; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g022320 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g022320
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationCsor_Chr04:3284465..3285790
RNA-Seq ExpressionCsor.00g022320
SyntenyCsor.00g022320
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600467.1 hypothetical protein SDJN03_05700, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.94e-307100Show/hide
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XP_023549710.1 uncharacterized protein LOC111808127 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.62e-30298.41Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.68e-24182.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein8.17e-23379.49Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like1.84e-24182.39Show/hide
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A0A6J1FVC0 uncharacterized protein LOC1114476203.63e-30298.19Show/hide
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A0A6J1IXV4 uncharacterized protein LOC1114802063.07e-29697.05Show/hide
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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.131.51e-24081.96Show/hide
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        KSE NPRST  +DHHPTA RVGRSPMR  PGES+  RL  IRGVSVDSPR+NS GKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPK KNRG ERSYSANVR+TPVLNVP
Subjt:  KSEMNPRST--MDHHPTATRVGRSPMRPAPGEST--RLA-IRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLKNRGTERSYSANVRITPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSSSSSSTNRTTTRRIMETDGGGKLH
        VCSSLRGSSKS SVFGFG LF  TGT G  RS+QSSSSSSSTNRTTTRRI ETDGGGK+H
Subjt:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSSSSSSTNRTTTRRIMETDGGGKLH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein3.6e-6645.48Show/hide
Query:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL
        MASACV + G+SPE F         SYGW SPR+S +RDD+  S++    + K  +DP    EI+D      PV +FEF L+DPV  ML ADELF +GKL
Subjt:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL

Query:  VPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPE-----TAAQSRREVEAECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKAL
        VP + S  K +     +    ++ E        +S R +E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L     N   + E+ K +S S ++   + + 
Subjt:  VPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPE-----TAAQSRREVEAECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKAL

Query:  RYLLHRRSKSSLSSSFESSLNLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNTNPISLHR-NPNNSNPPRMRQVKPRPKSEMNP
        +  LHR SKSS ++S       PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE++DL RL LD + KP+ NP +  R +  N N PR+R  KPR       
Subjt:  RYLLHRRSKSSLSSSFESSLNLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNTNPISLHR-NPNNSNPPRMRQVKPRPKSEMNP

Query:  RSTMDHHPTATRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLK-NRGTERSYSANVRITPVLNVPVCSSLRGSSK
            +H P+   V  S    A  ES  L    V+ DSPR+N+ GKIVFH LERSSSSP SF GGP++K + G  RSYSANVRITPVLNVPVCS   G   
Subjt:  RSTMDHHPTATRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLK-NRGTERSYSANVRITPVLNVPVCSSLRGSSK

Query:  SVSVFGFGQLFSSTGTSGSS-------RSYQSSSSSSSTNRT
              FGQLFSS+ +S SS          QS+ S +  NRT
Subjt:  SVSVFGFGQLFSSTGTSGSS-------RSYQSSSSSSSTNRT

AT1G79060.1 unknown protein1.4e-7046.21Show/hide
Query:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL
        MAS CVNN+ +S +           +YG  +PR SFSRDD   S+                SEI   +   V   +FEFRL++    MLPADELF +GKL
Subjt:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL

Query:  VPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPETAAQSRR----EVEAECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKALR
        V  Q                  + E   + RR    E+E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS  S  T    TT+P     +++ +L+
Subjt:  VPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPETAAQSRR----EVEAECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKALR

Query:  YLLHRRSKSSLSSSFESSL-NLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNTNPISLHRNPNNSNPPRMRQVKPRPKSEMNPRST
          LHR S+SS SSS  S L +LPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+ EDL RL LD E     + I+L+ N   +     R + P P     PR  
Subjt:  YLLHRRSKSSLSSSFESSL-NLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNTNPISLHRNPNNSNPPRMRQVKPRPKSEMNPRST

Query:  MDHHPTA----TRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-LKNRGTERSYSANVRITPVLNVPVCSSLRGSS
        + +H T+     RVGRSPMR + GE++ +  RGVSVDSPR+NS GKIVF NLERSSSSPSSFNGG    ++RG ERSYS+NVR+TPVLNVPVC S+RG S
Subjt:  MDHHPTA----TRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-LKNRGTERSYSANVRITPVLNVPVCSSLRGSS

Query:  KSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSSSSS-------STNRTTTRRI
               FGQ FSS+ +S SS++ ++ ++++       S  R +T RI
Subjt:  KSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSSSSS-------STNRTTTRRI

AT3G05980.1 unknown protein1.0e-0431.28Show/hide
Query:  LSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVA--LMLPADELFLNGKLVPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPETA
        L PRISFS D S     +   IT        E  ++ S    V VS+FEF   + V+   ML ADELF  GKL+PF    VK S   LK++   ++ E  
Subjt:  LSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVA--LMLPADELFLNGKLVPFQVSSVKPSVNVLKSMRCVSSPETA

Query:  AQSRR-EVEAE--------------CSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNG------SGKTENHKTTSPSYASEANSKALRYLLHRRSKSS
        A+ R+ EV+ +                 DP   SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+       S  + +  T+S S   +A  +  +    +R K  
Subjt:  AQSRR-EVEAE--------------CSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNG------SGKTENHKTTSPSYASEANSKALRYLLHRRSKSS

Query:  LSSSFESSLNL
        L  +  +S+ +
Subjt:  LSSSFESSLNL

AT3G12970.1 unknown protein9.8e-5641.32Show/hide
Query:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL
        MAS CV N+G SP            S+ W S ++S +R+  P +             PA E+E         PV +FEF L+DPV  ML ADELF +GKL
Subjt:  MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKL

Query:  VPFQVSSV-----KPSVNVLKSMRCVSSPETAAQSRREVEAECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSK
        VP + S V     KP  +V+          TA +  R +E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L ++    S  + +  ++S   +    + 
Subjt:  VPFQVSSV-----KPSVNVLKSMRCVSSPETAAQSRREVEAECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSK

Query:  ALRYLLHRRSKSSLSSSFESSLNLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNT-NPISL-----HRNPNNSNPPRMRQVK
        + R+ L+R SKS+     +   + P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHEL+DL RL LD +NKP T NP +      H +  N N PR    K
Subjt:  ALRYLLHRRSKSSLSSSFESSLNLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNT-NPISL-----HRNPNNSNPPRMRQVK

Query:  PRPKSEMNPRSTMDHHPTATRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLK-NRGTERSYSANVRITPVLNVPV
        PR  ++++  +                      S    +  V+ DSPR+N+ GKIVFH LERSSSSP +F GGP++K + G  RS+SANVRITPVLNVPV
Subjt:  PRPKSEMNPRSTMDHHPTATRVGRSPMRPAPGESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLK-NRGTERSYSANVRITPVLNVPV

Query:  CSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSS---SSSSTNRTTTRRIMET
         SSLR   KS  +F FGQLF+S+ ++ SS S  + +   S++  NRT   R+  T
Subjt:  CSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSS---SSSSTNRTTTRRIMET

AT5G19340.1 unknown protein8.7e-0429.41Show/hide
Query:  PRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKLVPF-QVS--------SVKPSVNVLKSM--RC
        PRISFS D S   ++   +   P  +     E  + D   V   +FEF  ++  A ML ADELF  GKL+PF QV         ++KP V V +      
Subjt:  PRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKLVPF-QVS--------SVKPSVNVLKSM--RC

Query:  VSSPETAAQSRREVEAE-------------CSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKA
        V + E    ++ +                    DP   SP+ P+C+  W+ELL LKK  Q ++  +  +    + SPS +S + S +
Subjt:  VSSPETAAQSRREVEAE-------------CSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAACATCGGAATGTCGCCGGAGAATTTCCTCGATTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCTTACGGCTGGCTCAGCCCTCGCATCTCC
TTCAGCCGCGACGACTCCCCGCCTTCTACTAACCTCGCCGGACTTATAACTAAGCCTGCCGCTGACCCGGCCGGAGAGTCTGAGATTCGAGATTCGGATCCTGAA
CTAGTGCCGGTCAGTGAGTTCGAGTTCCGCCTTCAAGATCCCGTCGCCTTGATGCTCCCGGCGGATGAGCTGTTTCTGAATGGAAAACTCGTGCCATTTCAGGTC
TCGTCTGTTAAACCCTCGGTCAACGTTTTGAAGTCGATGAGGTGCGTTTCCTCGCCGGAAACTGCGGCTCAGTCCCGCCGGGAAGTTGAGGCAGAATGCAGTACG
GATCCATATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAGAAACTGTACCAGAGCAGCAGCAATGGCAGCGGCAAA
ACCGAAAATCACAAAACGACGTCGCCGTCTTACGCCTCGGAAGCCAATTCTAAGGCGCTGAGGTATTTACTTCACCGGCGTTCGAAATCGTCGTTATCGTCTTCG
TTCGAATCGTCACTGAACCTTCCACTGTTGAAGGACTCCGATAGTGAGTCTGTTTCGCTATCTTCTTCCCGCGTATCTCTTTCCTCGTCTTCCTCAGGTCACGAA
CTCGAAGATCTTCACAGACTCCCGCTGGATTGGGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCTCTCCATCGGAACCCTAACAATAGCAATCCACCGCGAATGAGA
CAGGTGAAACCTCGGCCTAAATCGGAGATGAATCCAAGATCAACAATGGATCATCATCCGACGGCAACGAGAGTAGGTAGAAGCCCAATGCGGCCTGCGCCGGGA
GAATCCACTAGATTAGCGATCCGAGGAGTATCCGTAGACAGTCCAAGAATTAACTCCTGTGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCA
AGCAGCTTCAATGGCGGACCAAAACTGAAGAACAGAGGAACGGAAAGGTCATATTCAGCGAACGTGAGAATAACTCCAGTCCTTAACGTTCCAGTCTGTTCTTCC
CTGAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTGTTCGGATTCGGTCAACTATTCTCCAGTACCGGCACCAGCGGAAGCAGTAGAAGCTACCAGAGTAGCAGCAGTAGT
AGTAGCACTAACCGGACGACGACAAGGCGGATCATGGAAACAGACGGCGGAGGAAAACTCCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAACATCGGAATGTCGCCGGAGAATTTCCTCGATTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCTTACGGCTGGCTCAGCCCTCGCATCTCC
TTCAGCCGCGACGACTCCCCGCCTTCTACTAACCTCGCCGGACTTATAACTAAGCCTGCCGCTGACCCGGCCGGAGAGTCTGAGATTCGAGATTCGGATCCTGAA
CTAGTGCCGGTCAGTGAGTTCGAGTTCCGCCTTCAAGATCCCGTCGCCTTGATGCTCCCGGCGGATGAGCTGTTTCTGAATGGAAAACTCGTGCCATTTCAGGTC
TCGTCTGTTAAACCCTCGGTCAACGTTTTGAAGTCGATGAGGTGCGTTTCCTCGCCGGAAACTGCGGCTCAGTCCCGCCGGGAAGTTGAGGCAGAATGCAGTACG
GATCCATATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAGAAACTGTACCAGAGCAGCAGCAATGGCAGCGGCAAA
ACCGAAAATCACAAAACGACGTCGCCGTCTTACGCCTCGGAAGCCAATTCTAAGGCGCTGAGGTATTTACTTCACCGGCGTTCGAAATCGTCGTTATCGTCTTCG
TTCGAATCGTCACTGAACCTTCCACTGTTGAAGGACTCCGATAGTGAGTCTGTTTCGCTATCTTCTTCCCGCGTATCTCTTTCCTCGTCTTCCTCAGGTCACGAA
CTCGAAGATCTTCACAGACTCCCGCTGGATTGGGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCTCTCCATCGGAACCCTAACAATAGCAATCCACCGCGAATGAGA
CAGGTGAAACCTCGGCCTAAATCGGAGATGAATCCAAGATCAACAATGGATCATCATCCGACGGCAACGAGAGTAGGTAGAAGCCCAATGCGGCCTGCGCCGGGA
GAATCCACTAGATTAGCGATCCGAGGAGTATCCGTAGACAGTCCAAGAATTAACTCCTGTGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCA
AGCAGCTTCAATGGCGGACCAAAACTGAAGAACAGAGGAACGGAAAGGTCATATTCAGCGAACGTGAGAATAACTCCAGTCCTTAACGTTCCAGTCTGTTCTTCC
CTGAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTGTTCGGATTCGGTCAACTATTCTCCAGTACCGGCACCAGCGGAAGCAGTAGAAGCTACCAGAGTAGCAGCAGTAGT
AGTAGCACTAACCGGACGACGACAAGGCGGATCATGGAAACAGACGGCGGAGGAAAACTCCATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNIGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRISFSRDDSPPSTNLAGLITKPAADPAGESEIRDSDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLNGKLVPFQV
SSVKPSVNVLKSMRCVSSPETAAQSRREVEAECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGSGKTENHKTTSPSYASEANSKALRYLLHRRSKSSLSSS
FESSLNLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHELEDLHRLPLDWENKPNTNPISLHRNPNNSNPPRMRQVKPRPKSEMNPRSTMDHHPTATRVGRSPMRPAPG
ESTRLAIRGVSVDSPRINSCGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKLKNRGTERSYSANVRITPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSSTGTSGSSRSYQSSSSS
SSTNRTTTRRIMETDGGGKLH