; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G10686 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G10686
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionGlycine rich protein
Genome locationctg1681:736339..737360
RNA-Seq ExpressionCucsat.G10686
SyntenyCucsat.G10686
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CEG62450.1 Glycine rich protein [Cucumis sativus]4.91e-7098.32Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        RCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP

KAA0059138.1 cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo var. makuwa]2.12e-5792.5Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG-HDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRY
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG + RG G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGCRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG-HDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRY

Query:  GRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        GRCG+ CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

KAE8645725.1 hypothetical protein Csa_020407 [Cucumis sativus]9.18e-7887.01Show/hide
Query:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGG----------
        MQIFLIPL QNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNE TVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG+DRGYGGG          
Subjt:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGG----------

Query:  ------RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
              RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  ------RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

KGN43456.1 hypothetical protein Csa_020456 [Cucumis sativus]2.12e-8499.28Show/hide
Query:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG
        MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG
Subjt:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG

Query:  GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

NP_001267708.1 glycine-rich protein-like precursor [Cucumis sativus]1.21e-7099.16Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        RCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K1B1 Cell wall glycine-rich protein4.23e-6172.96Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGG-----------------------------
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNE TVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG+DRGYGGG                             
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGG-----------------------------

Query:  -----------RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
                   RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  -----------RGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein1.03e-8499.28Show/hide
Query:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG
        MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG
Subjt:  MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYG

Query:  GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A1IXP4 Glycine rich protein2.38e-7098.32Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        RCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like1.03e-5792.5Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG-HDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRY
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG + RG G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGCRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGG-HDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRY

Query:  GRCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        GRCG+ CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGHDCCSYAGEVVEGAKP

A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein5.84e-7199.16Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP
        RCGH CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGHDCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11898 Glycine-rich protein HC17.7e-0446.15Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG-----YGGGHDRGYGG---------GRGGY--GRGHYGG
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      G GGY  G      GGG+  G GG         G GGY  G GH+ G
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG-----YGGGHDRGYGG---------GRGGY--GRGHYGG

Query:  RGGYGGGRGGY--GRGCRYGRCGHDCCSYA
         GGY  G GGY  G G  Y  C   CCS A
Subjt:  RGGYGGGRGGY--GRGCRYGRCGHDCCSYA

P23137 Glycine-rich protein1.4e-0849.19Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGY-GRGC
        M SKAF+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +       GRGGY+   G G+   YGGGR         GRGG     GGY  RGC
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGY-GRGC

Query:  RYGRC--GHD----CCSYAGEVVE
        RYG C  G++    CCSYAGE ++
Subjt:  RYGRC--GHD----CCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.15.9e-0446.15Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG-----YGGGHDRGYGG---------GRGGY--GRGHYGG
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      G GGY  G      GGG+  G GG         G GGY  G GH+ G
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGRGGYDRG-----YGGGHDRGYGG---------GRGGY--GRGHYGG

Query:  RGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYA
         GGY  GGG  G G  C Y  C   CCS A
Subjt:  RGGY--GGGRGGYGRGCRYGRCGHDCCSYA

Q09134 Abscisic acid and environmental stress-inducible protein3.1e-0555.42Show/hide
Query:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGY--GRGHYGGRGGYGGGRGGYGRG
        VLL+SSEV+ARDL ET+S    E   +TN V DAKYG GGY+ G GG +  GY  G GGY  G G+  G GGY  G GGY  G
Subjt:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGY--GRGHYGGRGGYGGGRGGYGRG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05520.6 glycine-rich protein 37.9e-0445.45Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        M+SKA V LGL    VLL+ SEVAA      SS T N  + ET   +   YG  G +   GGG+  G G  +GG GR  Y G GG  GG G  G  CR+G
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RC--GHD----CCSYAGEVVE
         C  G++    CCSYAGE V+
Subjt:  RC--GHD----CCSYAGEVVE

AT2G05530.1 Glycine-rich protein family6.0e-0445.9Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGY-GGGRGGYGRGCRY
        M+SKA V  GL    VLL+ +EVAA   A  + K+++  TV+ +       G GGY+   GGG   GY GG GG+  G Y G GGY GGG GG    CRY
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGY-GGGRGGYGRGCRY

Query:  GRC--GHD----CCSYAGEVVE
        G C  G+     CCSYAGE V+
Subjt:  GRC--GHD----CCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family2.9e-0644.09Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED-AKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYG-RG--
        M+SKA +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S++  N    E    E    +  GGY    GGG+    GGG G  G G+    GGYG   GGYG RG  
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED-AKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRGGYG-RG--

Query:  -CRYGRCGHD-------CCSYAGEVVE
         CRYG C          CC+YAG+ V+
Subjt:  -CRYGRCGHD-------CCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATCTTTCTCATCCCTCTCTCCCAAAATCAATCTCTTACTATACACACAAATATGAGTTCCAAAGCCTTTGTTTTTCTCGGCCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTTCT
CCTATCGTCTGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACGGACAACGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGCGTTGAGGATGCCAAGTATGGAAGAGGAG
GGTATGACAGAGGCTATGGCGGAGGGCACGACAGAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGGTATGGTCGTGGTCATTACGGTGGCCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGT
GGCTACGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGTGGGCACGATTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGTGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAATCTTTCTCATCCCTCTCTCCCAAAATCAATCTCTTACTATACACACAAATATGAGTTCCAAAGCCTTTGTTTTTCTCGGCCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTTCT
CCTATCGTCTGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACGGACAACGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGCGTTGAGGATGCCAAGTATGGAAGAGGAG
GGTATGACAGAGGCTATGGCGGAGGGCACGACAGAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGGTATGGTCGTGGTCATTACGGTGGCCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGT
GGCTACGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGTGGGCACGATTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGTGCAAAACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIFLIPLSQNQSLTIHTNMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGRGGYDRGYGGGHDRGYGGGRGGYGRGHYGGRGGYGGGRG
GYGRGCRYGRCGHDCCSYAGEVVEGAKP