; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g200030 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g200030
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
Descriptionprotein MIZU-KUSSEI 1-like
Genome locationCsor_Chr03:4880411..4883653
RNA-Seq ExpressionCsor.00g200030
SyntenyCsor.00g200030
Gene Ontology termsGO:0010274 - hydrotropism (biological process)
InterPro domainsIPR006460 - Protein MIZU-KUSSEI 1-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603628.1 Protein MIZU-KUSSEI 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.25e-129100Show/hide
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KAG7033814.1 Protein MIZU-KUSSEI 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.44e-9597.33Show/hide
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XP_022978268.1 protein MIZU-KUSSEI 1-like [Cucurbita maxima]2.82e-9093.33Show/hide
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XP_023545032.1 protein MIZU-KUSSEI 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.15e-9296Show/hide
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A0A0A0KXC2 Uncharacterized protein2.45e-7782.67Show/hide
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A0A1S3BKH4 protein MIZU-KUSSEI 15.69e-7681.33Show/hide
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A0A5D3DK02 Protein MIZU-KUSSEI 15.69e-7681.33Show/hide
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A0A6J1GF92 protein MIZU-KUSSEI 1-like2.47e-9496.67Show/hide
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A0A6J1ISJ8 protein MIZU-KUSSEI 1-like1.37e-9093.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22227 Protein MIZU-KUSSEI 13.8e-0957.14Show/hide
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        V GT++GH+RGHV F VQ ++ R+ P LLL+L + T  LV EM  GLVRIALEC +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21050.1 Protein of unknown function, DUF6173.5e-1051.56Show/hide
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        S + V GT FGHRRG V FC+Q   + + P LLLEL + T  L  EM   G++RIALEC+R  S
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AT1G76610.1 Protein of unknown function, DUF6172.3e-0953.12Show/hide
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AT2G37880.1 Protein of unknown function, DUF6177.8e-3453.09Show/hide
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        M KID+LRRF LPC   PT   T +T +T A KKRLSTSLRDD+++             QDS A++  S +   +A   + +A+  P RPSKTMVIGTIF
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        G R+GHVWFCVQ DRL  KP LLLEL I T QLV+EM  GLVR+ALEC     ++S +L S+
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AT2G41660.1 Protein of unknown function, DUF6172.7e-1057.14Show/hide
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AT3G25640.1 Protein of unknown function, DUF6177.8e-1041.94Show/hide
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        V+GT+FG+RRGHV+F VQ D  R  P +L++LP  T  LV EM  GLVRIALE               T +  +DS    +E S+W+ +  G+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAGATCGACGCCCTTCGTCGGTTTTTCCTCCCCTGTTTCTTTCCGCCCACCGCCACAACCGCCACCGCCGCCACCGCCGCCCCCAAGAAACGTCTGAGCACCTC
GCTTCGTGACGACTTAGAAATCTCCGCGTCCACCACCGCCAATGGCGGTCCAACCCACGATCAAGATTCTCCCGCCACTACTCCCGACAGCATCACGCCGAAGTTCGCAG
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AGATGGGTGAGGGGCGGGACATATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAAGATCGACGCCCTTCGTCGGTTTTTCCTCCCCTGTTTCTTTCCGCCCACCGCCACAACCGCCACCGCCGCCACCGCCGCCCCCAAGAAACGTCTGAGCACCTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QDRLRNKPFLLLELPILTHQLVNEMRFGLVRIALECNRMESIVLSSIQDGTGSPLSDSSTTMEASSWKVWALGEMGEGRDI