; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G015630 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G015630
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X1
Genome locationGy14Chr6:14649300..14651437
RNA-Seq ExpressionCsGy6G015630
SyntenyCsGy6G015630
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010734 - Copine, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025200.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.82e-4592.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

KAE8647047.1 hypothetical protein Csa_022918 [Cucumis sativus]1.22e-63100Show/hide
Query:  MSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTSLLFYSNFVIHDNITLLY
        MSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTSLLFYSNFVIHDNITLLY
Subjt:  MSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTSLLFYSNFVIHDNITLLY

Query:  LVSL
        LVSL
Subjt:  LVSL

TYK07466.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.76e-4592.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

XP_008462648.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X2 [Cucumis melo]3.33e-4492.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

XP_031743945.1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG3 isoform X1 [Cucumis sativus]4.71e-4897.73Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVANQILEN+KAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CHE4 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X21.61e-4492.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

A0A1S3CHF5 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X12.44e-4492.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

A0A5A7SGD8 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X18.79e-4692.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

A0A5D3CAU1 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG1 isoform X18.54e-4692.05Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES +ASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRES+YGKSAGPLPPPPEVIN+DNAVA Q LE+AKAEKHSSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

A0A6J1KVY2 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG3-like isoform X22.59e-3885.23Show/hide
Query:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV
        FVNFTKIMSES E SKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSL  SKRESVY KSAGP+PPPPEVIN+DNAVANQ L  A AE+ SSSSESV
Subjt:  FVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LB88 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG54.2e-0739.77Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSES
        +FVNFT IMS++ + ++KEA FAL+ALMEIP QY+ATL L    + + +      LPPP          A Q + N+     S+S ++
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSES

Q8RX26 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG33.4e-1765.43Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK
        +FVNFTKIMSE  +A+KKEAAFALAALMEIPFQY+ATLSL N K      +   PLPPPPEVI  DNA   V NQ+ E A+
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK

Q9LY87 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG21.1e-0752.54Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP
        +FVNFT+IM+++   S KE  FAL+ALMEIP QY+AT+ L    R + Y     PLPPP
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP

Q9SAL0 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG42.9e-0840.66Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTS
        +FVNFT+IM+ ++  S KE AFALAALMEIPFQY+A + L    +++   K+  P PPP       NA        A  E+  S    +T+
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTS

Q9SS90 E3 ubiquitin-protein ligase RGLG11.2e-0650.85Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP
        +FVNFT+IMS++ + S+KE  FAL+ALMEIP QY+AT+ L      +       PLPPP
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G79380.1 Ca(2)-dependent phospholipid-binding protein (Copine) family2.1e-0940.66Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTS
        +FVNFT+IM+ ++  S KE AFALAALMEIPFQY+A + L    +++   K+  P PPP       NA        A  E+  S    +T+
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSSESVTS

AT5G14420.1 RING domain ligase27.8e-0952.54Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP
        +FVNFT+IM+++   S KE  FAL+ALMEIP QY+AT+ L    R + Y     PLPPP
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP

AT5G14420.3 RING domain ligase27.8e-0952.54Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP
        +FVNFT+IM+++   S KE  FAL+ALMEIP QY+AT+ L    R + Y     PLPPP
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPP

AT5G63970.1 Copine (Calcium-dependent phospholipid-binding protein) family2.4e-1865.43Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK
        +FVNFTKIMSE  +A+KKEAAFALAALMEIPFQY+ATLSL N K      +   PLPPPPEVI  DNA   V NQ+ E A+
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK

AT5G63970.2 Copine (Calcium-dependent phospholipid-binding protein) family2.4e-1865.43Show/hide
Query:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK
        +FVNFTKIMSE  +A+KKEAAFALAALMEIPFQY+ATLSL N K      +   PLPPPPEVI  DNA   V NQ+ E A+
Subjt:  KFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNA---VANQILENAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTTCAAGATGTGCGTTCGAAAACTTCAAAGAGCATGCTTAAAGAATCCTGTTAAGTTTGTAAACTTCACAAAGATCATGTCTGAGAGCACAGAAGCGTCA
AAGAAGGAAGCAGCATTTGCCTTGGCCGCACTCATGGAAATTCCATTTCAATACAGAGCTACCCTCTCCTTGCCAAATTCAAAGAGAGAATCTGTATATGGAAAA
AGTGCGGGGCCACTTCCTCCTCCTCCTGAAGTCATCAATTATGACAATGCAGTTGCAAACCAAATTTTGGAGAATGCAAAAGCTGAAAAACATAGTTCCTCATCT
GAATCGGTAACTTCGCTTTTATTTTATTCTAATTTTGTTATTCATGACAATATAACTTTGTTGTATTTAGTTTCTTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGTTCAAGATGTGCGTTCGAAAACTTCAAAGAGCATGCTTAAAGAATCCTGTTAAGTTTGTAAACTTCACAAAGATCATGTCTGAGAGCACAGAAGCGTCA
AAGAAGGAAGCAGCATTTGCCTTGGCCGCACTCATGGAAATTCCATTTCAATACAGAGCTACCCTCTCCTTGCCAAATTCAAAGAGAGAATCTGTATATGGAAAA
AGTGCGGGGCCACTTCCTCCTCCTCCTGAAGTCATCAATTATGACAATGCAGTTGCAAACCAAATTTTGGAGAATGCAAAAGCTGAAAAACATAGTTCCTCATCT
GAATCGGTAACTTCGCTTTTATTTTATTCTAATTTTGTTATTCATGACAATATAACTTTGTTGTATTTAGTTTCTTTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKFKMCVRKLQRACLKNPVKFVNFTKIMSESTEASKKEAAFALAALMEIPFQYRATLSLPNSKRESVYGKSAGPLPPPPEVINYDNAVANQILENAKAEKHSSSS
ESVTSLLFYSNFVIHDNITLLYLVSL