; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G017445 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G017445
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationGy14Chr6:18189031..18189638
RNA-Seq ExpressionCsGy6G017445
SyntenyCsGy6G017445
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058946.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.76e-3863.93Show/hide
Query:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
        M LLS NLPSN A H IP SLLSPP MPP T+PIVP+HPF  P PF+KT +HTW P   P  Q+EL RPIVPY+PYKF PPP RK A+PPP YH FPP  
Subjt:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA

Query:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP
        L    +KL+MS  R+A P PPP
Subjt:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP

KAA0058948.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]3.33e-5382.41Show/hide
Query:  MPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKP
        MP ITRPIVP+HPF FP PF+K FR HTWLPPP PP QQ+LERPIVPY+PYKFPPPPSRKQANPP SYHAFPPP L L  +KLYMSEVRRA PPPPP KP
Subjt:  MPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKP

Query:  YQWPKGKI
        YQWPKGKI
Subjt:  YQWPKGKI

KAE8647164.1 hypothetical protein Csa_018816, partial [Cucumis sativus]1.78e-8999.25Show/hide
Query:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
        MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
Subjt:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA

Query:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKI
        LLLL RKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKI
Subjt:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKI

TYK10982.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.01e-3763.93Show/hide
Query:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
        M LLS NLPSN A H IP SLLSPP MPP T+PIVP+HPF  P PF+KT +HTW P   P  Q+EL RPIVPY+PYKF PPP RK A+PPP YH FPP  
Subjt:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA

Query:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP
        L    +KL+MS  R+A P PPP
Subjt:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP

XP_008466986.1 PREDICTED: extensin-3-like, partial [Cucumis melo]6.53e-6181.25Show/hide
Query:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSR
        MES NPIFVFFLFII+ LLSLNLPSN A H IPSSLLSPP MP ITRPIVP+HPF FP PF+K FR HTWLPPP PP QQ+LERPIVPY+PYKFPPPPSR
Subjt:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSR

Query:  KQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSE
        KQANPP SYHAFPPP L L  +KLYMSE
Subjt:  KQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KD80 Uncharacterized protein3.18e-10699.36Show/hide
Query:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRK
        MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRK
Subjt:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRK

Query:  QANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKIRKSPPPPF
        QANPPPSYHAFPPPALLLL RKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKIRKSPPPPF
Subjt:  QANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKIRKSPPPPF

A0A1S3CSG8 extensin-3-like3.16e-6181.25Show/hide
Query:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSR
        MES NPIFVFFLFII+ LLSLNLPSN A H IPSSLLSPP MP ITRPIVP+HPF FP PF+K FR HTWLPPP PP QQ+LERPIVPY+PYKFPPPPSR
Subjt:  MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSR

Query:  KQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSE
        KQANPP SYHAFPPP L L  +KLYMSE
Subjt:  KQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSE

A0A5A7UXN4 Extensin-3-like8.52e-3963.93Show/hide
Query:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
        M LLS NLPSN A H IP SLLSPP MPP T+PIVP+HPF  P PF+KT +HTW P   P  Q+EL RPIVPY+PYKF PPP RK A+PPP YH FPP  
Subjt:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA

Query:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP
        L    +KL+MS  R+A P PPP
Subjt:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP

A0A5D3CI60 Extensin-3-like4.87e-3863.93Show/hide
Query:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA
        M LLS NLPSN A H IP SLLSPP MPP T+PIVP+HPF  P PF+KT +HTW P   P  Q+EL RPIVPY+PYKF PPP RK A+PPP YH FPP  
Subjt:  MSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPA

Query:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP
        L    +KL+MS  R+A P PPP
Subjt:  LLLLPRKLYMSEVRRATPPPPP

A0A5D3CVI1 Extensin-3-like1.61e-5382.41Show/hide
Query:  MPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKP
        MP ITRPIVP+HPF FP PF+K FR HTWLPPP PP QQ+LERPIVPY+PYKFPPPPSRKQANPP SYHAFPPP L L  +KLYMSEVRRA PPPPP KP
Subjt:  MPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFR-HTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHAFPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKP

Query:  YQWPKGKI
        YQWPKGKI
Subjt:  YQWPKGKI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCACGTAACCCCATTTTTGTGTTCTTCCTCTTCATCATCATGTCGTTGCTCTCTTTAAATTTGCCATCGAATTCTGCTGAGCACGATATTCCCTCATCTCTTTT
GTCACCGCCGCTAATGCCACCGATCACTAGACCTATAGTTCCTCATCACCCGTTTACATTCCCTTCTCCATTTAGGAAGACTTTTAGACACACATGGTTGCCACCACCAT
CGCCACCGGCGCAACAAGAATTGGAGAGGCCAATAGTTCCTTATTTTCCCTATAAATTTCCACCACCTCCATCAAGAAAACAGGCCAATCCTCCTCCGAGCTACCATGCC
TTTCCCCCACCAGCCTTACTGCTCCTACCCAGAAAACTTTACATGTCTGAGGTCAGGAGGGCGACGCCTCCACCACCGCCTATAAAGCCATATCAGTGGCCAAAAGGGAA
GATCCGTAAATCACCCCCACCTCCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGAGGTTGAGAACGATAATGGAGTCACGTAACCCCATTTTTGTGTTCTTCCTCTTCATCATCATGTCGTTGCTCTCTTTAAATTTGCCATCGAATTCTGCTGAGCACGA
TATTCCCTCATCTCTTTTGTCACCGCCGCTAATGCCACCGATCACTAGACCTATAGTTCCTCATCACCCGTTTACATTCCCTTCTCCATTTAGGAAGACTTTTAGACACA
CATGGTTGCCACCACCATCGCCACCGGCGCAACAAGAATTGGAGAGGCCAATAGTTCCTTATTTTCCCTATAAATTTCCACCACCTCCATCAAGAAAACAGGCCAATCCT
CCTCCGAGCTACCATGCCTTTCCCCCACCAGCCTTACTGCTCCTACCCAGAAAACTTTACATGTCTGAGGTCAGGAGGGCGACGCCTCCACCACCGCCTATAAAGCCATA
TCAGTGGCCAAAAGGGAAGATCCGTAAATCACCCCCACCTCCTTTCTAATTCTTCTACGTTTTCTTATATATATTCAATAAATTTCATTGTCTTTAATTTGGCCTTACTT
AGTTACTTTACTTATCTTCTCATCAAAGCTTGTCCTTGAAAAAAAATATCAATCACCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESRNPIFVFFLFIIMSLLSLNLPSNSAEHDIPSSLLSPPLMPPITRPIVPHHPFTFPSPFRKTFRHTWLPPPSPPAQQELERPIVPYFPYKFPPPPSRKQANPPPSYHA
FPPPALLLLPRKLYMSEVRRATPPPPPIKPYQWPKGKIRKSPPPPF