CuGenDBv2

Gene ID	CsGy7G013640
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
Description	Unknown protein
Genome location	Gy14Chr7:17742305..17746730
RNA-Seq Expression	CsGy7G013640
Synteny	CsGy7G013640
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6593052.1 hypothetical protein SDJN03_12528, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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e value

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A0A0A0K4R1 Uncharacterized protein

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A0A1S4DXB3 uncharacterized protein LOC103489727

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A0A6J1DS86 uncharacterized protein LOC111023052

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A0A6J1H692 uncharacterized protein LOC111460909

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT3G07440.1 unknown protein

2.5e-74

68.9

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        R  RT+A   RR +K     + K E KSEWW VDGEMHEIGD+VPPRERF IPR+N+PN+RRKQLR+QFMRRTRLVLKESEH+PWCKKYMELY ELRENW
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        ERLYWDEGYSKKLA DHANYESAEE  EDF+PYRNR+S +D+ KEQ F R  QG +WE VSQIRDKFEYDRERRM+++AFAPM+    +  S+   W  Q
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Query:  RTDVQPQRY
        R    P R+
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AT5G48530.1 unknown protein

4.7e-65

67.18

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        MLS+  R  + + SL + +   R  RT+A +P RR+  P+   + K E KSEWW VDGEMHEIGD+VP RERF IPR+N+PN+RRKQLREQFMRRTRLVL
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        KESEH+PWCKKYMELY E+RENWERLYWDEGYSKK+ARDHANYESAEE  EDF+PYRNR+  +    +EQ F R  QG  +WE VSQIRDKFEYD
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCCATTTCGATCGTTCCGGACGGATGCCAGACCCTCCAGGCGGCACTCAAA
GCCTGCTCCATTCACAGTAAACAAGCCAGAACACAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCGAAATGCATGAAATCGGCGACAATGTACCCCCTCGCGAGCGATTTATCA
TACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGGACTCGCCTCGTTCTCAAGGAATCTGAGCACGATCCATGGTGCAAAAAG
TACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGATTGTACTGGGATGAGGGTTATTCCAAAAAACTTGCTAGGGATCATGCAAACTATGAGTCTGCTGAGGA
GGAAGATTTTTCTCCTTATAGGAATAGGCAATCCACTGATCGGAATAAGGAACAAGATTTTAGGAGGAACGTGCAAGGTGGTCATTGGGAGAATGTCAGCCAGATTAGAG
ATAAGTTTGAATACGATAGAGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCATTTGCACCTATGCATGGAGATCGAACTTTTCCCTCACAGATTCCTCGATGGCAACGAACAGATGTG
CAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GAAAAGGAGGTTTGCCCACGGCGACTTTGTTCTTTTGCGAACTATACTTCTCTAGACGCTGCTGCCCGGGTGCTGGAAAACCCTATTTGCGAGTTCTCTCCGTCGTATCG
GAAAACATCCCTGCACCGGTCTGAAGCTTCACAAGCTTATGCTCTCACTCACTCACAGATTTCGGACTCTGTCCTCATCTCTATGTTCCAATTCTCATCCATTTCGATCG
TTCCGGACGGATGCCAGACCCTCCAGGCGGCACTCAAAGCCTGCTCCATTCACAGTAAACAAGCCAGAACACAAGTCCGAGTGGTGGGCTGTTGATGGCGAAATGCATGA
AATCGGCGACAATGTACCCCCTCGCGAGCGATTTATCATACCCAGAGAAAATCTCCCCAATCGGCGTCGAAAGCAGCTCAGGGAACAGTTCATGCGTCGGACTCGCCTCG
TTCTCAAGGAATCTGAGCACGATCCATGGTGCAAAAAGTACATGGAGCTTTATCAGGAGCTAAGGGAAAACTGGGAGAGATTGTACTGGGATGAGGGTTATTCCAAAAAA
CTTGCTAGGGATCATGCAAACTATGAGTCTGCTGAGGAGGAAGATTTTTCTCCTTATAGGAATAGGCAATCCACTGATCGGAATAAGGAACAAGATTTTAGGAGGAACGT
GCAAGGTGGTCATTGGGAGAATGTCAGCCAGATTAGAGATAAGTTTGAATACGATAGAGAGAGAAGAATGAAAGAGAGAGCATTTGCACCTATGCATGGAGATCGAACTT
TTCCCTCACAGATTCCTCGATGGCAACGAACAGATGTGCAGCCACAAAGATACATGTCCGAGAGCGATAGTGACTGACAAATTGACTAAAACTTTATCTGCGTCTATGTG
AAGAAGAGGTTAGAAATATCCTTACAGGTCATCTCTCCCTTTGCTGTAGTTACCCTTATCTGCAGTTGTAGGGTGTCTTCTCCATCTCAAGTTTAAAACAACCAGAATCA
TTTTGGTTACTTCGTTAGGTTCACCTCGAGATCTGTGGTTGGTTTCGATATTGTGTTAATATGCTCTATAGAGTGAACACAAATAAACTGAACCTTTGGTACTGCTACAT
ACAAACGACATAATGATTGAAAGAGCTTGGCAATGGGGAGAAGCCTTTTTTGGTCTCCTTTTTAGATCTCTGAAAGAAGGCCAATTGAGAGAGATTGGTGATGGATATAA
TATCTATACTTTACACACCTTGAAATCTAGGATTTTGTTACAATTGAATCCCATGTGTGAATTTTGCTGTTAAAGGTACTGTGAAGGAACTGAAGGGCTCAATTGAGTGT
AGTTTAAATTGACTAGCTGGTCTTCAAAAACAACAAATTCCTTGTACAGTGGCCTTCCTTGTTTTCCACCTTTCGATGTTGATTATGAACGACAACACTTTCAAATTTAA
GACACTAAAACACTTATCTAAATTATCTCAAGTTTAGAGTTTAATTTGATGAAATTGAAAGTTGAGGGTAAAATTTAAGTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLSLTHRFRTLSSSLCSNSHPFRSFRTDARPSRRHSKPAPFTVNKPEHKSEWWAVDGEMHEIGDNVPPRERFIIPRENLPNRRRKQLREQFMRRTRLVLKESEHDPWCKK
YMELYQELRENWERLYWDEGYSKKLARDHANYESAEEEDFSPYRNRQSTDRNKEQDFRRNVQGGHWENVSQIRDKFEYDRERRMKERAFAPMHGDRTFPSQIPRWQRTDV
QPQRYMSESDSD

CsGy7G013640 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome