; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsaV3_1G042000 (gene) of Cucumber (Chinese Long) v3 genome

Gene IDCsaV3_1G042000
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr1:26843483..26844614
RNA-Seq ExpressionCsaV3_1G042000
SyntenyCsaV3_1G042000
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055681.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold181G00620 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-5486.33Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPN+ LTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRV
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRV

TYK27024.1 uncharacterized protein E5676_scaffold5245G00010 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-6887.27Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPNT LTSNRSPSP SFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV+VVLERAAVCLCKIRRFKMALFSS G
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

XP_004144150.1 uncharacterized protein LOC101216009 [Cucumis sativus]3.9e-84100Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

XP_008451071.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492458 [Cucumis melo]1.4e-6887.27Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPNT LTSNRSPSP SFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV+VVLERAAVCLCKIRRFKMALFSS G
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

XP_038878738.1 uncharacterized protein LOC120070912 [Benincasa hispida]9.4e-5475.76Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MA  PR    NETY E +SSLEWSK+RK MIEEQANAEL+SLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ E PFPQP+T LTS  SPSPSS  PD+QESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKR+K+ E    GRNGLQ+EV     ESE+K+ R KDRVDVVLERAAVCLCKIRRFK ALFS+AG
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX97 Uncharacterized protein1.9e-84100Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

A0A1S3BRF0 uncharacterized protein LOC1034924586.5e-6987.27Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPNT LTSNRSPSP SFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV+VVLERAAVCLCKIRRFKMALFSS G
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

A0A5A7UQ57 Uncharacterized protein5.4e-5586.33Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPN+ LTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRV
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRV

A0A5D3DU40 Uncharacterized protein6.5e-6987.27Show/hide
Query:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC
        MAEF   KNHNETYTE+ISSLEWSKARKTMIEEQAN ELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ EHPFPQPNT LTSNRSPSP SFGPDTQESSSC
Subjt:  MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSC

Query:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG
        RKRRKV EGRN+ RNGLQ+EVA    ESE+K+GR KDRV+VVLERAAVCLCKIRRFKMALFSS G
Subjt:  RKRRKVAEGRNNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG

A0A6J1F625 uncharacterized protein LOC111441161 isoform X21.1e-3463.4Show/hide
Query:  ISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ----PEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSCRKRRKVAEGRNNG
        +  LEWS+ARK MIE+QA AEL+SLQLL+PNRFEYLKLELKSFI LLQSQ     E  F QPNT + ++R  SPS+  PD+QESSSCRKRRK+ EG    
Subjt:  ISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQ----PEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSCRKRRKVAEGRNNG

Query:  --RNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSA
           NGL++E+A  E E+  K GR +DRVDVVLERA VCL KI+RFK AL S+A
Subjt:  --RNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G36960.1 unknown protein2.2e-0835.86Show/hide
Query:  SKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSCRKRRKVAEGR---NNGRNGLQKE
        S + +  + E A  EL+ LQ  YPNRF YLK +L+SFI  L+   +H  P+           SPSS    TQESS+C  ++K  + +   +N  +     
Subjt:  SKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSCRKRRKVAEGR---NNGRNGLQKE

Query:  VAEYEYESETKMG-----RGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMAL
             +++  KMG     + K+RV++VLERA +CL KIR  K +L
Subjt:  VAEYEYESETKMG-----RGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGAATTCCCAAGAGTGAAGAACCATAACGAGACATACACGGAGAAAATCTCAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGC
CGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTCGAATACCTAAAGCTCGAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCCCAACCCGAACATCCTTTTCCTC
AGCCAAACACTAACTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCCGTCCTCTTTCGGTCCTGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGCGGAAGGAAGA
AACAATGGAAGGAATGGATTACAGAAAGAGGTTGCTGAATATGAATATGAATCTGAAACGAAGATGGGACGGGGGAAGGATAGAGTGGATGTAGTTCTGGAAAGAGCGGC
CGTTTGTCTTTGCAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTGTTTTCCTCCGCGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGAATTCCCAAGAGTGAAGAACCATAACGAGACATACACGGAGAAAATCTCAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGC
CGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTCGAATACCTAAAGCTCGAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCCCAACCCGAACATCCTTTTCCTC
AGCCAAACACTAACTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCCGTCCTCTTTCGGTCCTGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGCGGAAGGAAGA
AACAATGGAAGGAATGGATTACAGAAAGAGGTTGCTGAATATGAATATGAATCTGAAACGAAGATGGGACGGGGGAAGGATAGAGTGGATGTAGTTCTGGAAAGAGCGGC
CGTTTGTCTTTGCAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTGTTTTCCTCCGCGGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAEFPRVKNHNETYTEKISSLEWSKARKTMIEEQANAELQSLQLLYPNRFEYLKLELKSFIHLLQSQPEHPFPQPNTNLTSNRSPSPSSFGPDTQESSSCRKRRKVAEGR
NNGRNGLQKEVAEYEYESETKMGRGKDRVDVVLERAAVCLCKIRRFKMALFSSAG