; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g048370 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g048370
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2
Genome locationCsor_Chr11:4676683..4681814
RNA-Seq ExpressionCsor.00g048370
SyntenyCsor.00g048370
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588231.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.93e-269100Show/hide
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KAG7022145.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.19e-26899.74Show/hide
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A0A6J1EBH9 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X31.60e-26698.97Show/hide
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A0A6J1EEX9 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X18.23e-26294.61Show/hide
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A0A6J1IF73 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X23.47e-25893.63Show/hide
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Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A2.9e-0845.45Show/hide
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Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A5.1e-3737.43Show/hide
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         V+RE+N GIA V+RM+ER++    R   S   S
Subjt:  EVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESS

Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022901.5e-0745.45Show/hide
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        +D C  CLE +   +P  +T C H FHL C+ EW +RS  CP+C
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Q93ZF6 E3 ubiquitin-protein ligase AIRP17.2e-0748.84Show/hide
Query:  DACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMC
        D C ICLE +   +P  +T C H+FHL C+L W +RS  CP+C
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Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A1.3e-11260.78Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ +SLKDPTSQ LLEAVEQER+FR NP RN+
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Query:  TIFRHPTFGDFELQHLPAGADDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSPPNSSSTSPLPRDNREGEAASRIMVATVS--P
        TIFRHPT GDFELQHLP G D+A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SP P        + R    TVS  P
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Query:  PQPAGEESPQLNASASPVQTDQSSPSAPQYSSRSASQLGSPSSDRRSTSQPVPSSQDRAGPSSELQSLSDSLKSRFNAMSMRYKDSIAKSTRGWKEKLFS
            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  PS QDRAGP SELQS S+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR WK++LFS
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Query:  RNTSMSDIGSEVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESSNVGDNNPVSESNDRRTPKNGGNNPLSVSNKEGSCPAESSSS
        RNTSM+D+GSEV+REV+ GIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V +N+    +N+      G  + ++    + +C   S SS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00335.1 RING-H2 finger B1A2.1e-0945.45Show/hide
Query:  DACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPVSLKD
        D  +D C IC E++   +P   T C+HEFHL C+LEW +RS +CP+C + V   D
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AT4G14220.1 RING-H2 group F1A3.6e-3837.43Show/hide
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        +S+A  V     +  DDACSICLE F   DPST+TSCKHE+HLQC++EW QRS +CP+CWQ   L+DP SQ LL AVE+ER  +   + +S+ I  H + 
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Query:  GDFELQHLPAGADDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSPPNSSSTSPLPRDNREGEAASRIMVATVSPPQPAGEESPQ
         DF  +     +  +  +E+ L+HL  AA     R   RR   +  S        LV SS P +   + L    R   A S +     +P    G  +P 
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Query:  LNASASPVQTDQSSPSAPQYSSRSASQLGSPSSDRRSTSQPVPSSQDRAGPSSELQSLSDSLKSRFNAMSMRYKDSIAKSTRGWKEKLFSRNTSMSDIGS
             SPV    S P+     SR      SP         P PS   ++  S E  SL +++KS+  A S +YK+SI+KS +G KEKL +RN S+ ++  
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Query:  EVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESS
         V+RE+N GIA V+RM+ER++    R   S   S
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AT5G22000.1 RING-H2 group F2A9.1e-11460.78Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ +SLKDPTSQ LLEAVEQER+FR NP RN+
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        TIFRHPT GDFELQHLP G D+A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SP P        + R    TVS  P
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            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  PS QDRAGP SELQS S+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR WK++LFS
Subjt:  PQPAGEESPQLNASASPVQTDQSSPSAPQYSSRSASQLGSPSSDRRSTSQPVPSSQDRAGPSSELQSLSDSLKSRFNAMSMRYKDSIAKSTRGWKEKLFS

Query:  RNTSMSDIGSEVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESSNVGDNNPVSESNDRRTPKNGGNNPLSVSNKEGSCPAESSSS
        RNTSM+D+GSEV+REV+ GIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V +N+    +N+      G  + ++    + +C   S SS
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AT5G22000.2 RING-H2 group F2A3.5e-11360.68Show/hide
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        T  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ +SLKDPTSQ LLEAVEQER+FR NP RN+T
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        IFRHPT GDFELQHLP G D+A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SP P        + R    TVS  P 
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           GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  PS QDRAGP SELQS S+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR WK++LFSR
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Query:  NTSMSDIGSEVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESSNVGDNNPVSESNDRRTPKNGGNNPLSVSNKEGSCPAESSSS
        NTSM+D+GSEV+REV+ GIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V +N+    +N+      G  + ++    + +C   S SS
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AT5G22000.3 RING-H2 group F2A9.1e-11460.78Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ +SLKDPTSQ LLEAVEQER+FR NP RN+
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Query:  PQPAGEESPQLNASASPVQTDQSSPSAPQYSSRSASQLGSPSSDRRSTSQPVPSSQDRAGPSSELQSLSDSLKSRFNAMSMRYKDSIAKSTRGWKEKLFS
            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  PS QDRAGP SELQS S+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR WK++LFS
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Query:  RNTSMSDIGSEVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESSNVGDNNPVSESNDRRTPKNGGNNPLSVSNKEGSCPAESSSS
        RNTSM+D+GSEV+REV+ GIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V +N+    +N+      G  + ++    + +C   S SS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCTCCAACGATGGACGAAACTAAGAATTCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCAGCTTTTGTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGACGCTTGC
AGTATATGTCTTGAAAACTTCTGTGACAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAACATGAGTTTCATCTGCAGTGCGTTCTTGAGTGGTGTCAGAGAAGCTCC
CAATGCCCCATGTGTTGGCAACCTGTTAGTCTGAAGGATCCAACCAGTCAGGGGTTGCTCGAAGCAGTAGAACAAGAGAGAAGTTTTAGACTTAATCCAGTTAGA
AACTCAACAATATTTCGCCATCCCACTTTTGGTGACTTTGAGTTACAGCATCTGCCAGCTGGTGCTGATGATGCTGACCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACCTA
GCTGCTGCAGCTGCCATGGGACAAGCTCGCCATAGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGACATCGGTCAGGAATTCATGGCCGTCCCCAATTGTTGGTGTTTTCTTCC
CCTCCTAATTCTTCATCGACCTCTCCACTTCCTCGTGACAATCGGGAAGGTGAAGCAGCCTCAAGAATCATGGTAGCTACTGTATCACCACCTCAACCTGCTGGA
GAAGAGTCTCCACAACTCAATGCTTCAGCATCTCCCGTGCAAACTGATCAGTCTTCTCCATCAGCACCTCAATACAGTTCACGTTCTGCCAGCCAACTTGGATCT
CCTTCGAGCGATAGGAGATCCACCAGTCAACCAGTGCCAAGTAGTCAAGATAGAGCCGGACCATCATCAGAATTGCAATCACTCTCGGATTCACTGAAGTCTCGA
TTTAATGCAATGTCAATGAGATACAAAGATTCAATCGCAAAGAGCACAAGAGGCTGGAAGGAGAAATTGTTCTCTCGCAATACTTCAATGTCAGATATTGGCTCT
GAGGTTAGAAGAGAGGTTAATGTTGGAATAGCAACGGTATCGCGCATGATGGAACGTCTTGAAACAAGAGATGCTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAAT
GTAGGGGATAACAACCCGGTTTCGGAATCAAATGATAGACGGACACCAAAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGCGTCTCAAATAAAGAAGGTTCATGCCCTGCA
GAATCCAGTTCAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTCTCCAACGATGGACGAAACTAAGAATTCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCAGCTTTTGTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGACGCTTGC
AGTATATGTCTTGAAAACTTCTGTGACAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAACATGAGTTTCATCTGCAGTGCGTTCTTGAGTGGTGTCAGAGAAGCTCC
CAATGCCCCATGTGTTGGCAACCTGTTAGTCTGAAGGATCCAACCAGTCAGGGGTTGCTCGAAGCAGTAGAACAAGAGAGAAGTTTTAGACTTAATCCAGTTAGA
AACTCAACAATATTTCGCCATCCCACTTTTGGTGACTTTGAGTTACAGCATCTGCCAGCTGGTGCTGATGATGCTGACCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACCTA
GCTGCTGCAGCTGCCATGGGACAAGCTCGCCATAGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGACATCGGTCAGGAATTCATGGCCGTCCCCAATTGTTGGTGTTTTCTTCC
CCTCCTAATTCTTCATCGACCTCTCCACTTCCTCGTGACAATCGGGAAGGTGAAGCAGCCTCAAGAATCATGGTAGCTACTGTATCACCACCTCAACCTGCTGGA
GAAGAGTCTCCACAACTCAATGCTTCAGCATCTCCCGTGCAAACTGATCAGTCTTCTCCATCAGCACCTCAATACAGTTCACGTTCTGCCAGCCAACTTGGATCT
CCTTCGAGCGATAGGAGATCCACCAGTCAACCAGTGCCAAGTAGTCAAGATAGAGCCGGACCATCATCAGAATTGCAATCACTCTCGGATTCACTGAAGTCTCGA
TTTAATGCAATGTCAATGAGATACAAAGATTCAATCGCAAAGAGCACAAGAGGCTGGAAGGAGAAATTGTTCTCTCGCAATACTTCAATGTCAGATATTGGCTCT
GAGGTTAGAAGAGAGGTTAATGTTGGAATAGCAACGGTATCGCGCATGATGGAACGTCTTGAAACAAGAGATGCTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAAT
GTAGGGGATAACAACCCGGTTTCGGAATCAAATGATAGACGGACACCAAAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGCGTCTCAAATAAAGAAGGTTCATGCCCTGCA
GAATCCAGTTCAAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESPTMDETKNSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPVSLKDPTSQGLLEAVEQERSFRLNPVR
NSTIFRHPTFGDFELQHLPAGADDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSPPNSSSTSPLPRDNREGEAASRIMVATVSPPQPAG
EESPQLNASASPVQTDQSSPSAPQYSSRSASQLGSPSSDRRSTSQPVPSSQDRAGPSSELQSLSDSLKSRFNAMSMRYKDSIAKSTRGWKEKLFSRNTSMSDIGS
EVRREVNVGIATVSRMMERLETRDARKSSSPESSNVGDNNPVSESNDRRTPKNGGNNPLSVSNKEGSCPAESSSS