; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsGy7G019770 (gene) of Cucumber (Gy14) v2.1 genome

Gene IDCsGy7G019770
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionRibosomal protein L37
Genome locationGy14Chr7:22332508..22335486
RNA-Seq ExpressionCsGy7G019770
SyntenyCsGy7G019770
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001569 - Ribosomal protein L37e
IPR011331 - Ribosomal protein L37ae/L37e
IPR011332 - Zinc-binding ribosomal protein
IPR018267 - Ribosomal protein L37e, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141772.1 60S ribosomal protein L37-3 [Cucumis sativus]1.01e-51100Show/hide
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XP_021609554.1 60S ribosomal protein L37-3 [Manihot esculenta]1.01e-51100Show/hide
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XP_021654586.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Hevea brasiliensis]1.01e-51100Show/hide
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XP_021892871.1 60S ribosomal protein L37-1 [Carica papaya]2.80e-5198.77Show/hide
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XP_027344789.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Abrus precatorius]1.01e-51100Show/hide
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A0A0A0K941 Ribosomal protein L374.88e-52100Show/hide
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A0A1S3CGU0 Ribosomal protein L374.88e-52100Show/hide
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A0A251LJK8 Ribosomal protein L374.88e-52100Show/hide
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A0A5D3BYC5 Ribosomal protein L374.88e-52100Show/hide
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A0A6A6LIP3 Ribosomal protein L374.88e-52100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P49166 60S ribosomal protein L37-A1.1e-2871.6Show/hide
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        MGKGT SFGKR NK+HTLC RCGRRSFH+QK  C++C +PAA+ R YNW  KA RR TTGTGRMRYL+HV RRFK+GF+ G
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Q43292 60S ribosomal protein L37-23.6e-3790.12Show/hide
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Q8LEM8 60S ribosomal protein L37-34.3e-3891.36Show/hide
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Q8LFH7 60S ribosomal protein L37-14.7e-3790.12Show/hide
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Q962S7 60S ribosomal protein L371.8e-2872.84Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15250.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein3.3e-3890.12Show/hide
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AT1G52300.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein2.6e-3890.12Show/hide
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AT3G16080.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein3.0e-3991.36Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGCTTTTCCTGCTGCTCGCAAGCGCAAATATAACTGGAGTGTGAAGGCAATTAGAAGAAAGACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACTTGCGCCATGTTCCGCGTAGAT
TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTATGATGATATTTTGTTCATTGTTTATTAATATTAGAGCACAGATTTTGTTATATCAATTAGAACAGAATAGCACACTTCAGTTCCAA
CTGATTTATCAAAAACTTTACTTATGCTCTAATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTCGGGCCCGATTGTAAAAAGTGGGCCGTCCAGAAAGTGAAGCTCAAACCCTAAACGGTGTATTTCGATCATATAAAAGACCCATTTTACTTGCTGCTATCCCCATAGC
CAAACTGCATATAGAATTCTTCCGCCCTAGGGTTTCTTCGTCCTGCATCAATGGGAAAGGGTACGGGCAGTTTTGGTAAGAGGAGGAACAAGACCCATACTCTCTGTGTG
CGGTGTGGCCGCCGCAGCTTCCATCTCCAGAAGAGTCGTTGTGCAGCATGTGCTTTTCCTGCTGCTCGCAAGCGCAAATATAACTGGAGTGTGAAGGCAATTAGAAGAAA
GACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACTTGCGCCATGTTCCGCGTAGATTCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTATGATGATATTTTGTTCATTGTTTATTAATATTAGAG
CACAGATTTTGTTATATCAATTAGAACAGAATAGCACACTTCAGTTCCAACTGATTTATCAAAAACTTTACTTATGCTCTAATGATTAAACTCGTTCTTCCCCATTTACT
TTGAGCTTGTTTTTATCAACTTTTTGAGTGTTTATAAACTGTATGATTGCACTTATAAACACTTTGGAAAGTCGATTCAAACACACTCATAATTTGTTTTGGGTTTTGAT
ACCAGTTTTAGCAGTATTCTGACCGAAAAATGTTTTGGGTTTGTGATTAGGTACGGAAGCTGCACCCAGGAATAAAGGAGCTGCAGCATCAGCATAAGGTTTTGGAAGAA
GTTCAATTTAATTTCAGTACCCACCTATAGTTTTCAGTAGGGGTTTTACTCATCTGAGAATCATTTCATATAATTTTGTTTTTTCTAGTTTTTGACTTTTCATGATTTAG
TTGAACGATCGCTGTTTCTTTAAAATGTATTGTTTGAATTTTGGACAAATGATGAATCAGATTGTTCGTATTCTGCTACTTGCTTCTTCATTCTTCAGTATGCTCTATTA
CCCAACGCCCATTCGTTCCAAAGTTGCATCTGTTGGGAGAACATTGTCAAATCACTAGAATGATTAATTGGGTCATCTCGAAGGTTGTTTAATCAAAGCAAAACATTACT
TGGATATTAGAAAATCTGTTTTCTCATACTAATGCTGTTTTAAGATGGGAGCCATTTTAATTTTTAGCTATAATAACTTGTGTTATTTTTGTACTTCAACGAATTTGGTA
TAGGAACATTCAGTTCAGACATTTATTAAGATACGAAATAGGCTGCCTTAGGGAGGGGAGGGTACGAGCGAGAACTGAGGTTATTTGATATATTGACTTGAAATTTCAAG
CATAGTGTTGGAATTGTATATGAATTTTGAATTTGAAATTTTATAGAATTCAAGCTAATCTTTTAAAAGGAGTTCCTAAAAACTAATTTTGTGTTCTTTGATTAAATTGT
ATGATTGTAAACTAACAATCATTGTTTTTCAAACGAATTAACTGACAAACAACACTCTGCGGGTGGAGGATAAAATATCTGAATCAACGACAACCAAACCAACCCTTCCA
AAATGGCAATCCACCTCAAATGTGAACAAATCTAAGACACTATACAAACCACCACAACGGAAAGTTGTTAATGCTGCACAAAAACAAAAATGGGGGAAGAAGACATTTCA
GATGGTATAACCTATAGAGGGGAATAAATGCTACAATTTCCAAATGGGGAGCAGTAGTAGACTCTAAACTGGAGAAACAAAAATGTAGTTGCCGTAAAGCAAAATCCATA
TGGTGTAACGGAATGCTGGAGTGATGCTTGTCCAAGAACATAGCATGACAAAGCAAATCTTAGACATGTGCATCGAGTTTGCCAAACTTCTCCTTTCTTTCGTGCAGCTG
TTTGAAGACAGAATCAAGTTCTGGAAACAAGGTTAACAGCAATAGCTCAATGAGGTCCAGTGCCAATAGCTTCGTGCATACAGCTGACTGCAGTTTGCATTTTCACACAA
TCAAGAACAAGTCAATCCAAATTCAGCAGAGGAAAAATGAGTTTACATTGCTCATTCAATACATGCCAAATACCTGAAGGAAGTAATACAGATCCTTGGCACATTGCTCA
TACTCCTTTCGACCAACTAGCCCCACAATAGCAGGTGGAGCATTGGCTTCATTACGAAATTTCATGGTAAGTTGAGATCAAAACAGATGTTAATGTGAAAGTAACTTTAA
AATTGAGCTTGAAGTGTGAACGTACTGATCATCAAGTCATACACAAGCTTTGCACGACGATCGGCTTCTTGCTGCTGCAGTTCCTCGAGGGATCGAGGAGATAGGATCTC
GTTGGAGTTGTTGCCGGAAGTGGAACCTTCGGGTGATGGTGGTTGCTTTGGACGCTTGGTTATGAATACCCCACCAGGCCATAAAATCTATTTGATTCACATTCGTACCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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