; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G021950 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G021950
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionRibonuclease Z
Genome locationGy14Chr6:22530132..22537199
RNA-Seq ExpressionCsGy6G021950
SyntenyCsGy6G021950
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
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B9DNT1 Ribonuclease Z9.3e-1428.33Show/hide
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P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)5.0e-6062.72Show/hide
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Q58897 Ribonuclease Z3.2e-1429.34Show/hide
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Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic2.9e-14070.62Show/hide
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        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
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Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P SIKEDVEKLLEIHR MGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE

Query:  THHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF
        THHVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTT ++MLDPRNADALRAK+LITEATFLDE+ S EHA+  GHTHI 
Subjt:  THHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQSNVTAKVVPLTEGFKSEY
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQS V+AKV+PLTEGF+S Y
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Q8LGU7 tRNase Z TRZ17.4e-9658.84Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PASIKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQV

Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETHHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTT DF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETHHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAK

Query:  ILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQSNVTAKVVPLTEGF
        +L+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
Subjt:  ILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQSNVTAKVVPLTEGF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z15.3e-9758.84Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PASIKE VE L E+HR +   
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Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETHHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTT DF++D  NADAL+AK
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        +L+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
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AT2G01730.1 cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II5.2e-0428.57Show/hide
Query:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQVELDV---------DLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETHHVI
        + ITH H+DH+G LP +       G   +S PT  L   + ED  +++   R  G+ EL            ++A+D+ +T ++  +L  RA+   HV+
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AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein2.0e-14170.62Show/hide
Query:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPLLHTPKPPGVALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPE
        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
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Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P SIKEDVEKLLEIHR MGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPASIKEDVEKLLEIHRNMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE

Query:  THHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTPDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF
        THHVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTT ++MLDPRNADALRAK+LITEATFLDE+ S EHA+  GHTHI 
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Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQSNVTAKVVPLTEGFKSEY
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQS V+AKV+PLTEGF+S Y
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACAGGTTAATCGTAAAGGGGTTGATTTAGAAG
GGTATTCAATCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCCCGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCCCGTGCAATTCAGCAA
AACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGCTTATATAGTTTAAGTCCTCCTACAGTATTTTTGCCTGC
TAGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGAACATGGGCCAGGTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGCACTAGATGTGGGAGAAACATATGAAATGC
GTAATAATCTTGTCTGCAGAGCATTTGAAACTCATCATGTGATACCAAGCCAGGGTTATGTCATTTACTCAGTTAGAAAAAAATTGAAGAAGCAATACATGCATCTTAAG
GGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACGGGTGATACAACACCAGATTTTATGCTTGATCC
CCGTAATGCCGATGCATTGAGGGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTGGACGAAGCAGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGTCACACTCACATATTTG
AGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTTACTCATTTTTCATCTCGATACCATATAGAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGCTGCAGTCG
AACGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGATTCAAGTCAGAGTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCCATCTTCCCAAGGAGGTGGTGCAGTCACATATCCAAATCCTTTTACTCTTGTGTTTTCCTTTCCCATCGGAGACCAATTAAACCTCCCCTAAACCCCATTTCTTCTT
CCTCCAATTCCTTTCACAATCTTATGTCATTATTTCCCTTCTAACCCATTACAAGATGCAAATTTCTATCCCCATTTCGCCTCTCAGACCTCCTCAAGTTTTCCCATTTC
ATCAACCTCTTTTACACACACCCAAACCTCCGGGAGTTGCTCTCCAAAGTCATCTGAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAA
GAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACAGGTTAATCGTAAAGGGGTTGATTTAGAAGGGTATTCAATCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCC
CGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCCCGTGCAATTCAGCAAAACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGT
ATGTAGCTAGTCGTGGCTTATATAGTTTAAGTCCTCCTACAGTATTTTTGCCTGCTAGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGAACATGGGCCAG
GTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGCACTAGATGTGGGAGAAACATATGAAATGCGTAATAATCTTGTCTGCAGAGCATTTGAAACTCATCATGTGATACCAAGCCAGGG
TTATGTCATTTACTCAGTTAGAAAAAAATTGAAGAAGCAATACATGCATCTTAAGGGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATAT
TGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACGGGTGATACAACACCAGATTTTATGCTTGATCCCCGTAATGCCGATGCATTGAGGGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTG
GACGAAGCAGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGTCACACTCACATATTTGAGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTTACTCATTT
TTCATCTCGATACCATATAGAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGCTGCAGTCGAACGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGATTCAAGTCAGAGTATTAGT
GTAGGATATGAATCGATGGTTACAAAGTGTAATTATTTAACCTCAAAACAGAGAAACAGGAACATAGATGTCTAGATTCATTCATGAATTAGGATTGGTAAGATCCCACT
CGTAAAGTCAAAGAACTTGAATCAAAGCCAGCCAGGTTGAACACAAGAAAAATATCAAGGCAATAGCTTTGGCTTTATTTAGAGTTTGATTGATGCAAACGCTTCCTAAA
CCCCAACCACTACTTTTCTTCTGATGGAGATCACTTCTCCTTTTATTAGCTTTATGTTGTAAAGAAGACTGTTAAAACTATTCCATGAGTGTTTCTTAAGTAGTAAAAAT
AAAGACACCCAAGTGGTGAATTGTTTTATACAGATTTTGAAATCATTAAAACCATTTCAGTAAAAGTGATTTTAATTACATAGTCTACAGATAAAACTAAAAGAATCTCA
CCCAATGCGTATAAATTACGTTTGTGGAAAAAGTGAATAAAATTCTTTGCCATGGATATGTGTGGGTCCAGAGACGTGGAACAAAATGATTGGATCTTTATTACTCATAA
GTTGGATAAACCTCTCAGCTATTCTAACAAAAATATGATTTCTTTTCAGTTTTCTTTTTCTTTTTAGATGGATGTAATCTTTAATATTTGGCCAAATATTTATTTTGTCC
ATATGATTCACAAATTACATTTTAGTCCCTCGAGTCCACAAACGATATATACCCATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQISIPISPLRPPQVFPFHQPLLHTPKPPGVALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIGVEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQ
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