; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g291380 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g291380
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
Descriptiondefensin J1-2-like
Genome locationCsor_Chr04:16362817..16363132
RNA-Seq ExpressionCsor.00g291380
SyntenyCsor.00g291380
Gene Ontology termsGO:0031640 - killing of cells of other organism (biological process)
GO:0050832 - defense response to fungus (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003614 - Knottin, scorpion toxin-like
IPR008176 - Defensin, plant
IPR036574 - Knottin, scorpion toxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601912.1 hypothetical protein SDJN03_07145, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.82e-51100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1GNQ3 defensin J1-2-like1.47e-5097.33Show/hide
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A0A6J1JK66 defensin J1-2-like5.42e-4693.33Show/hide
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A0A6J1JUM8 defensin J1-2-like4.79e-4998.67Show/hide
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V5LEQ8 Defensin-like protein 11.09e-4593.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65740 Defensin J1-22.6e-2269.57Show/hide
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P82659 Defensin SD23.0e-1856.76Show/hide
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Q39182 Defensin-like protein 25.4e-2059.42Show/hide
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Q41914 Defensin-like protein 43.9e-1857.97Show/hide
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Q9ZUL7 Defensin-like protein 15.4e-2059.46Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61070.1 low-molecular-weight cysteine-rich 667.1e-1554.55Show/hide
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AT2G02100.1 low-molecular-weight cysteine-rich 693.9e-2159.42Show/hide
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AT2G02120.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein2.8e-1957.97Show/hide
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AT5G63660.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein3.7e-1652.05Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAAGGGGTTGTGTTTCAGTAAGAACAACTGCGGCCATGTCTGCAAAACAGAGGGCTTCCATGGTGGGCATTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACAAAGCACT
GCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGTTCTTTTCAGCTGCAATTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTCGGCGGCACTGGGATGGCGCCAATGGGTACAGAGGCAAGGACATGCGAGTCTCCGAGCCGCCACTT
CAAGGGGTTGTGTTTCAGTAAGAACAACTGCGGCCATGTCTGCAAAACAGAGGGCTTCCATGGTGGGCATTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACAAAGCACT
GCGTTTGA
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