| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6598682.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.58e-164 | 100 | Show/hide |
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| XP_022997246.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 [Cucurbita maxima] | 3.71e-163 | 99.6 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 4.49e-155 | 95.22 | Show/hide |
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| A0A6J1HDE4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 5.15e-163 | 99.6 | Show/hide |
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| A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 8.90e-164 | 99.6 | Show/hide |
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| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 3.11e-164 | 99.6 | Show/hide |
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| A0A6J1K6Z8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 1.80e-163 | 99.6 | Show/hide |
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.2e-26 | 44.39 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR R+ R + R R RSRSRS S R R + + RS S S RS SP
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R S RS SP ++P G
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|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-26 | 44.39 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR R+ R + R R RSRSRS S R R + + RS S S RS SP
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R S RS SP ++P G
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|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-26 | 44.39 | Show/hide |
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR R+ R + R R RSRSRS S R R + + RS S S RS SP
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R S RS SP ++P G
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|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-26 | 44.39 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR R+ R + R R RSRSRS S R R + + RS S S RS SP
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R S RS SP ++P G
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|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 7.5e-66 | 63.14 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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Query: IRKGKVME---SSSKARGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSRSRS---RERH-DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIK
I KG+V+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS RERH ++DR HR R+RSRSASPD K
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Query: DRRRGRDDVERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
R RGR D E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP +S
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 5.8e-13 | 37.94 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGKVMESSSKARGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ E +K M + + GR
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Query: ------------SRSRSPRPRH-RDDYRDRDY-----RR---RSRSRSRERHDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIKDRRRGRDDVERRSASHSD-RSM
SRSRSP PR R R DY RR RS S ER+D R + SR RS +P ++ + R RRS S S RS
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Query: SPARHSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSP
SP SP RS+SPRR+ P R R SPRR S +P SRS SP
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|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 1.2e-10 | 33.91 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGKVMESSSKARGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V F AE+ RK K E ++ RG
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGKVMESSSKARGR
Query: SRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERHDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIKDRRRGRDDVERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSR
R +RDR R RY SRSRS P R + R R D H RS+SP D RRS S R+P S
Subjt: SRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERHDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIKDRRRGRDDVERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSR
Query: GRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDA
G +P R SRS SP + +A
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|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 4.2e-11 | 35.18 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GKVMESSSKA-RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERHDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIKDRRRGRDDVERRSASHSD---RSMSPAR-
+ + ++ R + R RSP PR+ R RR RSRSR R P + R +SRS SP +DRR ++ RS H+ RS SP R
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Query: --HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDA
HS RRS+SPR+ + ++P + S P SRSP+P A
Subjt: --HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDA
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 5.4e-67 | 63.14 | Show/hide |
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MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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I KG+V+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS RERH ++DR HR R+RSRSASPD K
Subjt: IRKGKVME---SSSKARGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSRSRS---RERH-DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRIK
Query: DRRRGRDDVERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDEHSPRRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
R RGR D E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP +S
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| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 5.4e-67 | 63.14 | Show/hide |
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MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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I KG+V+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS RERH ++DR HR R+RSRSASPD K
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R RGR D E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP +S
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