; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G10575 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G10575
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationctg1679:364898..368885
RNA-Seq ExpressionCucsat.G10575
SyntenyCucsat.G10575
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]5.25e-12980.48Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]1.39e-14088.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein2.29e-16199.59Show/hide
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A0A1S3C4A9 protodermal factor 1-like9.26e-15194.19Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like9.26e-15194.19Show/hide
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like2.57e-12881.05Show/hide
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like2.54e-12980.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 12.9e-4646.86Show/hide
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           G  P       H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P TP + P TP TP IP     I  TC YW NHP LI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 12.0e-4746.86Show/hide
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        VS  V+ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP    G+PPS                  + S P PPSH                          
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           G  P       H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P TP + P TP TP IP     I  TC YW NHP LI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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