; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Csor.00g314120 (gene) of Silver-seed gourd (wild; sororia) v1 genome

Gene IDCsor.00g314120
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationCsor_Chr15:1821896..1824081
RNA-Seq ExpressionCsor.00g314120
SyntenyCsor.00g314120
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578707.1 hypothetical protein SDJN03_23155, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.25e-138100Show/hide
Query:  MLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNKSRFDEMGWRDNPMTADMDK
        MLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNKSRFDEMGWRDNPMTADMDK
Subjt:  MLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNKSRFDEMGWRDNPMTADMDK

Query:  NARYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIIS
        NARYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIIS
Subjt:  NARYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIIS

Query:  SFALSKRP
        SFALSKRP
Subjt:  SFALSKRP

KAG7016238.1 CASP-like protein 4D1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.31e-5852.86Show/hide
Query:  LATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNK--------------------
        LATII+G+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFF DKFLSYLL T TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFF K    +                     
Subjt:  LATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNK--------------------

Query:  SRFDEMGWRDNPMTADMDKNARYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYA
        +    +G  D+ +      + R+ +ATIIIG  FNLLQIA +L  ++    G +LFDFFGDK LSY L  G AA  G ++DL+     D+  +FFD+  A
Subjt:  SRFDEMGWRDNPMTADMDKNARYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYA

Query:  ASALLLFAFFCSAAVSIISSFALSKRP
        A+ALLL AF CSA VS++SSFALS +P
Subjt:  ASALLLFAFFCSAAVSIISSFALSKRP

XP_022939492.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita moschata]2.34e-6199.06Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RYVLATIIIG+VFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKRP
        ALSKRP
Subjt:  ALSKRP

XP_022992767.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita maxima]1.35e-6098.11Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSL NIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI+SSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKRP
        ALSKRP
Subjt:  ALSKRP

XP_023549516.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.69e-6199.06Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSL NIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKRP
        ALSKRP
Subjt:  ALSKRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU83 CASP-like protein8.84e-4983.81Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG AAGFG+ VDL+ +DPDD F  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSI+SSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKR
        ALSKR
Subjt:  ALSKR

A0A1S3C9H1 CASP-like protein7.69e-5085.71Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG AAGFG+ VDL+  DPDD F TFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI+SSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKR
        ALSKR
Subjt:  ALSKR

A0A6J1FG26 CASP-like protein3.44e-5187.85Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISS
        RYVLATII+ IVFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLAT TAAGFG+SVDLQ T DP+D FGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI+SS
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISS

Query:  FALSKRP
        FALSKRP
Subjt:  FALSKRP

A0A6J1FGY1 CASP-like protein1.13e-6199.06Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RYVLATIIIG+VFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKRP
        ALSKRP
Subjt:  ALSKRP

A0A6J1JQU5 CASP-like protein6.51e-6198.11Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF
        RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSL NIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI+SSF
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSF

Query:  ALSKRP
        ALSKRP
Subjt:  ALSKRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1XGB4 CASP-like protein PIMP12.2e-1847.71Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVK----GATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI
        RY++AT+IIG+ + LLQIAFS+  +      G  G +LFDF+GDKF+SY L TG AA FG++ DL+ L+  D +  F + + AA++L L  FF + A SI
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVK----GATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSI

Query:  ISSFALSKR
         SS+ L KR
Subjt:  ISSFALSKR

B9SXY8 CASP-like protein 4D11.8e-1745.05Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKG-----ATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAV
        RY+LATI+IG+ + +LQIAF+L  +  G       G + FDFFGDK +SY+L TG AAGF  + D++        F  F +K YA+++LLL  F C+A +
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKG-----ATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAV

Query:  SIISSFALSKR
        S+ SS+AL K+
Subjt:  SIISSFALSKR

C6T1Z6 CASP-like protein 4D18.3e-1849.09Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKG-----ATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVS
        RY+++TIIIG  +NLLQ+A S+  +V G       G  LFDFFGDK +SYLL +G+AAGFG++V+L    P +   +F DKA A+++LLL AF  +A  S
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKG-----ATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVS

Query:  IISSFALSKR
          +SFAL K+
Subjt:  IISSFALSKR

Q56X75 CASP-like protein 4D21.8e-1743.86Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILF--DFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS
        RY+L+  +IG+V+ ++Q+ F++     G      +  DF+GDK +SYL+ATG+AAGFG++ DL+        LD  D    FF K YA+++LLLFAF C 
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILF--DFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS

Query:  AAVSIISSFALSKR
        A +S+ SSFA++KR
Subjt:  AAVSIISSFALSKR

Q8GWD5 CASP-like protein 4D11.4e-1746.96Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATG--TILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS
        RY+L+  +IG+V+ ++Q+  ++     G T   T  FDF+GDK +SYLLATG+AAGFG+S DL+         D  D    FF K YA+++LLLFAF   
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATG--TILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS

Query:  AAVSIISSFALSKRP
        A +S+ SS ALSKRP
Subjt:  AAVSIISSFALSKRP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39518.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.3e-1843.86Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILF--DFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS
        RY+L+  +IG+V+ ++Q+ F++     G      +  DF+GDK +SYL+ATG+AAGFG++ DL+        LD  D    FF K YA+++LLLFAF C 
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILF--DFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS

Query:  AAVSIISSFALSKR
        A +S+ SSFA++KR
Subjt:  AAVSIISSFALSKR

AT2G39530.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.0e-1846.96Show/hide
Query:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATG--TILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS
        RY+L+  +IG+V+ ++Q+  ++     G T   T  FDF+GDK +SYLLATG+AAGFG+S DL+         D  D    FF K YA+++LLLFAF   
Subjt:  RYVLATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATG--TILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQ-------TLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCS

Query:  AAVSIISSFALSKRP
        A +S+ SS ALSKRP
Subjt:  AAVSIISSFALSKRP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGCTACTATCATCGTCGGGGTTGTATTCAACCTCTTGCAGATCGCGTTCTCCCTCTTTAATATCGTTAAGAATCGAAACGGTACCATACTATTTGATTTC
TTTGCCGACAAGTTTTTGTCGTATCTTCTAGTAACGAGCACTGCAGCTGGGTTTGGAGTTTCAGTGGATTTGCAAAGAACAAAAGACCCAGAGGATTTGTTTGGA
ACGTTCTTTGGTAAGAAACTAAGAAGAAATAAGTCCAGGTTTGATGAGATGGGTTGGAGGGACAACCCTATGACAGCTGATATGGACAAGAATGCCAGGTACGTG
CTTGCTACAATCATCATCGGGATCGTATTCAACCTCTTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTAAATATCGTTAAAGGTGCAACCGGTACCATACTATTTGATTTCTTT
GGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCCACAGGCACAGCAGCTGGGTTTGGACTATCAGTGGATTTGCAAACATTAGACCCAGATGACTACTTTGGAACGTTC
TTTGACAAGGCATATGCGGCCTCGGCTCTTCTTTTGTTCGCGTTCTTTTGTTCGGCGGCGGTCTCTATTATCTCTTCCTTTGCACTCTCGAAGCGACCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTGCTACTATCATCGTCGGGGTTGTATTCAACCTCTTGCAGATCGCGTTCTCCCTCTTTAATATCGTTAAGAATCGAAACGGTACCATACTATTTGATTTC
TTTGCCGACAAGTTTTTGTCGTATCTTCTAGTAACGAGCACTGCAGCTGGGTTTGGAGTTTCAGTGGATTTGCAAAGAACAAAAGACCCAGAGGATTTGTTTGGA
ACGTTCTTTGGTAAGAAACTAAGAAGAAATAAGTCCAGGTTTGATGAGATGGGTTGGAGGGACAACCCTATGACAGCTGATATGGACAAGAATGCCAGGTACGTG
CTTGCTACAATCATCATCGGGATCGTATTCAACCTCTTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTAAATATCGTTAAAGGTGCAACCGGTACCATACTATTTGATTTCTTT
GGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCCACAGGCACAGCAGCTGGGTTTGGACTATCAGTGGATTTGCAAACATTAGACCCAGATGACTACTTTGGAACGTTC
TTTGACAAGGCATATGCGGCCTCGGCTCTTCTTTTGTTCGCGTTCTTTTGTTCGGCGGCGGTCTCTATTATCTCTTCCTTTGCACTCTCGAAGCGACCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLATIIVGVVFNLLQIAFSLFNIVKNRNGTILFDFFADKFLSYLLVTSTAAGFGVSVDLQRTKDPEDLFGTFFGKKLRRNKSRFDEMGWRDNPMTADMDKNARYV
LATIIIGIVFNLLQIAFSLLNIVKGATGTILFDFFGDKFLSYLLATGTAAGFGLSVDLQTLDPDDYFGTFFDKAYAASALLLFAFFCSAAVSIISSFALSKRP