; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G10124 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G10124
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionRibosomal RNA-processing protein 8
Genome locationctg1673:5798938..5802205
RNA-Seq ExpressionCucsat.G10124
SyntenyCucsat.G10124
Gene Ontology termsGO:0006364 - rRNA processing (biological process)
GO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007823 - Ribosomal RNA processing protein 8
IPR029063 - S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
IPR042036 - Ribosomal RNA-processing protein 8, N-terminal domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142786.1 ribosomal RNA-processing protein 8 [Cucumis sativus]4.59e-18198.12Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD GSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

XP_008458812.1 PREDICTED: ribosomal RNA-processing protein 8 isoform X1 [Cucumis melo]2.58e-17193.23Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE +SQDIVVS+SSDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

XP_022938486.1 ribosomal RNA-processing protein 8-like [Cucurbita moschata]7.49e-16488.68Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S++KRKRAKRR ++K+K  TN++PDATEP+ QDIVVS SSDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYL EA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP +F++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS

XP_022993338.1 ribosomal RNA-processing protein 8-like [Cucurbita maxima]1.64e-16589.43Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S+RKRKRAKRRG++K+K  TN++PD TEP+ +DIVVS SSDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP KF++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS

XP_038889651.1 ribosomal RNA-processing protein 8 [Benincasa hispida]1.67e-16992.48Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRG+NK+K STNNLPD T P+ QDIVVS SSDGK   +VSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGF+SALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUD5 Ribosomal RNA-processing protein 82.22e-18198.12Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD GSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

A0A1S3C8U7 Ribosomal RNA-processing protein 81.25e-17193.23Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE +SQDIVVS+SSDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

A0A5A7T472 Ribosomal RNA-processing protein 81.25e-17193.23Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE +SQDIVVS+SSDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S+
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSK

A0A6J1FDA4 Ribosomal RNA-processing protein 83.62e-16488.68Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S++KRKRAKRR ++K+K  TN++PDATEP+ QDIVVS SSDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYL EA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP +F++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS

A0A6J1K1X6 Ribosomal RNA-processing protein 87.94e-16689.43Show/hide
Query:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S+RKRKRAKRRG++K+K  TN++PD TEP+ +DIVVS SSDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP KF++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK  K S
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O43159 Ribosomal RNA-processing protein 83.1e-4540.94Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        S  + R R K +   K+K     +PD     +       S   +     + + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK
        +Q Q+  WP  PV+ I + L++   S +VADFGCGD RL+ +++N V  FDL S DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLK
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK

Query:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK
        P G L ++EV SRF+      D + F++AV +LGF    KD +N  F L  F+K
Subjt:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK

O44410 Ribosomal RNA-processing protein 81.9e-4237.89Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        SS    K+ ++RG  K K        A E  + D+  +              +  + + + RL  G FR LNEKLYTCTG EA ++FKED   FD+YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNV--KNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV
        + +Q+  WP  P+  II+WL+       V D GCG+A++++ V  K+K+ SFDLV+ +  V +CDMS  P + +S D+ ++CLSLMG N   ++ EARRV
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNV--KNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV

Query:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK
        LK  G L I+EV SRF         K+F +A+ ++GF  + +      F+++ FKK
Subjt:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK

Q5U4F0 Ribosomal RNA-processing protein 86.8e-4542.29Show/hide
Query:  RKRKRAKRRGTNKSK--VSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGY
        R R++ KRR  NK +   + + +P        ++  +  SD ++T     + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G+
Subjt:  RKRKRAKRRGTNKSK--VSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGY

Query:  QEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKP
        Q Q+  WP  PV+ I K L++   S +VADFGCGD RL+ +V+N V  FDL + DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLKP
Subjt:  QEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKP

Query:  RGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK
         G L ++EV SRF+      D + F+ AV +LGF    KD +N  F L  F+K
Subjt:  RGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK

Q84JC0 Ribosomal RNA-processing protein 83.5e-8964.64Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV
        +SR RKR ++R    SK      P  T P +Q+     +    K  +  GS         S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV

Query:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL
        +FD+YHTGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+
Subjt:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL

Query:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK
         EA RVL+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LKDFSNKMFIL +FKKK
Subjt:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK

Q9DB85 Ribosomal RNA-processing protein 81.2e-4441.73Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        S  + R R K +  +K+K      P+   P +           K   + S + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK
        +Q Q+  WP  PV+ I K L++   S +VADFGCGD RL+ +V+N V  FDL S DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLK
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK

Query:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK
          G L ++EV SRF+      D + F+ AV +LGF    KD +N  F L  F+K
Subjt:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40530.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein2.5e-9064.64Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV
        +SR RKR ++R    SK      P  T P +Q+     +    K  +  GS         S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV

Query:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL
        +FD+YHTGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+
Subjt:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL

Query:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK
         EA RVL+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LKDFSNKMFIL +FKKK
Subjt:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK

AT5G40530.2 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein7.4e-8759.58Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV
        +SR RKR ++R    SK      P  T P +Q+     +    K  +  GS         S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGS---------SSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKV

Query:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL
        +FD+YHTGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+
Subjt:  LFDVYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYL

Query:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALK-----------------------DFSNKMFILLYFKKKV
         EA RVL+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LK                       DFSNKMFIL +FKKKV
Subjt:  AEARRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALK-----------------------DFSNKMFILLYFKKKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGATGGGGGCAGCTCAAGCAGAAAGCGGAAGAGAGCGAAGCGTCGGGGAACTAACAAAAGCAAAGTTTCTACCAATAATTTACCGGATGCTACTGAGCCCACTAG
CCAAGATATCGTTGTTTCTGCTTCTTCCGACGGCAAAAAAACTCTGAGGGTTTCCGGCTCGTCTAGTTTCCTTGATAAGATGCGTGCTCGTTTGTCAGGAGGGCATTTCA
GGATGCTTAACGAGAAGTTGTATACTTGCACAGGGGAAGAGGCGCTTAATTATTTCAAGGAAGACAAGGTTTTGTTTGATGTGTATCATACAGGATATCAAGAGCAAATG
ACACATTGGCCTGAGCTTCCTGTGAATTTAATCATAAAATGGCTGAAGGAGCACGATCCCTCATTTATCGTGGCTGATTTTGGCTGTGGGGATGCACGCCTTTCGAAGAA
TGTGAAGAATAAAGTTTTCTCATTTGATCTCGTTTCAAAAGATCCTTCTGTCATTGCTTGTGATATGTCAAATACACCTCTCGACTCTGCATCTGTGGATGTTGCTGTCT
TTTGCCTTTCACTTATGGGAGTCAATTATGCAAGTTACTTGGCAGAAGCGCGACGAGTACTTAAACCACGTGGATGGCTTTTAATATCAGAAGTTAAAAGCAGGTTTGAC
CCTAGCAATGGAGGAGCCGACCCCAAAAAGTTCATAAAGGCTGTTTGTGAGCTAGGTTTCGTCTCAGCTTTGAAGGACTTCTCAAATAAGATGTTTATTTTGTTATACTT
CAAGAAAAAGGTTTGTAAATGTTCCAAGTACCTTAATCTACAAATTGTGCCTATTTCTTCTCAATCTTCTTATAATAGTTGGCATCTCTTAAGGACAAGTGTTGAATTAT
TAACCAAACTTCAAAAGGAAAAATATACAAAATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGATGGGGGCAGCTCAAGCAGAAAGCGGAAGAGAGCGAAGCGTCGGGGAACTAACAAAAGCAAAGTTTCTACCAATAATTTACCGGATGCTACTGAGCCCACTAG
CCAAGATATCGTTGTTTCTGCTTCTTCCGACGGCAAAAAAACTCTGAGGGTTTCCGGCTCGTCTAGTTTCCTTGATAAGATGCGTGCTCGTTTGTCAGGAGGGCATTTCA
GGATGCTTAACGAGAAGTTGTATACTTGCACAGGGGAAGAGGCGCTTAATTATTTCAAGGAAGACAAGGTTTTGTTTGATGTGTATCATACAGGATATCAAGAGCAAATG
ACACATTGGCCTGAGCTTCCTGTGAATTTAATCATAAAATGGCTGAAGGAGCACGATCCCTCATTTATCGTGGCTGATTTTGGCTGTGGGGATGCACGCCTTTCGAAGAA
TGTGAAGAATAAAGTTTTCTCATTTGATCTCGTTTCAAAAGATCCTTCTGTCATTGCTTGTGATATGTCAAATACACCTCTCGACTCTGCATCTGTGGATGTTGCTGTCT
TTTGCCTTTCACTTATGGGAGTCAATTATGCAAGTTACTTGGCAGAAGCGCGACGAGTACTTAAACCACGTGGATGGCTTTTAATATCAGAAGTTAAAAGCAGGTTTGAC
CCTAGCAATGGAGGAGCCGACCCCAAAAAGTTCATAAAGGCTGTTTGTGAGCTAGGTTTCGTCTCAGCTTTGAAGGACTTCTCAAATAAGATGTTTATTTTGTTATACTT
CAAGAAAAAGGTTTGTAAATGTTCCAAGTACCTTAATCTACAAATTGTGCCTATTTCTTCTCAATCTTCTTATAATAGTTGGCATCTCTTAAGGACAAGTGTTGAATTAT
TAACCAAACTTCAAAAGGAAAAATATACAAAATTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADGGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPTSQDIVVSASSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGYQEQM
THWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKPRGWLLISEVKSRFD
PSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKVCKCSKYLNLQIVPISSQSSYNSWHLLRTSVELLTKLQKEKYTKF