; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G021582 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G021582
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationGy14Chr6:22251972..22252513
RNA-Seq ExpressionCsGy6G021582
SyntenyCsGy6G021582
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647333.1 hypothetical protein Csa_003353 [Cucumis sativus]1.18e-3884.95Show/hide
Query:  MKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAMGEILGRGV
        M+RG    G+IFGRGGK    ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEI GRGG A+GEI+GRGV
Subjt:  MKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAMGEILGRGV

TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]1.26e-4071.05Show/hide
Query:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGG----KILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG
        G  M EILG+GGE LGE++ RGG+  GEI GRGG    +IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG+A GEILGRGGEALGE +GRGG+AIGEI+GRGG
Subjt:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGG----KILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG

Query:  RAMGEILGRGVKLL
         AMGEILGRG K +
Subjt:  RAMGEILGRGVKLL

XP_011658456.2 chromatin target of PRMT1 protein [Cucumis sativus]1.15e-4373.68Show/hide
Query:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG
        G    +IL +GGE LGE + RGG+  GEIFGRGGK    IL RGGEALGET+GRGG+A+GEI GRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEI GRGG
Subjt:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG

Query:  RAMGEILGRGVKLL
        RAMGEILGRG + L
Subjt:  RAMGEILGRGVKLL

XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]8.13e-4072.22Show/hide
Query:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAM
        M EILG+GGE  GEI+ RGG+  GEI GRGGK    IL RGGEA+GE +GRGG+ +GEIFGRGG+A GEI GRGGEA+GE +GRGGKAIGEILGRGG A+
Subjt:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAM

Query:  GEILGRGV
        GEI GRGV
Subjt:  GEILGRGV

XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]9.63e-4677.19Show/hide
Query:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG
        G  M EILG+GGE LGE M RGGK  GEIFGRGG+    IL RGGE LGET+GRGG+A+GEIFGRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEI GRGG
Subjt:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG

Query:  RAMGEILGRGVKLL
        RAMGEILGRG + L
Subjt:  RAMGEILGRGVKLL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein3.82e-4377.19Show/hide
Query:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG
        G  M EILG+GGE LGE M RGGK  GEIFGRGG+    IL RGGE LGET+GRGG+A+GEIFGRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEI GRGG
Subjt:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG

Query:  RAMGEILGRGVKLL
        RAMGEILGRG + L
Subjt:  RAMGEILGRGVKLL

A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like3.94e-4072.22Show/hide
Query:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAM
        M EILG+GGE  GEI+ RGG+  GEI GRGGK    IL RGGEA+GE +GRGG+ +GEIFGRGG+A GEI GRGGEA+GE +GRGGKAIGEILGRGG A+
Subjt:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGK----ILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAM

Query:  GEILGRGV
        GEI GRGV
Subjt:  GEILGRGV

A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.16e-2964.6Show/hide
Query:  GTRMDEILGQG---GEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRG----GKILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILG
        G R  + +G+G   G+ +GE   RG K  GE  GRG    G+IL R GEA+GE  GRGGEALGEI GR G+A GEILGRGGEALGE +GRGG+AIGEI+G
Subjt:  GTRMDEILGQG---GEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRG----GKILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILG

Query:  RGGRAMGEILGRG
        RGG AMGEILGRG
Subjt:  RGGRAMGEILGRG

A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.32e-3366.67Show/hide
Query:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGKILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAMGEI
        M EILG+GG+ +GEI+ RGG+  GEI GRGGK +       GE  GRGGEA+GEIFGRGG+A GEILGRGG+A+GE +GRGG+AIGEI GRGG+A GEI
Subjt:  MDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGKILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAMGEI

A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like6.10e-4171.05Show/hide
Query:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGG----KILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG
        G  M EILG+GGE LGE++ RGG+  GEI GRGG    +IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG+A GEILGRGGEALGE +GRGG+AIGEI+GRGG
Subjt:  GTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGG----KILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGG

Query:  RAMGEILGRGVKLL
         AMGEILGRG K +
Subjt:  RAMGEILGRGVKLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAATTTGGGACAAGGATGGACGAAATATTGGGACAAGGAGGTGAAGTTCTTGGTGAAATAATGAAACGAGGTGGTAAAGATTTTGGTGAGATATTTGGACGG
GGTGGCAAAATATTGGAACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGC
GAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTGGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATA
CTGGGACGAGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGAC
GAGGGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAATTTGGGACAAGGATGGACGAAATATTGGGACAAGGAGGTGAAGTTCTTGGTGAAATAATGAAACGAGGTGGTAAAGATTTTGGTGAGATATTTGGACGG
GGTGGCAAAATATTGGAACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGGTGGTGAAGCTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGC
GAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTGGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATA
CTGGGACGAGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGAC
GAGGGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQFGTRMDEILGQGGEVLGEIMKRGGKDFGEIFGRGGKILERGGEALGETIGRGGEALGEIFGRGGKATGEILGRGGEALGETMGRGGKAIGEILGRGGRAMGEI
LGRGVKLLVKQWDEVVKLLVRYLDGVVELWAKYWDEG