CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G10160
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	F-box protein
Genome location	ctg1673:6523948..6525445
RNA-Seq Expression	Cucsat.G10160
Synteny	Cucsat.G10160
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR032675 - Leucine-rich repeat domain superfamily

Homology

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TYK05784.1 F-box protein [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008463492.1 PREDICTED: F-box protein At2g39490 [Cucumis melo]

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XP_022133518.1 F-box protein At2g39490 [Momordica charantia]

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XP_038890950.1 LOW QUALITY PROTEIN: F-box protein At2g39490 [Benincasa hispida]

2.00e-200

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TrEMBL top hits

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A0A0A0KNP4 F-box domain-containing protein

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A0A1S3CJE5 F-box protein At2g39490

7.29e-231

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A0A5D3C3A4 F-box protein

1.21e-229

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A0A6J1BZC3 F-box protein At2g39490

5.83e-174

72.46

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         SN GYN+NAL+TFLQ+CPTLERLFVTIDPK Y TPS  TY  NV R++K +HL+LV LKGF D NEE+ LIR IKELV+V+P+F+S  ++N LESL  +
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        P NH+KS+SFI+IR   + S+    FSKL DD +QT PKHPHMNL
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A0A6J1FHP3 F-box protein At2g39490

2.44e-163

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        SIA  +KLHLDFSA  S FP+ FDWELKFDT  NPSP +F +KSLCLKSV+ LTN+AVSSLV +IR LE+LRI+RC GFRSLC+GS+PKL  LTVL+C D
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        LRFLHI+CS LRSFR+RG+LPRIRLESHFNLQDAMLD RQG GCNNLKIS+FDPCLLTIKNA TLTLC WNYE LI PS+ASLQGNFIFY++KELWWIG 
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         SN  +N+NALL+FLQ+CP LERLFVTIDPK Y TPSK  Y  NV R+ K EHL+LVSLKGF D+NEEM LI++IKE+V V+PVF+S ID +        
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                     + EK+GSN     SKLDD +Q WPKHPHMNL
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q5S4V7 F-box protein At2g39490

3.7e-55

41.55

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        +APHN +H+  F +  S+    F W L+ D Q  +    S F VK+LCL SV  LT+E VSS+VL    L++L+I RC    SL I S  KL  L++  C
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Query:  PDLRFLHIKCSKLRSFRYRGQLPRIRLESHFNLQDAMLDIRQGPGCNNLKISDFDPCLLTIKNANTLTLCRWNYEVLIRPSLASLQGNFIFYNIKELWWI
        P LR+L I   KL++F Y+G LP I++  HFNL  A+ D+ QGP   N  + D  P  LTIKN+ +LTLCRW +E +I+PS++S   +F FY ++EL WI
Subjt:  PDLRFLHIKCSKLRSFRYRGQLPRIRLESHFNLQDAMLDIRQGPGCNNLKISDFDPCLLTIKNANTLTLCRWNYEVLIRPSLASLQGNFIFYNIKELWWI

Query:  GSNSNGGYNNNALLTFLQICPTLERLFVTIDPKGYGTPSKETYMNNVRRKTKLEHLQLVSLKGFVDQNEEMELIRLIKELVAVN
          NS      N+L++FL++CP++ERLF+TID   Y + ++E  +N    +  L  L++V L+GF  + ++ +LI  ++E+V+++
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G39490.1 F-box family protein

2.6e-56

41.55

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Query:  IAPHNKLHLD-FSAPKSEFPYHFDWELKFDTQ--KNPSPSSFYVKSLCLKSVTYLTNEAVSSLVLNIRFLENLRIERCNGFRSLCIGSTPKLQSLTVLEC
        +APHN +H+  F +  S+    F W L+ D Q  +    S F VK+LCL SV  LT+E VSS+VL    L++L+I RC    SL I S  KL  L++  C
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Query:  PDLRFLHIKCSKLRSFRYRGQLPRIRLESHFNLQDAMLDIRQGPGCNNLKISDFDPCLLTIKNANTLTLCRWNYEVLIRPSLASLQGNFIFYNIKELWWI
        P LR+L I   KL++F Y+G LP I++  HFNL  A+ D+ QGP   N  + D  P  LTIKN+ +LTLCRW +E +I+PS++S   +F FY ++EL WI
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

TCCATTGCACCTCATAATAAGCTTCACTTGGATTTCTCCGCTCCAAAATCAGAGTTCCCATATCATTTTGATTGGGAACTTAAGTTTGATACACAAAAAAATCCATCTCC
ATCTTCCTTTTACGTTAAATCTTTGTGTCTTAAGTCTGTCACTTACCTTACCAATGAAGCTGTTTCCTCCCTTGTTTTGAATATTCGTTTTCTTGAGAATTTAAGGATCG
AACGGTGCAACGGATTTCGATCCTTATGTATCGGTTCAACTCCGAAGCTTCAAAGCCTGACTGTTTTGGAATGTCCGGATTTGAGGTTTCTCCATATCAAGTGTTCGAAG
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DAEQTWPKHPHMNL

Cucsat.G10160 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome