CuGenDBv2

Gene ID	Csor.00g010260
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
Description	Tic22-like family protein
Genome location	Csor_Chr15:8557321..8560000
RNA-Seq Expression	Csor.00g010260
Synteny	Csor.00g010260
Gene Ontology terms	GO:0009536 - plastid (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6579366.1 hypothetical protein SDJN03_23814, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.04e-146

100

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        IKCARGR
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KAG6605742.1 hypothetical protein SDJN03_03059, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.76e-79

71.2

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        FFTDLGDA    +              D AYEHFKEK HLFQFIPNEKQVKAANK             IDGVPVF A NL+IAIATTDG++
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KAG7016851.1 hypothetical protein SDJN02_21962, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

7.27e-85

73.3

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        KKMFSTITKSERNGPMFRFFTDLGDA M                +EK HLFQFIPNEKQVKAANK             IDGVPVF AHNLNIAIATTDGI
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        K  R R
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XP_038874545.1 uncharacterized protein LOC120067161 isoform X1 [Benincasa hispida]

1.26e-81

75.39

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        FFTDLGDA    +              D AYEHFKEK HLFQFIPNEKQVKAANK             IDGVPVF A NL+IAIATTDGIK
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XP_038874546.1 uncharacterized protein LOC120067161 isoform X2 [Benincasa hispida]

1.09e-81

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        FFTDLGDA    +              D AYEHFKEK HLFQFIPNEKQVKAANK             IDGVPVF A NL+IAIATTDGIK
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6A6MTN3 Uncharacterized protein

1.50e-72

70.37

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        ST  D  SSKSAAV  LSS AE  SGFPST+RI+GL S+GK GGPAFVGQVFSMCDLSGTGLMAVSTHFDIPFISKR PEWLKK+F+T+TKSERNGP+FR
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        FF DLGDA     R     G       D AYEHFKEK HLFQF+PNEKQVKAAN           K+DGVPVF A NL+IAIAT DGIK
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A0A6J1DXS3 uncharacterized protein LOC111024477

1.97e-78

73.3

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        S H    SSKSAAV  L S AEF+SGFPSTLRISGLNSDGK GGPAFVGQVFSMCDLSGTGLMAVSTHFDIPFISKR PEWLKKMFSTITKSERNGP+FR
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        FFTDLGDA    +              D AYEHFKEK HLFQFIP+EKQVKAANK             IDGVPVF A NL+IAIATTDGIK
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A0A6J1H266 uncharacterized protein LOC111459695

8.78e-77

71.2

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A0A6J1K5H1 uncharacterized protein LOC111491342

3.14e-77

71.73

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B9RIR7 Uncharacterized protein

1.03e-72

70.16

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        STH D  S KSAAV  LSS AE +SGFPST+RI+GLNS+GK GGPAFVGQVFSMCDLSGTGLMAVSTHFDIPFISKR PEWLKK+F+T+TKSER GP+FR
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        FF DLGDA     R     G       D AYEHFKEK HLFQF+PNEKQVKAAN             K+DGVPVF A NL+IAIATTDGIK
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G62650.1 Tic22-like family protein

1.3e-58

63.54

Show/hide

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        FS   D+ S   + V + SS +  +SG  ST+RIS L+SDGK GGPAFVGQVFSMCDL+GTGLMAVSTHFDIPFISKR PEWLKKMFSTITKSERNGP+F
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        RFF DLGDA    +              D AYEHFKEK HLFQF+PNE+QVKAAN             K++GVPVFGA NL+IA+AT DGIK
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTGATTTACACGCTCAATGAAGCTCACCCACTCAGAGCTAGAATGAATGTTGCTACTAAAGTTAACACAGCAGGTCGCATCAGAAGGAATTTCTCAACTCAT
CGTGACCTCCACTCCTCCAAATCCGCCGCTGTCAACGCTTTGTCGTCTCCGGCCGAGTTTACCTCCGGTTTTCCATCCACACTCAGGATTTCAGGGCTCAATTCG
GATGGAAAACCTGGCGGCCCCGCATTTGTAGGCCAGGTCTTCAGTATGTGCGACCTTTCTGGGACTGGTCTTATGGCCGTCTCGACCCACTTCGACATTCCTTTC
ATTTCTAAAAGAATACCAGAGTGGCTTAAGAAGATGTTCTCAACCATTACTAAGAGTGAAAGAAATGGCCCCATGTTCCGCTTCTTTACTGATTTAGGCGATGCA
GGTATGAAATTCCGCTTCTTTACTGATTTAGGCGATGCAGCATATGAGCATTTCAAGGAAAAACGTCATCTATTTCAGTTCATTCCAAATGAGAAGCAAGTTAAA
GCAGCAAACAAGATCGATGGCGTTCCTGTTTTCGGTGCCCATAACTTGAATATTGCAATAGCAACTACTGATGGGATAAAGTGCGCCAGAGGGAGATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLIYTLNEAHPLRARMNVATKVNTAGRIRRNFSTHRDLHSSKSAAVNALSSPAEFTSGFPSTLRISGLNSDGKPGGPAFVGQVFSMCDLSGTGLMAVSTHFDIPF
ISKRIPEWLKKMFSTITKSERNGPMFRFFTDLGDAGMKFRFFTDLGDAAYEHFKEKRHLFQFIPNEKQVKAANKIDGVPVFGAHNLNIAIATTDGIKCARGR

Csor.00g010260 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome