; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g105200 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g105200
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationCsor_Chr17:8142026..8145939
RNA-Seq ExpressionCsor.00g105200
SyntenyCsor.00g105200
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575655.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]0.0100Show/hide
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KAG7014205.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.55e-201100Show/hide
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XP_022991911.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita maxima]8.93e-20099.32Show/hide
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XP_023549060.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.76e-19999.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase4.77e-17180.06Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase6.92e-17380.95Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase1.71e-17380.95Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase3.00e-19899.33Show/hide
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase4.32e-20099.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A9.0e-1742.57Show/hide
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        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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        S
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A1.2e-1330.25Show/hide
Query:  SVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPI----SSSSPPDS-------DPSSFVI---------VDPLPTTSDDNY
        S T   P SSSSS+ S+S  + +   P  +T            + S+ S +P+     S++ P S       D S+F +         + PLP +  + +
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Query:  LLSSPQFLRLFQQLA--DSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL
        LL S  F RL  Q++  + + +    S    P +  K+++ A+P I++    L  D    CA+CK+ F+L+  A+++PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+
Subjt:  LLSSPQFLRLFQQLA--DSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL

Query:  CRYKLPSDEPSDHVRCRGATMALLRARDLMPQEDSYGL
        CR++LP+++ +D     GA +  + A     ++ + GL
Subjt:  CRYKLPSDEPSDHVRCRGATMALLRARDLMPQEDSYGL

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING16.5e-1532.37Show/hide
Query:  LVSPSSSSSSSSSSSS-----------SSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVIVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQ
        L+ PSSSS+++SSS+S           + S    P     F    +      SS      +  ++P D           LP    D ++   P   +L Q
Subjt:  LVSPSSSSSSSSSSSS-----------SSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVIVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQ

Query:  QLADSSDSDFAPSVPFNPFTP--IKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSD
        QLA++  + +         TP   K+++ A+P + ++ + L  +    CA+C D F    EAKQ+PC HLYH DC+LPWL  H+SCP+CR++LP+D+P  
Subjt:  QLADSSDSDFAPSVPFNPFTP--IKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSD

Query:  HVRCRGA
          R RGA
Subjt:  HVRCRGA

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.3e-1527.72Show/hide
Query:  MSSASAATAAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVI-------
        ++S  +A AA      ++C++C+ +VT+            S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +P SS S  P +DP S ++       
Subjt:  MSSASAATAAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVI-------

Query:  ----------------VDPLPTTSDDN----------YLLSSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP-
                        + P   ++  N          +L +  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP 
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Query:  -IKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSDHVRCRGA
          K+++ A+PT+KV+  ML+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CR++LP+D+P    R +G+
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Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF14.1e-1743.56Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
Subjt:  S

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G31940.1 unknown protein3.2e-3358.62Show/hide
Query:  NSDSQPTFPLHLCFFFLILFMFLAFSWHSTYESAVEGVFDQLKLLLIVSPLLLLLLVHWLSN--GENGRLPPLVSLPEKDSLHRAGGTPWGVGFMLVILL
        + +  P  PLHLC F LIL MF+  SW+++YE  +EG   Q KL L+ SPLLLLL VH+LS+  G  G +  L+ L E++SL+RAGGTPWGV FMLV L 
Subjt:  NSDSQPTFPLHLCFFFLILFMFLAFSWHSTYESAVEGVFDQLKLLLIVSPLLLLLLVHWLSN--GENGRLPPLVSLPEKDSLHRAGGTPWGVGFMLVILL

Query:  FMISYQSYFQERWFPL
        FM+SYQS FQERWFPL
Subjt:  FMISYQSYFQERWFPL

AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein4.9e-1835.4Show/hide
Query:  LEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVIVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAML--
        LE  D+T P  +  +    + S+SPP             P  +  +Y  SS  F        D  +S F          P++    ++PTIK+SS+ML  
Subjt:  LEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVIVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAML--

Query:  --EEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSD
           +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP     D
Subjt:  --EEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSD

AT3G19950.1 RING/U-box superfamily protein9.3e-1727.72Show/hide
Query:  MSSASAATAAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVI-------
        ++S  +A AA      ++C++C+ +VT+            S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +P SS S  P +DP S ++       
Subjt:  MSSASAATAAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVI-------

Query:  ----------------VDPLPTTSDDN----------YLLSSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP-
                        + P   ++  N          +L +  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP 
Subjt:  ----------------VDPLPTTSDDN----------YLLSSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP-

Query:  -IKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSDHVRCRGA
          K+++ A+PT+KV+  ML+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CR++LP+D+P    R +G+
Subjt:  -IKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSDHVRCRGA

AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein3.4e-4339.86Show/hide
Query:  MSSASAATAAA---AERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPD------SDPSSFV
        MSS++  T       ER TYWCHECDMS++L+       SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D  I      D       D   + 
Subjt:  MSSASAATAAA---AERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPD------SDPSSFV

Query:  IVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVSSAML------EEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHL
         VDP    SDDN+LL SP   RL + LA  +    + S   +  + +K+S + +IPTI++SS++L      + D +L+CA+CK+ F++   A++LPCSH+
Subjt:  IVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVSSAML------EEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSHL

Query:  YHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDE------PSDHVRCRGATMALLRARDLMPQEDSYGLRTTLEHMARRHSSI
        YH DCI+PWLS+H+SCPLCR++LP+            +R R + +A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
Subjt:  YHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDE------PSDHVRCRGATMALLRARDLMPQEDSYGLRTTLEHMARRHSSI

AT5G19875.1 unknown protein2.0e-2755.34Show/hide
Query:  HLCFFFLILFMFLAFSWHSTYESAVEGVFDQLKLLLIVSPLLLLLLVHWLSNGENGRLPPLVSLPEKDSLHRAGGTPWGVGFMLVILLFMISYQSYFQER
        HLCF F+++F  L+F+W+  +ES +E   D LKL+ I +PL LLLLVH+ S G    L   V  PE+DS+HRAG +PWGV  +LV++LFM+SYQS FQER
Subjt:  HLCFFFLILFMFLAFSWHSTYESAVEGVFDQLKLLLIVSPLLLLLLVHWLSNGENGRLPPLVSLPEKDSLHRAGGTPWGVGFMLVILLFMISYQSYFQER

Query:  WFP
        WFP
Subjt:  WFP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGTCAATGGAGACTCCTCCACCTCAAATTCCGATTCTCAGCCCACTTTTCCTCTTCATCTCTGCTTCTTCTTTCTCATCCTCTTCATGTTCTTGGCCTTCTCTTG
GCACTCGACTTACGAGTCGGCTGTTGAAGGCGTTTTCGATCAGCTCAAGCTTCTTCTCATCGTCTCGCCACTCCTCCTCCTCCTCCTTGTTCACTGGCTCTCCAATGGTG
AAAACGGCCGCCTACCGCCCCTCGTCTCCCTACCGGAAAAGGACTCGCTCCACCGCGCTGGAGGGACACCGTGGGGAGTTGGGTTTATGTTGGTTATTCTCCTTTTCATG
ATCTCTTACCAATCTTACTTCCAAGAACGGTGGTTTCCTCTGTTGAGCCGGGGCGGGATCGATTGGAACGCCAAAATTCAGCGGTACGTCACTTCAGGTGTGGTAAAAAC
CATGTCCTCCGCCTCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGAACGGCACACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTATCTCCTTCTTCGTCTTCTTCGT
CTTCTTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTCTCCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTTGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCC
GACCACCCCATTTCCTCTTCTTCCCCTCCAGATTCCGATCCGTCATCCTTCGTCATCGTCGACCCTCTTCCGACCACCTCCGATGACAATTACCTCCTCAGCAGCCCCCA
ATTCCTCCGCCTTTTCCAGCAGCTAGCGGATTCATCCGATTCCGATTTCGCCCCATCTGTACCCTTCAACCCATTTACTCCGATCAAAGCCTCTGTCATGGCGATTCCCA
CGATTAAAGTCTCCTCCGCCATGCTCGAGGAAGACCCAATTCTAATTTGTGCTATTTGCAAGGATAAGTTCCTTCTTGAGGTGGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCAT
CTCTACCATCCTGATTGCATTCTTCCATGGCTTTCTAATCATGATTCGTGCCCTCTTTGCCGCTATAAGCTTCCTTCTGATGAACCTTCGGATCATGTGAGATGTAGAGG
AGCAACTATGGCCTTGTTGAGGGCTAGGGACCTGATGCCTCAAGAAGATAGTTATGGGTTGCGGACTACTCTTGAACATATGGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTTCAGTG
AAGGAGTTCAAGTGGATTCGTCTCAATCTCCCACTCAGTTGGGGGTTGCTGTGATGGGAAATGGGGAACAGACTGACAGTGTTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGAT
GATGGGATTGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTTTCTGCAAATTTGAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGTCAATGGAGACTCCTCCACCTCAAATTCCGATTCTCAGCCCACTTTTCCTCTTCATCTCTGCTTCTTCTTTCTCATCCTCTTCATGTTCTTGGCCTTCTCTTG
GCACTCGACTTACGAGTCGGCTGTTGAAGGCGTTTTCGATCAGCTCAAGCTTCTTCTCATCGTCTCGCCACTCCTCCTCCTCCTCCTTGTTCACTGGCTCTCCAATGGTG
AAAACGGCCGCCTACCGCCCCTCGTCTCCCTACCGGAAAAGGACTCGCTCCACCGCGCTGGAGGGACACCGTGGGGAGTTGGGTTTATGTTGGTTATTCTCCTTTTCATG
ATCTCTTACCAATCTTACTTCCAAGAACGGTGGTTTCCTCTGTTGAGCCGGGGCGGGATCGATTGGAACGCCAAAATTCAGCGGTACGTCACTTCAGGTGTGGTAAAAAC
CATGTCCTCCGCCTCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGAACGGCACACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTATCTCCTTCTTCGTCTTCTTCGT
CTTCTTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTCTCCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTTGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCC
GACCACCCCATTTCCTCTTCTTCCCCTCCAGATTCCGATCCGTCATCCTTCGTCATCGTCGACCCTCTTCCGACCACCTCCGATGACAATTACCTCCTCAGCAGCCCCCA
ATTCCTCCGCCTTTTCCAGCAGCTAGCGGATTCATCCGATTCCGATTTCGCCCCATCTGTACCCTTCAACCCATTTACTCCGATCAAAGCCTCTGTCATGGCGATTCCCA
CGATTAAAGTCTCCTCCGCCATGCTCGAGGAAGACCCAATTCTAATTTGTGCTATTTGCAAGGATAAGTTCCTTCTTGAGGTGGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCAT
CTCTACCATCCTGATTGCATTCTTCCATGGCTTTCTAATCATGATTCGTGCCCTCTTTGCCGCTATAAGCTTCCTTCTGATGAACCTTCGGATCATGTGAGATGTAGAGG
AGCAACTATGGCCTTGTTGAGGGCTAGGGACCTGATGCCTCAAGAAGATAGTTATGGGTTGCGGACTACTCTTGAACATATGGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTTCAGTG
AAGGAGTTCAAGTGGATTCGTCTCAATCTCCCACTCAGTTGGGGGTTGCTGTGATGGGAAATGGGGAACAGACTGACAGTGTTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGAT
GATGGGATTGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTTTCTGCAAATTTGAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVNGDSSTSNSDSQPTFPLHLCFFFLILFMFLAFSWHSTYESAVEGVFDQLKLLLIVSPLLLLLLVHWLSNGENGRLPPLVSLPEKDSLHRAGGTPWGVGFMLVILLFM
ISYQSYFQERWFPLLSRGGIDWNAKIQRYVTSGVVKTMSSASAATAAAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSIS
DHPISSSSPPDSDPSSFVIVDPLPTTSDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSAMLEEDPILICAICKDKFLLEVEAKQLPCSH
LYHPDCILPWLSNHDSCPLCRYKLPSDEPSDHVRCRGATMALLRARDLMPQEDSYGLRTTLEHMARRHSSIFSEGVQVDSSQSPTQLGVAVMGNGEQTDSVETVSSVATD
DGIDIGVSPSSFVSANLR