; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CsaV3_7G024690 (gene) of Cucumber (Chinese Long) v3 genome

Gene IDCsaV3_7G024690
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionExtensin like
Genome locationchr7:13764349..13765544
RNA-Seq ExpressionCsaV3_7G024690
SyntenyCsaV3_7G024690
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068050.1 hypothetical protein E6C27_scaffold4741G00020 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-3160.77Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKS-PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYL
        MQGK+GPP+M+SLVI+VLVVALSLSY TT QA++DSYSSTLTF DHD                  H         KS PPPPP KRKSPPPPPPKR+EYL
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKS-PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYL

Query:  SPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSA
        SPPPPP     K  PPPPPK+  PP P+KS PPPPP+K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK E++ Y               PPPPPP+KHKDKS 
Subjt:  SPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSA

Query:  LHHDPLTIN
        LHHDPLTIN
Subjt:  LHHDPLTIN

KAB2635169.1 hypothetical protein D8674_025703 [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]6.4e-1263.83Show/hide
Query:  HHYKSPPPP---PYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSP
        +HYKSPPPP   PY  KSPPPPPPK+  +   PPPP  K    KSPPPPPK     KSPPPP K     KSPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H Y SP
Subjt:  HHYKSPPPP---PYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS
        PPPP K  + Y SPPPPPKK  H Y SPPPPPPKK H  KS
Subjt:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS

KAG8633302.1 hypothetical protein MANES_18G090116v8 [Manihot esculenta]9.0e-1459.57Show/hide
Query:  DHHHYKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQ--DNKSPPPPPPKKDEHE
        +H+ YKSPPPPP    YK KSPPPPP +  +Y SPPPPPP +    KSPPPPPK     KSPPPPPK     KSPPPPP K+    KSPPPPP +K+ ++
Subjt:  DHHHYKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQ--DNKSPPPPPPKKDEHE

Query:  YSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHK
        Y SPPPPPK+ EH  Y  PPPP K+ ++Y SPPPPPP  HK
Subjt:  YSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHK

XP_011659754.2 extensin-3-like [Cucumis sativus]1.4e-91100Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLS
        MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLS
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLS

Query:  PPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDP
        PPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDP
Subjt:  PPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDP

Query:  LTIN
        LTIN
Subjt:  LTIN

XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]3.6e-1563.83Show/hide
Query:  HHHYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPP-----KKSPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQ-DNKSPPPPPPKKDEH
        H+ YKSPPPPP K+    KSPPPPPPK+  EY SPPPPPP      K  PPPPPKK       PPPPPK     KSPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  +
Subjt:  HHHYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPP-----KKSPPPPPKK------SPPPPPK-----KSPPPPPKKQ-DNKSPPPPPPKKDEH

Query:  EYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        EY SPPPPP K  ++Y SPPPPP K  +EY SPPPPPPKKH
Subjt:  EYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251U7B1 Putative extensin 36.9e-1250.3Show/hide
Query:  DHHHYKSPPPPPYKR------------KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK-------------------KSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSP
        +H+ YKSPPPPP K+            KSPPPPPPK       PPPPPPKKSPPPPPK                   KSPPPPPKKSPPPPPK       
Subjt:  DHHHYKSPPPPPYKR------------KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK-------------------KSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSP

Query:  PPPPPKKDEHEYSSP--------PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
        PPPPP K+ + Y SP        PPPP K  + Y SPPPPP K+ + Y SPPPPPPKK       HH
Subjt:  PPPPPKKDEHEYSSP--------PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH

A0A5A7VLF0 Uncharacterized protein7.9e-3260.77Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKS-PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYL
        MQGK+GPP+M+SLVI+VLVVALSLSY TT QA++DSYSSTLTF DHD                  H         KS PPPPP KRKSPPPPPPKR+EYL
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKS-PPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYL

Query:  SPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSA
        SPPPPP     K  PPPPPK+  PP P+KS PPPPP+K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK E++ Y               PPPPPP+KHKDKS 
Subjt:  SPPPPPPP---KKSPPPPPKKSPPPPPKKS-PPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSA

Query:  LHHDPLTIN
        LHHDPLTIN
Subjt:  LHHDPLTIN

A0A5J5BV08 Uncharacterized protein1.5e-1158.21Show/hide
Query:  HHYKSPPPPP--YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPP-----KKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDNK-SPPPPPPKKDEHEYSSPPP
        ++YKSPPPP   YK KSPPPPPPK+  Y   PPPP P    KSPPPP      K  PPPPPK     KSPPPPP K+  K   PPPPP K+ ++Y SPPP
Subjt:  HHYKSPPPPP--YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPP---KKSPPPPP-----KKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDNK-SPPPPPPKKDEHEYSSPPP

Query:  PPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        PP K+ ++Y SPPPPP K+ ++Y SPPPPPPK+H
Subjt:  PPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

A0A5N5I5S1 Uncharacterized protein3.1e-1263.83Show/hide
Query:  HHYKSPPPP---PYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSP
        +HYKSPPPP   PY  KSPPPPPPK+  +   PPPP  K    KSPPPPPK     KSPPPP K     KSPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H Y SP
Subjt:  HHYKSPPPP---PYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS
        PPPP K  + Y SPPPPPKK  H Y SPPPPPPKK H  KS
Subjt:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK-HKDKS

A0A7I8L3Z0 Hypothetical protein1.0e-1056.85Show/hide
Query:  HHHYKSPPPPP-----YKRKSPPPPPPKRDEYL--SPPPPPPPK----KSPPPPP--------KKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN---KSPPPPPP
        H++YKSPPPPP     Y  KSPPPPPP ++ Y+  SPPPPPP K    KSPPPPP        K  PPPPPK     KSPPPPP  +++   KSPPPPPP
Subjt:  HHHYKSPPPPP-----YKRKSPPPPPPKRDEYL--SPPPPPPPK----KSPPPPP--------KKSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDN---KSPPPPPP

Query:  KKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        KK  +  S PPPPP K  + Y SPPPPPKK  +  S PPPPPPK+H
Subjt:  KKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.4e-0459.46Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD
        SPPPP Y   SPPPPPP      SPPPPPPP   PPPPP  SPPPPP   PPPPP       SPPPPPP      YS PPPPP       YSPPPPP   
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD

Query:  EHEYSSPPPPP
           YSSPPPPP
Subjt:  EHEYSSPPPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein2.5e-0659.5Show/hide
Query:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        Y SPPPPPY  KSPPPPP     Y SPPPPP   KSPPPPP    SPPPPP   KSPPPPP      SPPPPP     P    + YSSPPPPP    + Y
Subjt:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP
         SPPPPP    + YSSPPPPP
Subjt:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.5e-0659.5Show/hide
Query:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        Y SPPPPPY  KSPPPPP     Y SPPPPP   KSPPPPP    SPPPPP   KSPPPPP      SPPPPP     P    + YSSPPPPP    + Y
Subjt:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP
         SPPPPP    + YSSPPPPP
Subjt:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.6e-0659.46Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD
        SPPPP Y   SPPPPPP      SPPPPPPP   PPPPP  SPPPPP   PPPPP       SPPPPPP      YS PPPPP       YSPPPPP   
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD

Query:  EHEYSSPPPPP
           YSSPPPPP
Subjt:  EHEYSSPPPPP

AT5G07740.1 actin binding6.9e-0454.92Show/hide
Query:  HHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK---SPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSP
        H   SPPPP Y   SPPPPPP    Y SPPPPPPP     SPPPPP   PPPP   SPPPPP    +  SPPPPPP    H  S PPPPP    H   +P
Subjt:  HHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK---SPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSP

Query:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        PPPP    H  + PPPPPP  H
Subjt:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTGTAATGCTATCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTGGCTCTAAGCCTATCGTATACAACAACTGCTCAAGCCCACCGGGAT
TCCTACTCTTCAACACTTACTTTCAACGATCACGATCATGACCACGATCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGATCACGATCACGATCAC
GATCATCACCATTACAAGTCTCCACCCCCACCTCCATACAAACGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCA
CCACCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCACCAAAAAAGCAGGATAACAAGTCACCACCT
CCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTACTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGAC
GAACATGAGTACTCCTCTCCTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTCCACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTGTAATGCTATCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTGGCTCTAAGCCTATCGTATACAACAACTGCTCAAGCCCACCGGGAT
TCCTACTCTTCAACACTTACTTTCAACGATCACGATCATGACCACGATCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGATCACGATCACGATCAC
GATCATCACCATTACAAGTCTCCACCCCCACCTCCATACAAACGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCA
CCACCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCACCAAAAAAGCAGGATAACAAGTCACCACCT
CCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTACTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGAC
GAACATGAGTACTCCTCTCCTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTCCACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPP
PPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN