  KN GS+Q+ E  A+S P  A ++E+              H+VS YSSSSSQ+LPL
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        ASSP S
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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]

7.83e-158

81.88

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Query:  ASSPSSEHI
        AS P SEHI
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein

2.25e-202

100

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A0A1S3BJ04 uncharacterized protein LOC103490597

4.56e-186

93.92

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A0A5A7V7S7 Uncharacterized protein

4.56e-186

93.92

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        PLFESS DLDLSRLLSSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQ K NKN GSVQSSEIRA+SIPKEAV+EE+ HHVSPYSSSSSQVLPLASSPSSEHI
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A0A6J1D323 uncharacterized protein LOC111017117

5.02e-141

74.59

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        + SFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKK S +S   +DEFTNYAKEFFHLICW     SSSS       QPN+SR N+ N +LRNQE D+EIG 
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Query:  LASSPSS
        LASSP S
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1

8.46e-137

74.84

Show/hide

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        M SFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRS  +S VEDEFT+YAKEFFHLICW       SSSSSSS+Q  NS R    N E+RNQE DIEIG 
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Query:  SKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLMPTTSPLNPLSSFKHHGFNIN
        SKDLLLKSSGGEDG VELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLIL +DTPFLTPLPSPP     +P +P SSFKHHGFNIN
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Query:  PLFESSTDLDLSRLLSSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQKKPNKNDGSVQSSEIRAMSIPKEAVQEED--------------HHVSPYSSSSSQVLPL
        PLFESSTD DL+RL+SSPPPKF+FLREAEEKLYR+LMEE+QKK  KN GS+Q+ E  A+S P  A ++E+              H+VS YSSSSSQ+LPL
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Query:  ASSPSS
        ASSP S
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein

2.2e-27

40.53

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Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSIT--SSHVEDEFTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNSSRENQRNLELRNQESDIEI
        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS T       D  T   +E   + C +     SSSS SSS        + Q+   L N       
Subjt:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSIT--SSHVEDEFTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNSSRENQRNLELRNQESDIEI

Query:  GCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLMPTTSPLNPL
                        G E       N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L   T PL PL
Subjt:  GCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLMPTTSPLNPL

Query:  --SSFKHHGFNINPLFESSTDLDLSRLL------------SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEE
           S       I+ LFESS+D + +RL+            SSP  +FKFLR+AEEKLY+K + E
Subjt:  --SSFKHHGFNINPLFESSTDLDLSRLL------------SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEE

AT5G59350.1 unknown protein

4.6e-41

45.15

Show/hide

Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWK--KRSITSSHVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNSSRENQRNLELRNQ
        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL  K  K+ + S   E+E         YAKE   L C+             SLQQ N  RE + ++   + 
Subjt:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWK--KRSITSSHVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNSSRENQRNLELRNQ

Query:  ESDIEIGCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLMPTTSPLNP
          D+E+G     L+K   G D G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP         +P
Subjt:  ESDIEIGCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLMPTTSPLNP

Query:  LSSFKHHGFNINPLFESSTDLDLSRLL---SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQKKPNK--NDGSVQSSEIRAMS-IPKEAVQEEDHHVSPYSSSSS
        L S+ HHGF  NPLFES  +L+ ++     SSPPPKFKF+R+AEEKL ++L+EEA+++      +GS       AM+   K+++QE D  VS   SSSS
Subjt:  LSSFKHHGFNINPLFESSTDLDLSRLL---SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQKKPNK--NDGSVQSSEIRAMS-IPKEAVQEEDHHVSPYSSSSS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGACTTCTTTTAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTATTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGCTATGGTGGAAGAAAAGAAGTAT
AACTTCTTCACATGTTGAAGATGAATTCACCAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAAAGGGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGT
TACAACAACCCAACAGTTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAACTGAGGAATCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTGTAGTAAAGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGT
GGAGAAGATGGAGGAGTTGAGTTAGAGTTGATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCAAGGTTTCTTTTCACCATTAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAATCTGA
AGATAGAAGCAGAAAAGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATATTAACTGTTGATACTCCTTTTCTTACTCCTTTGCCTTCTCCTCCATTGATGCCAACAACAT
CTCCATTAAACCCTTTGAGTTCTTTCAAACACCATGGATTCAATATAAATCCTCTCTTTGAATCATCAACTGATTTGGATTTGAGTAGGCTCTTATCATCACCTCCCCCA
AAATTTAAGTTCTTAAGAGAGGCAGAAGAGAAATTGTACAGAAAATTAATGGAAGAAGCTCAGAAGAAGCCCAATAAAAATGATGGGTCAGTTCAAAGTTCTGAAATTAG
AGCCATGTCCATTCCTAAAGAAGCAGTTCAAGAAGAAGATCATCATGTCTCACCATATTCTTCAAGTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCATCTTCAGAGC
ACATATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCCATGTGAGCTGCCATCCAAGCAACTCCCACAAAATACAATCCCCAAACCCCAAATTTCATTTTTTTTAATTTCCTTATTCTTCACCTTCCCTTTCTTAATTTAATCAC
TTGTTCATCATTTTGGATTCTTTCTTATTTTAAAATTTTACAATTTGGGTTGCATCTCTTGATTGTGGCTGCTCCTTCATTATCTTTCCTTTCTAAAGGCCTCAATTTAC
AGATTCTCTTAAGTGATTTGAGTTCTTGTTTGGGGGATTTCAACGATTTCTGTTCATGGAGTTTTGGAATTTGGATTGTGGAGTGGGGGGTTTTGGTAATTAATTAATGG
TAGAGATTTGAGATTGTTCCCAATTCAAAGGGGAATGACTTCTTTTAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTATTTGCTCTTGTTGCTGAGC
TTTACTATTTGCTATGGTGGAAGAAAAGAAGTATAACTTCTTCACATGTTGAAGATGAATTCACCAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAA
AAGGGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTTACAACAACCCAACAGTTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAACTGAGGAATCAAGAATCTGACATTGAAATTGG
TTGTAGTAAAGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGTGGAGAAGATGGAGGAGTTGAGTTAGAGTTGATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCAAGGTTTCTTTTCACCA
TTAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAATCTGAAGATAGAAGCAGAAAAGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATATTAACTGTTGATACTCCTTTTCTTACT
CCTTTGCCTTCTCCTCCATTGATGCCAACAACATCTCCATTAAACCCTTTGAGTTCTTTCAAACACCATGGATTCAATATAAATCCTCTCTTTGAATCATCAACTGATTT
GGATTTGAGTAGGCTCTTATCATCACCTCCCCCAAAATTTAAGTTCTTAAGAGAGGCAGAAGAGAAATTGTACAGAAAATTAATGGAAGAAGCTCAGAAGAAGCCCAATA
AAAATGATGGGTCAGTTCAAAGTTCTGAAATTAGAGCCATGTCCATTCCTAAAGAAGCAGTTCAAGAAGAAGATCATCATGTCTCACCATATTCTTCAAGTTCTTCACAG
GTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCATCTTCAGAGCACATATAGATTTGATAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATTAGATAGGTGTTTATGATTCAATTGATATT
TCAGCTTTTGAGTTGATTTGCATTATGTATCAAAATGCAAACAACTTTCTCACTTTGGGTTTGATTCAACGAGTTAATTAATTTAACTTTTTTTAAAATTCCTTTTTCTT
TTCAAATTCCATTGAAATGTTGTCCAAGCATGGATGAAATTTGGAAATTTGGAAATCTGACACTCTTCCATTAGTGGACAAAAGCCAATTATTACATTGTCTTCATGAAC
AGCCAAAGATAATAACAAATTCATTTGATAGATGTGTTGATCTGTTCTTTTACCATTGGAATTTTTGTCAGATTATGAATGCAATTTGTTAAATTAACTGTTCTTCCCAT
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Protein sequence

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CsGy6G014453 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome