; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g207630 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g207630
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionB3 domain-containing protein At5g06250-like
Genome locationCsor_Chr06:2468939..2469812
RNA-Seq ExpressionCsor.00g207630
SyntenyCsor.00g207630
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596592.1 B3 domain-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.27e-183100Show/hide
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XP_038905859.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X2 [Benincasa hispida]6.41e-12074.5Show/hide
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A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X15.83e-12069.5Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X25.64e-12069.5Show/hide
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A0A6J1FHX6 B3 domain-containing protein At5g06250-like3.73e-18299.18Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like8.55e-11768.25Show/hide
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A0A6J1L1C4 B3 domain-containing protein At5g06250-like5.74e-17496.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560001.3e-4950.59Show/hide
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        SYVLTKGW+R+VKEKRLDAGDVV FER R     GDRLFIG +RR   + A+T A   A R+  ++       P+ P  +        P+ P  SY    
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               D  HA+ S     S + S G+  S+ LRLFGV+L+C     EPE  +T
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360809.3e-5354.08Show/hide
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        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                SS+   S+ H  ++  L     Q Y  PHA   +V+SQ   
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         GNSK LRLFGV++ECQ D S+  +PST  G +
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115801.3e-4949.58Show/hide
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        MS+NH+ +   LHH   +  A+        ++  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        G D  T +KG+LLSFEDESGK W+FRY
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Query:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SYWNSSQSYVLTKGW+R+VK+K LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++        E    T  + S  + PY   H    + ++    Y  Y
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Query:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEP
             HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP
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Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062501.7e-5447.81Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
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Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H  ++  +PP    
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Query:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        Y  Y    A ++    T S   VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
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Q9M268 B3 domain-containing transcription factor NGA21.8e-4045.81Show/hide
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Query:  GDRLFIGWKRRSPV-----STAETAAATRIFCSSNP-YPSHHHHHNHNH------LPSPPY-QSYDCPHAESSVQS---------QTVSVGN--SKILRL
         D+L+I W+RR  +          A   R +   +P  P+++  HN  H      L    Y +S +  H  + ++S         Q  S+ +   K LRL
Subjt:  GDRLFIGWKRRSPV-----STAETAAATRIFCSSNP-YPSHHHHHNHNH------LPSPPY-QSYDCPHAESSVQS---------QTVSVGN--SKILRL

Query:  FGVDLEC---QTDMSEPEQPSTLGGGS
        FGVD+EC      ++  E+ S+  GGS
Subjt:  FGVDLEC---QTDMSEPEQPSTLGGGS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein6.6e-5454.08Show/hide
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        MS+N +SSD H H    +       H       K  +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   D  +KGLLL FEDE GK WRFRYSYWNSS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS

Query:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS
        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                SS+   S+ H  ++  L     Q Y  PHA   +V+SQ   
Subjt:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS

Query:  VGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQPSTLGGGS
         GNSK LRLFGV++ECQ D S+  +PST  G +
Subjt:  VGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQPSTLGGGS

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.9e-4863.76Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS
        MS+N +SSD H H    +       H       K  +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   D  +KGLLL FEDE GK WRFRYSYWNSS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS

Query:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA
        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S++
Subjt:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein8.9e-5149.58Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY
        MS+NH+ +   LHH   +  A+        ++  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        G D  T +KG+LLSFEDESGK W+FRY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY

Query:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SYWNSSQSYVLTKGW+R+VK+K LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++        E    T  + S  + PY   H    + ++    Y  Y
Subjt:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY

Query:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEP
             HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP
Subjt:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEP

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein8.6e-5447.94Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE

Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H      +   +++
Subjt:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY

Query:  DCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
          P   SSV      VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
Subjt:  DCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.2e-5547.81Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE

Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H  ++  +PP    
Subjt:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----

Query:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        Y  Y    A ++    T S   VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
Subjt:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTTAAACCACTTCTCTTCAGACTGCCATCTCCACCACCCCAAATCCTCCGCCTCCGCCGTCGACCACCACCTCATCCACCACCACCGCAAGCACCCCATG
TTCGAAAAGCCCTTGACTCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGCCTCGTCATCCCCAAGCAATATGCTGAAAAATATTTCCCACTTTCCCCCGGCGGCGACACG
GCGGACAAGGGCTTGCTTCTTAGCTTCGAAGATGAGTCCGGTAAGATGTGGCGCTTCCGTTACTCGTATTGGAATAGTAGCCAGAGCTATGTGCTCACTAAAGGG
TGGACCCGCTTTGTCAAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTCTTTGAACGCCACCGCCGTGATGGGGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAGCGGCGC
TCGCCCGTGTCCACGGCGGAGACGGCGGCGGCGACTAGAATCTTCTGTTCTTCAAACCCATATCCTTCTCATCATCATCATCATAATCATAATCATCTTCCTTCA
CCGCCATACCAATCTTATGATTGTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGTCTGTTCGGGGTGGACTTG
GAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACAACCCTCGACGCTCGGTGGCGGATCGGGTCTATCGGGTCAAGATCCAACCCGTCACAGCTTCTACACACACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCTTAAACCACTTCTCTTCAGACTGCCATCTCCACCACCCCAAATCCTCCGCCTCCGCCGTCGACCACCACCTCATCCACCACCACCGCAAGCACCCCATG
TTCGAAAAGCCCTTGACTCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGCCTCGTCATCCCCAAGCAATATGCTGAAAAATATTTCCCACTTTCCCCCGGCGGCGACACG
GCGGACAAGGGCTTGCTTCTTAGCTTCGAAGATGAGTCCGGTAAGATGTGGCGCTTCCGTTACTCGTATTGGAATAGTAGCCAGAGCTATGTGCTCACTAAAGGG
TGGACCCGCTTTGTCAAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTCTTTGAACGCCACCGCCGTGATGGGGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAGCGGCGC
TCGCCCGTGTCCACGGCGGAGACGGCGGCGGCGACTAGAATCTTCTGTTCTTCAAACCCATATCCTTCTCATCATCATCATCATAATCATAATCATCTTCCTTCA
CCGCCATACCAATCTTATGATTGTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGTCTGTTCGGGGTGGACTTG
GAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACAACCCTCGACGCTCGGTGGCGGATCGGGTCTATCGGGTCAAGATCCAACCCGTCACAGCTTCTACACACACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHRKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKG
WTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDL
ECQTDMSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH