; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g149070 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g149070
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionAgamous-like putative transcription factor
Genome locationCsor_Chr14:5435408..5438872
RNA-Seq ExpressionCsor.00g149070
SyntenyCsor.00g149070
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581388.1 Floral homeotic protein AGAMOUS, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.79e-156100Show/hide
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NP_001292633.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucumis sativus]6.32e-13397.12Show/hide
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XP_022142063.1 floral homeotic protein AGAMOUS-like [Momordica charantia]3.08e-13498.56Show/hide
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XP_022925702.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucurbita moschata]4.26e-136100Show/hide
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XP_022978760.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucurbita maxima]1.22e-13599.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UBM0 Floral homeotic protein AGAMOUS isoform X26.59e-13396.63Show/hide
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A0A6J1ECE2 floral homeotic protein AGAMOUS2.06e-136100Show/hide
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A0A6J1IR53 floral homeotic protein AGAMOUS5.91e-13699.52Show/hide
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Q1WG48 MADS box 21.49e-13498.56Show/hide
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Q9SBK1 Agamous-like putative transcription factor3.06e-13397.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q01540 Floral homeotic protein AGAMOUS1.5e-7670.37Show/hide
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Q40168 Floral homeotic protein AGAMOUS1.1e-7983.98Show/hide
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Q40872 Floral homeotic protein AGAMOUS1.3e-8076.67Show/hide
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Q40885 Floral homeotic protein AGAMOUS1.2e-8177.62Show/hide
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Q43585 Floral homeotic protein AGAMOUS5.7e-8478.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42830.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein7.6e-6875.43Show/hide
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AT2G42830.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.5e-6674.58Show/hide
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AT3G58780.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein6.3e-7076.4Show/hide
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AT4G09960.3 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.9e-6674.01Show/hide
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AT4G18960.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein5.3e-7771.3Show/hide
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        KLR QI ++QNSNR ++GE++ S+S K+L++LE +LE+ I+RIRSKKNELLF+EI+YM+KRE+DLHN+NQ+LRAKIAE+ERN    + M GG    +LM 
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Query:  ----QSHPYDPRDFFQ
            QS P+D R++FQ
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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