; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy7G005120 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy7G005120
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationGy14Chr7:3811497..3815233
RNA-Seq ExpressionCsGy7G005120
SyntenyCsGy7G005120
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136872.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus]2.90e-8498.57Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

XP_008455213.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495430 [Cucumis melo]6.82e-8397.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.37e-8092.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]5.02e-8092.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]1.08e-7992.86Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein1.40e-8498.57Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

A0A1S3C1M4 uncharacterized protein LOC1034954303.30e-8397.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

A0A6J1CLE5 uncharacterized protein LOC1110122421.50e-7992.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X22.43e-8092.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X12.60e-8092.14Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLE +
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein2.9e-4973.76Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEM SNLDSLQKLLLKKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAIT+AAHARSEKRQAE++Q+AAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV

Query:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL
        Q+VTKELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLE +
Subjt:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGCGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTG
CTATCACCTCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCTCAAAGAGCTGCTGAAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCAAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTTTTGGAGATTCTTAATGGTGTAAGGTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGCGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTG
CTATCACCTCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCTCAAAGAGCTGCTGAAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCAAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTTTTGGAGATTCTTAATGGTGTAAGGTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITSAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQEVTKELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEILNGVRF