; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G106 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G106
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT4
Genome locationctg1:1907665..1909820
RNA-Seq ExpressionCucsat.G106
SyntenyCucsat.G106
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR006712 - HD-ZIP protein, N-terminal
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577673.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.67e-16288.26Show/hide
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XP_038906160.1 homeobox-leucine zipper protein HAT4 [Benincasa hispida]1.25e-16790.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6T6 Homeobox domain-containing protein1.92e-195100Show/hide
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A0A1S3BJZ9 homeobox-leucine zipper protein HAT41.57e-18797.09Show/hide
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A0A5D3CLM5 Homeobox-leucine zipper protein HAT41.57e-18797.09Show/hide
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A0A6J1E9Y0 homeobox-leucine zipper protein HAT43.19e-16087.9Show/hide
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A0A6J1HKW5 homeobox-leucine zipper protein HAT4-like1.25e-16287.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46600 Homeobox-leucine zipper protein HAT11.6e-6456.64Show/hide
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P46601 Homeobox-leucine zipper protein HAT26.8e-6856.86Show/hide
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        G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E 
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        LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P SS               +  H+ RP+  INPW +          F AL PRS
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P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT31.0e-6860.59Show/hide
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        YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  SS+S   P +          + + P+  ++PWA+ P+  RP    H
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P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-41.8e-6559.85Show/hide
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        P K HN+  T         L  +S     +++R S+ G S LRG +VNR   S A  D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CS
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        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+   ++ T+AP  T T     +  P    P
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Q05466 Homeobox-leucine zipper protein HAT44.0e-7659.52Show/hide
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        +LGL+LGL      ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
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Query:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL
        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP     PQP       A S  H + P++   P         F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 41.3e-6659.85Show/hide
Query:  PSKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS
        P K HN+  T         L  +S     +++R S+ G S LRG +VNR   S A  D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CS
Subjt:  PSKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS

Query:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ
        R    G SD+ED   G+ SRKKLRL+KDQ+ VLEE+FKEH+TLNPKQKLALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+NLTEENRRLQ
Subjt:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ

Query:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSS-TSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARP
        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+   ++ T+AP  T T     +  P    P
Subjt:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSS-TSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARP

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 37.4e-7060.59Show/hide
Query:  NSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG----
        N+W N   S   +   RS LRGIDVNR P +   D E+E A +SSPNSTVSSV SGK+SERE+            ED + +RA CS  G SD+EDG    
Subjt:  NSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG----

Query:  -ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQF
         ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV ELRALKLSP  
Subjt:  -ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQF

Query:  YMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWAS-PIPTRPFNALH
        YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  SS+S   P +          + + P+  ++PWA+ P+  RP    H
Subjt:  YMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWAS-PIPTRPFNALH

AT4G16780.1 homeobox protein 22.8e-7759.52Show/hide
Query:  NLGLTLGLTLDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE
        +LGL+LGL      ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
Subjt:  NLGLTLGLTLDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE

Query:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL
        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP     PQP       A S  H + P++   P         F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS

AT4G17460.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein1.1e-6556.64Show/hide
Query:  SKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWT-NDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN-----GEDLD--GD
        +++H L L L  T  SP  +L  +  N      + +  +  LR IDVN + P+T D EEE  +SSPNST+SS VSGKR  +ERE       G+DLD   D
Subjt:  SKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWT-NDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN-----GEDLD--GD

Query:  RACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ
        R+ SRG SDEE+   GET RKKLRL+KDQSAVLE++FKEHNTLNPKQKLALAK+LGL  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E LTEENRRL+
Subjt:  RACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ

Query:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS
        KE  ELRALKLSP+ Y  M+PPTTL MCPSCERVA P SS                  H+ R +  ++PW        F+ + PRS
Subjt:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS

AT5G47370.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein4.8e-6956.86Show/hide
Query:  MIPSKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN
        M+  +   L L+LG + +  PL +N   N + S+              S LR IDVN   PST +CEE+  +SSPNST+SS +SGKRSERE        +
Subjt:  MIPSKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN

Query:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN
        G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E 
Subjt:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN

Query:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWAS----PIPTRPFNALHPRS
        LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P SS               +  H+ RP+  INPW +          F AL PRS
Subjt:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWAS----PIPTRPFNALHPRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCCTTCTAAACACCATAATCTCGGTTTAACCCTTGGATTAACCCTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTGGACTAATGATGCTTCTTCAGATCGGACATC
GGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGTCGAGCCCTAACAGTACGGTATCGA
GTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGAATTAGTGATGAAGAAGACGGTGAAACTTCTAGAAAA
AAGCTTCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACATAATACTCTCAATCCGAAGCAAAAGTTGGCGTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCG
GCCAAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCCTAAAGAGATGCTGTGAAAATCTAACGGAGG
AGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTCAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCACCCACCACCCTCACCATGTGCCCCTCGTGT
GAGCGTGTCGCTGTTCCGCCCTCCTCCACATCAGCCCCCCAGCCCACTGTCACACGAATGGGCCAGGCCCAATCTCAGCCCCACCACGCTCGCCCTATCCACCACATCAA
CCCCTGGGCCTCCCCCATACCCACCCGGCCTTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCCCTTCTAAACACCATAATCTCGGTTTAACCCTTGGATTAACCCTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTGGACTAATGATGCTTCTTCAGATCGGACATC
GGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGTCGAGCCCTAACAGTACGGTATCGA
GTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGAATTAGTGATGAAGAAGACGGTGAAACTTCTAGAAAA
AAGCTTCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACATAATACTCTCAATCCGAAGCAAAAGTTGGCGTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCG
GCCAAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCCTAAAGAGATGCTGTGAAAATCTAACGGAGG
AGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTCAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCACCCACCACCCTCACCATGTGCCCCTCGTGT
GAGCGTGTCGCTGTTCCGCCCTCCTCCACATCAGCCCCCCAGCCCACTGTCACACGAATGGGCCAGGCCCAATCTCAGCCCCACCACGCTCGCCCTATCCACCACATCAA
CCCCTGGGCCTCCCCCATACCCACCCGGCCTTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIPSKHHNLGLTLGLTLDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRK
KLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSC
ERVAVPPSSTSAPQPTVTRMGQAQSQPHHARPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS