; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsaV3_3G012000 (gene) of Cucumber (Chinese Long) v3 genome

Gene IDCsaV3_3G012000
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationchr3:9278138..9279475
RNA-Seq ExpressionCsaV3_3G012000
SyntenyCsaV3_3G012000
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-10987.14Show/hide
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-1637.67Show/hide
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             S+ P  TL  +       +     A+DMAH+LPLHPLLAQPP  P   T NR+                   W                      
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.1e-7466.67Show/hide
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        PP+W++YFHGQASASREPQ+TLN+ LTMPP     SLRSY    +DMAH LPLHPLLAQPPP  R +TAN +    N+  AG R QGNQ Q NNGG R  
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          + A+E+ QP Q+VIDLNS EENDCSSD S+GLDLTLSL
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]2.1e-131100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein1.0e-131100Show/hide
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein1.9e-10987.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCTTCCTCCTTCAACCTCCTCTCTTTGCTCTGTTTTTCCTCACATCCTTCTCTCCTTCTTTGTCTTTTCCAAGGAATTCTTCCTCCTTTGGTGAATCAAGCTCCAA
CCCATCACTCAACAACATGTTGTTCACCTCCAGCGAGTCTTCCGGCAGGCCGTCCCGCCGAAAAAACACAATTTTTGGTGCCCCTTGTGGGCTCTGTGGCCAAGTCATTT
TTGGCTCTGAAGCTCTTAATCATCATTACAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTAGAGGCCACTCTAATCCTTCCTCCGGTATCTCTCAACGGCCGCCG
TTATGGTCCAATTATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTGACGATGCCGCCGTCTTTGAGAAGCTATTCAGGCGCCGC
CATTGATATGGCTCACTTTCTTCCGCTCCATCCATTGTTGGCTCAACCGCCGCCTCTGCCGCGCACCAGCACCGCCAATAGAATGAACTTTCAACAGAATCAGGCTGTGG
CAGGGCATAGGAGGCAGGGAAACCAAGTCCAATGGAATAATGGCGGAGTGAGGGAAGTTGGTGGCCAGCCGGCGTCAGAAGAGCAGCCACCCCAAGATGTGATAGATCTA
AACAGTGAGGAGAATGATTGTAGCTCTGATGATTCAGAAGGCTTGGATTTGACACTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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