; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy7G018010 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy7G018010
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationGy14Chr7:21152789..21156776
RNA-Seq ExpressionCsGy7G018010
SyntenyCsGy7G018010
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058670.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.42e-22497.6Show/hide
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XP_022953211.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita moschata]3.17e-18786.07Show/hide
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XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]6.34e-19388.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase3.44e-232100Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase7.66e-22296.7Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase6.86e-22597.6Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase1.53e-18786.07Show/hide
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase7.00e-18685.71Show/hide
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        MSSA+    AAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSS L+CPHCLTDF+EHMDFTIPTSSSSISD+P SSS P DSDPSSFV VDPLP TS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A7.3e-1638.94Show/hide
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        P    LF+ L+  +     P  P       ++++ A+PTIK+    L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  SDDPSDRVRCRTS
        S       + RT+
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A8.9e-1431.16Show/hide
Query:  PSSSSSSSSSSSSSSSLVCPHCLT---------DFIEHMDFTIPTSSSSISDNPNSSSPPTDSDPSSFVFVDPLPITSDDNYLLNSPQFLRLFQHLA--D
        PSSSSS+ S+S  + +   P  +T           I         SS  +S+  + S+     D  +   + PLP  S   +LL S  F RL   ++  +
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Query:  SSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRT
         + +  + S    P +  K+++ A+P I++    L  D    CA+CK+ F+L+  A+++PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+CR +LP++D +D      
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Query:  SALLRARDLMHQEDS
        +A+    +   +EDS
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Q6AVN2 E3 ubiquitin-protein ligase SIRP11.2e-1540.5Show/hide
Query:  TSDD----NYLLNSPQFLRLFQHLADSSESDFVPSVPFNPFTPI-KASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPW
        T+DD     Y+L +   L L QHLA+S  S        N   P  K +V A+PT+K+       + V+ C++C D   +  +AKQ+PC H +H  CILPW
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Query:  LSNHDSCPLCRFKLPSDDPSD
        L  H SCP+CRF+LPS++  D
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Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like4.3e-1629.68Show/hide
Query:  SATITATAAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLVCPHCLTDFIEHMDFTIPTSSSSISDNPNSSS---PPTD--------------S
        ++T +A AA E    ++C++C+ +VT+           S SSS+   CP C   F+E  ++  P  + S++ NPNSS    P  D              +
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Query:  DPSSFVF-------VDPLPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQHLADSSESD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--I
         PS   F       + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   
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Query:  KASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRTS
        K+++ A+PT+KVT  +L  + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R + S
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Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF15.1e-1738.33Show/hide
Query:  PQFLRLFQHLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L + L+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L       C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  SDDPSDRVRCRTSALLRARD
        S   S   +   +     R+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein9.4e-1944.23Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK++S++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
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Query:  DPSD
           D
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AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G56580.3 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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        H DCI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+         +   R+R    A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTGTTTGCCCCCACTGCCTCACTGACTTCATCGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACA
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CTCCGTCTTTTCCAGCACCTTGCAGATTCATCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTAT
TAAAGTCACCTCCGCCTTGCTCGATGAAGACCCAGTTTTAATTTGTGCTATCTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCTTGTTCTCATCTTT
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GCCTTGTTGAGGGCTAGAGATCTGATGCATCAAGAAGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTTTGGAACTCATGGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTCTAGTGAGGGAATTCA
TGTGGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTATGATGGAGAGTGGGGAACAGACCGACAGTGTTGAAACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTG
TAATTGTCAATAGCAATGGTGATGAAAATGGGTTTTTGGGAATGGATGGACCTATAACTGAGGATGCTGGGACTGTAGTTCAGGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTT
GTTTCTGCATAA
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AAACCATGTCCTCCGCCACTATTACCGCCACCGCCGCCGCCGAACGCCACACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCTTCATCA
TCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTGTTTGCCCCCACTGCCTCACTGACTTCATCGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTC
CGACAACCCCAATTCCTCTTCTCCCCCCACAGATTCCGATCCATCATCCTTCGTCTTTGTCGACCCACTTCCGATCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAATAGCCCTC
AGTTCCTCCGTCTTTTCCAGCACCTTGCAGATTCATCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCC
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TCTTTATCATCCAGATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGTCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTTCCTTCTGATGACCCCTCGGATCGTGTGAGATGTAGGA
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ATTCATGTGGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTATGATGGAGAGTGGGGAACAGACCGACAGTGTTGAAACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGG
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GTTTTGTTTCTGCATAAATTGAGGTAATATAGTAGAATATATGGTTGTTAGATGAATCTTAGAAAGCAGCTACCCCAAGTAGATGATTGATTGGAAGTGTAAATTGCTAC
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AGCAATGTTTCCCTTCTCTCTTTTAGTCATGGTTTGAGTCTATGAGGCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATTTATATATAAAGTTCTGCAGTTTCA
ATCTATTGAGAAATAGATTCAACAACTTATAATCCATATTTCATTGTGCCTTCTTTTGTTTCTTTCTTCTTACTTGCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VSA