; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G026110 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G026110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Descriptionprotein RALF-like 19
Genome locationGy14Chr6:25684324..25685036
RNA-Seq ExpressionCsGy6G026110
SyntenyCsGy6G026110
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647467.1 hypothetical protein Csa_004319 [Cucumis sativus]8.31e-5479.46Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRR                       KNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_004148669.1 protein RALF-like 19 [Cucumis sativus]6.71e-78100Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_004150814.1 protein RALF-like 4 [Cucumis sativus]1.19e-4773.04Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY
        LCL LLL+A +A  L +AL D WTR+Y + PDY F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRG SYYDC KR+KANPY
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY

Query:  RRGCIAITGCARFTD
        RRGCIAITGCARFTD
Subjt:  RRGCIAITGCARFTD

XP_008441015.1 PREDICTED: protein RALF-like 19 [Cucumis melo]5.16e-6688.39Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_016902249.1 PREDICTED: protein RALF-like 4 [Cucumis melo]2.80e-4670.94Show/hide
Query:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKAN
        KLCL  LLL+A  AA L +AL D WTR++ + P+Y F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCR RG SYYDC KR+KAN
Subjt:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKAN

Query:  PYRRGCIAITGCARFTD
        PYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  PYRRGCIAITGCARFTD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD7 F3H9.8 protein5.76e-4873.04Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY
        LCL LLL+A +A  L +AL D WTR+Y + PDY F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRG SYYDC KR+KANPY
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPY

Query:  RRGCIAITGCARFTD
        RRGCIAITGCARFTD
Subjt:  RRGCIAITGCARFTD

A0A0A0KHU4 Uncharacterized protein3.25e-78100Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A1S3B2H7 protein RALF-like 192.50e-6688.39Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A5A7SVY5 Protein RALF-like 41.35e-4670.94Show/hide
Query:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKAN
        KLCL  LLL+A  AA L +AL D WTR++ + P+Y F         N  +DSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCR RG SYYDC KR+KAN
Subjt:  KLCL-FLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDF--------TNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKAN

Query:  PYRRGCIAITGCARFTD
        PYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  PYRRGCIAITGCARFTD

A0A5D3DPV5 Protein RALF-like 192.50e-6688.39Show/hide
Query:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG
        MRS KL LFLL+IAVVAAPLCLA SDDWT +YA  P+YDFT +NEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNN PCRHRGRSYYDCKKR+KANPYRRG
Subjt:  MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 191.0e-1444.35Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANP
        L L LL +AVVA     + +  WT + + V          + D+   +E +RR L          +  Y+ Y ALRKNN+PC  RGRSYYDCKKRK+ANP
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANP

Query:  YRRGCIAITGCARFT
        YRRGC  IT C R T
Subjt:  YRRGCIAITGCARFT

Q8L9P8 Protein RALF-like 331.2e-1045.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            KY+ Y ALR+N +PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Q945T0 Rapid alkalinization factor2.0e-1046.38Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGC
        +F   +E +RR+L            KY+ Y AL+KN++PC  RG SYY+CK   +ANPY RGC AIT C
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGC

Q9FZA0 Protein RALF-like 49.4e-1672.34Show/hide
Query:  KYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        +Y+GYDAL+KNN+PC  RGRSYYDCKKR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  KYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.0e-1045.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            +Y+ Y ALR+N IPC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28270.1 ralf-like 46.7e-1772.34Show/hide
Query:  KYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        +Y+GYDAL+KNN+PC  RGRSYYDCKKR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  KYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF

AT2G33775.1 ralf-like 197.4e-1644.35Show/hide
Query:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANP
        L L LL +AVVA     + +  WT + + V          + D+   +E +RR L          +  Y+ Y ALRKNN+PC  RGRSYYDCKKRK+ANP
Subjt:  LCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADV---------PDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANP

Query:  YRRGCIAITGCARFT
        YRRGC  IT C R T
Subjt:  YRRGCIAITGCARFT

AT3G05490.1 ralf-like 223.2e-1147.62Show/hide
Query:  SRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        SRR+L Q          KY+ Y A+R+N++PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC  IT C R
Subjt:  SRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.4e-1145.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            +Y+ Y ALR+N IPC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT4G15800.1 ralf-like 338.4e-1245.07Show/hide
Query:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F   +E +RR+L            KY+ Y ALR+N +PC  RG SYY+C++  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGATCAACGAAGCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCATTGCAGTCGTCGCCGCTCCACTTTGCCTTGCCTTATCCGACGACTGGACTCGCTCCTACGCTGATGTCCCCGA
TTATGACTTTACGAACAGCAATGAAGACAGCCGAAGGTTACTTTTTCAATATGGATTTGCTTATAAATATCCAAAAAATAAGTATTTGGGCTATGATGCACTTAGGAAGA
ATAATATCCCCTGCCGCCATCGTGGTAGATCTTACTATGACTGTAAGAAGCGTAAGAAGGCCAACCCTTATCGTCGTGGCTGCATTGCCATCACCGGCTGCGCTCGTTTC
ACCGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCTTCTCATCTTCATCAGGAAAAAAAAGGCAGAGCAAAACAAATAACAAACACCACAACAAATTAAACCCCCCACCTCCCCATTTATTCCCTTCAACATCTCATCATAC
CACACCACTAGCTCCAAAATGAGATCAACGAAGCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCATTGCAGTCGTCGCCGCTCCACTTTGCCTTGCCTTATCCGACGACTGGACTCGCTC
CTACGCTGATGTCCCCGATTATGACTTTACGAACAGCAATGAAGACAGCCGAAGGTTACTTTTTCAATATGGATTTGCTTATAAATATCCAAAAAATAAGTATTTGGGCT
ATGATGCACTTAGGAAGAATAATATCCCCTGCCGCCATCGTGGTAGATCTTACTATGACTGTAAGAAGCGTAAGAAGGCCAACCCTTATCGTCGTGGCTGCATTGCCATC
ACCGGCTGCGCTCGTTTCACCGATTAAATTGTTTTTTTAAAAAATAATCTGTATTGAGATTGTTTTTTGATTTATTGTGGGATCGGTTTGAATGTTTTCTCCCTATTTTA
TTTTTTGTGAAATTTTAATTTTGTTTTATATTATTTTAAAGTTTTCCGTCCATTCGGAATGTAAGGATCGATCATATAATGACCTCTATAAAATGGTTAAAATATAATTT
TCATTCACTCAACTTTTTTCAACGTGACACCTATCAAACCATTATATCTCAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSTKLCLFLLLIAVVAAPLCLALSDDWTRSYADVPDYDFTNSNEDSRRLLFQYGFAYKYPKNKYLGYDALRKNNIPCRHRGRSYYDCKKRKKANPYRRGCIAITGCARF
TD