; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g291990 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g291990
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
Descriptionras-related protein RABH1b-like
Genome locationCsor_Chr19:3834893..3839776
RNA-Seq ExpressionCsor.00g291990
SyntenyCsor.00g291990
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022932970.1 ras-related protein RABH1b-like [Cucurbita moschata]3.25e-138100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]3.12e-13698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
         QSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

XP_022973260.1 ras-related protein RABH1b-like [Cucurbita maxima]2.67e-13799.04Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ GGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]8.94e-13698.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
         QSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

XP_023542507.1 ras-related protein RABH1b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.62e-13899.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DZL5 ras-related protein RABH1b3.56e-13597.12Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
         QSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

A0A6J1F3M2 ras-related protein RABH1b-like1.57e-138100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b1.51e-13698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
         QSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

A0A6J1IAX1 ras-related protein RABH1b-like1.29e-13799.04Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ GGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b4.33e-13698.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
         QSGGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b3.5e-10191.35Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQSGGC+C
Subjt:  QQSGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A2.2e-7972.77Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+V+D+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQQQSGGC
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVS+EEGE KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       +     GGC
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQQQSGGC

Query:  AC
        +C
Subjt:  AC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e8.4e-9587.5Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVS+EEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ GGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d1.8e-8982.69Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+V+DVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+ K EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ G C+C
Subjt:  QQSGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c1.3e-8277.21Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++V+DV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSA-KQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVS+ EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S A K +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSA-KQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQQQ-----SGGCAC
         +QQ      GGC+C
Subjt:  SQQQ-----SGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D1.3e-9082.69Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+V+DVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+ K EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ G C+C
Subjt:  QQSGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein2.5e-10291.35Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQSGGC+C
Subjt:  QQSGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C8.9e-8477.21Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++V+DV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSA-KQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVS+ EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S A K +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSA-KQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQQQ-----SGGCAC
         +QQ      GGC+C
Subjt:  SQQQ-----SGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E5.9e-9687.5Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIV+DVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVS+EEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSS KQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  QQSGGCAC
        QQ GGCAC
Subjt:  QQSGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A8.1e-7774.87Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFD +YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIV+DVAS+Q+F+NTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQQQSGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVS+EEGE KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S  KQED+VDVNLK     +  + QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQQQSGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCCACGTCGGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGGAAAACCAGCATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTCGATAATAC
ATATCAGGCTACAATTGGCATTGATTTTCTCTCAAAAACCATGTATCTGGAAGATCGCACCGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTC
TAATTCCAAGCTATATCAGGGATTCATCTGTCGCTGTCATTGTTTTTGATGTTGCAAGCCGGCAAACTTTCGTAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGCAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCCGTAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCTAAAGCTGGATTTAATATCAAGGCACTGTTCCGAAAAATCGCTGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCATCAGCAAAACAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCAGGCAGTGGTGCTGCACAATCCCAGCAGCAGTCGGGTGGATGTGCCTGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACCCACGTCGGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGGAAAACCAGCATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTCGATAATAC
ATATCAGGCTACAATTGGCATTGATTTTCTCTCAAAAACCATGTATCTGGAAGATCGCACCGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTC
TAATTCCAAGCTATATCAGGGATTCATCTGTCGCTGTCATTGTTTTTGATGTTGCAAGCCGGCAAACTTTCGTAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGCAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCCGTAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCTAAAGCTGGATTTAATATCAAGGCACTGTTCCGAAAAATCGCTGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCATCAGCAAAACAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCAGGCAGTGGTGCTGCACAATCCCAGCAGCAGTCGGGTGGATGTGCCTGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVFDVASRQTFVNTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSAKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQQQSGGCAC