; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy6G036300 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy6G036300
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionGermin-like protein
Genome locationGy14Chr6:31882489..31883376
RNA-Seq ExpressionCsGy6G036300
SyntenyCsGy6G036300
Gene Ontology termsGO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0030145 - manganese ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001929 - Germin
IPR006045 - Cupin 1
IPR011051 - RmlC-like cupin domain superfamily
IPR014710 - RmlC-like jelly roll fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN49469.1 hypothetical protein Csa_003117 [Cucumis sativus]3.81e-154100Show/hide
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XP_004134624.1 putative germin-like protein 2-1 [Cucumis sativus]1.12e-12079.44Show/hide
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XP_008439540.1 PREDICTED: putative germin-like protein 2-1 [Cucumis melo]6.79e-12279.91Show/hide
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XP_031742920.1 putative germin-like protein 2-1 [Cucumis sativus]1.89e-15094.81Show/hide
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XP_038877837.1 LOW QUALITY PROTEIN: putative germin-like protein 2-1 [Benincasa hispida]7.04e-12281.73Show/hide
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        L+FLA+TCSI LASDPSPLQDFCVADPNNPVK+NG VCKDP +VEAKDFF SGL+V GDTNN  GS +TPA++VQIPGLNTLGIS+ R+D+AP  I  PH
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        IA IQSKF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIX1 Germin-like protein5.44e-12179.44Show/hide
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A0A0A0KKW4 Germin-like protein1.85e-154100Show/hide
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A0A0A0KKX1 Germin-like protein3.66e-11979.9Show/hide
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        FL+F ALTCSI LASDPSPLQDFCVAD N+PVK+NG VCKDP +VEAKDFF SGL+V GDTNN  GS +TPA++VQIPGLNTLGIS+ R+D+AP  I  P
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        IIANIQSKF
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A0A1S3AYK9 Germin-like protein3.29e-12279.91Show/hide
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A0A5D3CN45 Germin-like protein3.29e-12279.91Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6K5P8 Putative germin-like protein 2-33.2e-6860.95Show/hide
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        + LAL CS     +ASDPS LQD CVAD  + V++NG+ CKD + V A+DFF SGLH+ G+T N  GS +T  ++ Q+PGLNTLGISLAR+D+A + +  
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        PHTHPRATEILT+LEG+L VGFVTSNPEN+L TK +NKGDVFVFP GL+HF  N     AVAIVA SSQNPG++T+ N+VFGSKP I  +ILAKAFQ   
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Q6K5P9 Putative germin-like protein 2-21.2e-6760.09Show/hide
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        Q+  ++ LAL CS G +ASDP  LQDFCV D  + V++NG  CKD K V A DFF SGLH+ G+T N  GS +T  ++ QIPGLNT+G+SL R+D+APN 
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        +  PHTHPRATEI T+LEG+L VGFV SNPEN+L TK LNKGDVFVFP GL+HF  N     AVA+ A SSQNPG++T+ N+VFGSKP I  +ILAKAFQ
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         +  II  IQ++F
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Q6K5Q0 Putative germin-like protein 2-12.4e-6859.81Show/hide
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        ST    L+ LA++ S   ASDPS LQDFCVAD  + V +NG  CKDP  +  +DFF SGLH+ G+T+N  GS +T  ++ QI GLNTLGISLAR+D+AP 
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         +  PH HPRATEILT+LEG+L VGFVTSNPEN+L TK LNKGDVFVFP GLIHF  N   +  +A+ A SSQNPG++TI N+VFGSKP I  +ILAKAF
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        Q    I+  IQ++F
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Q6YZ99 Germin-like protein 8-92.5e-6560.19Show/hide
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        LF + LAL     +ASDPSPLQDFCVAD ++PV +NG  C DPK V A  FF++ +       N  GS +T  +++QIPGLNTLGIS+AR+D+AP     
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        PHTHPRATEILT+LEGTL VGFVTSNP N L +K LNKGDVFVFP+GLIHF  N   H+PAVAI A SSQNPG++TI N+VFGSKP I   +LAKAFQ  
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           I  +Q++F
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Q6YZA9 Germin-like protein 8-28.3e-6961.97Show/hide
Query:  VLFLSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVADPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSG-LHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLDFAPNSI
        +L  + L L     +ASDPSPLQDFCVAD N+PV++NG VCK+P    A DFF++  L  P DTNN  GS +T  +++Q+PGLNTLGIS+ARLDFAP  +
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Query:  VTPHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPENRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQN-IAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNILAKAFQ
          PHTHPRATEI T+LEGTL VGFVTSNP+NRL++K LNKGDVFVFP GLIHF  N   H+PAVAI A SSQNPG++TI N+VFGS P I  +IL KAFQ
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Query:  TNPAIIANIQSKF
         +  II  +Q++F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14630.1 germin-like protein 92.0e-6558.29Show/hide
Query:  LSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA--DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLDFAPNSIVT
        LS  ALT  + +ASDPSPLQDFCV    P + V +NG  CKDP++V A DFF S L+ PG+TNN+ GS +T  ++  + GLNTLGISL R+D+APN    
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Query:  PHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPE-NRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQNIAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNILAKAFQTN
        PHTHPRATEIL + +GTLLVGF++SN + NRL  KTLN GDVFVFP GLIHF  N+   PAVAI A SSQN G++TI N++FGSKPD+  N+LA+AFQ +
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Query:  PAIIANIQSKF
           + N+Q++F
Subjt:  PAIIANIQSKF

AT5G38940.1 RmlC-like cupins superfamily protein5.7e-6559.52Show/hide
Query:  LSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA--DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLDFAPNSIVT
        LS LALT  + +ASDPS LQDFCV+     N V +NG  CKDPKLV A DFF SGL       +  GS +T  ++  + GLNTLGISL R+D+A N    
Subjt:  LSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA--DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLDFAPNSIVT

Query:  PHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPENRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQNIAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNILAKAFQTNP
        PHTHPRATEIL + +GTLLVGFVTSNP+NRL +K LN+GDVFVFP GLIHF  NI   PAVA  A SSQNPG++TI N+VFG+ P I   ILAKAFQ NP
Subjt:  PHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPENRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQNIAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNILAKAFQTNP

Query:  AIIANIQSKF
         ++ ++Q+KF
Subjt:  AIIANIQSKF

AT5G39130.1 RmlC-like cupins superfamily protein1.8e-6355.71Show/hide
Query:  MVISTQVLFLSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA-DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLD
        M +S  ++  + +AL  S   A DPSPLQDFCVA D    V +NG  CKDP+ V+AKDFF SGL+VPG+TNN  GS +T  ++ QIPGLNT+GISL R+D
Subjt:  MVISTQVLFLSFLALTCSIGLASDPSPLQDFCVA-DPNNPVKLNGIVCKDPKLVEAKDFFRSGLHVPGDTNNSAGSQITPASIVQIPGLNTLGISLARLD

Query:  FAPNSIVTPHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPE-NRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQNIAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNI
        +AP+    PHTHPR +EIL L+EGTL VGFV+SN + NRL  K L+ GDVFVFPIG+IHF  NI   PA+A    SSQN G++TI N+VFGS P I   +
Subjt:  FAPNSIVTPHTHPRATEILTLLEGTLLVGFVTSNPE-NRLITKTLNKGDVFVFPIGLIHFHQNIAHRPAVAIVAFSSQNPGIVTIENSVFGSKPDIPTNI

Query:  LAKAFQTNPAIIANIQSKF
        LA+AFQ +  ++  +Q+KF
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AT5G39160.1 RmlC-like cupins superfamily protein8.3e-6455.71Show/hide
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        M +S  ++  + +AL  S   A DPSPLQDFCVA D    V +NG  CKDPK V+AKDFF SGL++PG+TNN  GS +T  ++ QIPGLNT+GISL R+D
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        +AP+    PHTHPR +EIL L+EGTL VGFV+SN + NRL  K L+ GDVFVFPIG+IHF  N+   PAVA    SSQN G++TI N+VFGS P I   +
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        LA+AFQ + +++  +Q+KF
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AT5G39190.1 germin-like protein 23.7e-6456.16Show/hide
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        +AP+    PHTHPR +EIL L+EGTL VGFV+SN + NRL  K L+ GDVFVFPIG+IHF  N+   PAVA    SSQN G++TI N+VFGS P I   +
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        LA+AFQ + +++  +Q+KF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTCTCAAATAACTCCAGCCAGTATTGTCCAAATCCCAGGACTCAACACTCTCGGCATCTCCCTTGCTCGCCTTGACTTTGCCCCAAACAGTATCGTTACTCCCCATACT
CACCCTCGCGCCACTGAAATATTGACCCTTCTGGAAGGCACACTCTTGGTGGGCTTCGTCACCTCCAACCCTGAAAACCGTCTCATTACTAAGACATTGAATAAGGGCGA
CGTCTTTGTCTTTCCCATTGGACTAATTCACTTTCATCAAAACATTGCTCATCGTCCAGCTGTTGCCATTGTAGCTTTTAGCAGCCAAAACCCGGGTATTGTTACCATTG
AAAATTCTGTTTTTGGATCAAAGCCTGACATCCCAACCAACATTCTTGCGAAGGCTTTTCAAACCAATCCTGCTATTATAGCCAACATTCAGTCCAAGTTTTTGAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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