CuGenDBv2

Gene ID	CsGy6G018400
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	BRCT domain-containing protein
Genome location	Gy14Chr6:19150057..19150726
RNA-Seq Expression	CsGy6G018400
Synteny	CsGy6G018400
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR001357 - BRCT domain IPR036420 - BRCT domain superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0064700.1 putative topbp1 [Cucumis melo var. makuwa]

9.32e-60

97.14

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KAG7030063.1 hypothetical protein SDJN02_08410, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.89e-56

92.86

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XP_008445548.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488529 [Cucumis melo]

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XP_011657362.1 uncharacterized protein LOC101211759 [Cucumis sativus]

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XP_038884196.1 uncharacterized protein LOC120075098 [Benincasa hispida]

2.12e-54

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0KFI3 Uncharacterized protein

2.15e-58

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A0A1S3BD03 uncharacterized protein LOC103488529

2.15e-58

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A0A5A7VC02 Putative topbp1

4.51e-60

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A0A6J1G4S0 uncharacterized protein LOC111450771 isoform X1

4.23e-53

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A0A6J1G4Y5 uncharacterized protein LOC111450771 isoform X2

2.00e-53

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G77320.1 transcription coactivators

5.5e-06

42.31

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        EP K+    PF+GL ICVT +  + RK +++     GG YS  L   CTHL+
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AT3G43930.1 BRCT domain-containing DNA repair protein

1.8e-20

55.32

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        EV+ +K CS+L   F+  L      +     +  + +SR  P  VR  GPF+GL+ICVTGLSKEARKQVKEATERLGG+YS  LH  CTHLVVQ
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AT3G43930.2 BRCT domain-containing DNA repair protein

1.8e-20

55.32

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGAGGTGGTACGGTCGAAGTGGTTAGTAGTAAAGGTTGTTCTAGGCTGCTTTTTGGGTTCTCATCACCATTATCGTCATTGGGAGGGCTGCAACAGCTTGAGTCCAT
GTCTCTTGCTTCTCCGTCTTCAAGGTCTGAACCGGTGAAAGTGCGGTTAGCCGGTCCTTTTACTGGACTCGTAATTTGTGTCACTGGTTTATCCAAAGAAGCAAGGAAAC
AAGTTAAGGAAGCTACTGAGAGATTAGGTGGACAATACAGCCCCAATTTGCATCCACAATGCACCCATTTGGTGGTTCAAATATCCTTGGATATATTTAACCTTTTCTTG
TTTTTATGTGATATTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGGGTVEVVSSKGCSRLLFGFSSPLSSLGGLQQLESMSLASPSSRSEPVKVRLAGPFTGLVICVTGLSKEARKQVKEATERLGGQYSPNLHPQCTHLVVQISLDIFNLFL
FLCDIG

CsGy6G018400 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome