; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G1082 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G1082
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionhistone deacetylase complex subunit SAP18
Genome locationctg1:7607799..7610110
RNA-Seq ExpressionCucsat.G1082
SyntenyCucsat.G1082
Gene Ontology termsGO:0045892 - negative regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003714 - transcription corepressor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR010516 - Sin3 associated polypeptide p18
IPR042534 - Sin3 associated polypeptide p18 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049010.1 histone deacetylase complex subunit SAP18 [Cucumis melo var. makuwa]4.14e-8992.52Show/hide
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XP_008438121.1 PREDICTED: histone deacetylase complex subunit SAP18 [Cucumis melo]5.95e-9193.15Show/hide
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XP_031737715.1 histone deacetylase complex subunit SAP18 isoform X1 [Cucumis sativus]9.45e-10199.32Show/hide
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XP_038879427.1 histone deacetylase complex subunit SAP18 [Benincasa hispida]1.10e-8690.41Show/hide
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A0A0A0L6C9 Uncharacterized protein4.28e-9394.52Show/hide
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A0A1S3AVL4 histone deacetylase complex subunit SAP182.88e-9193.15Show/hide
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A0A5A7U0S8 Histone deacetylase complex subunit SAP182.01e-8992.52Show/hide
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A0A5D3D2K7 Histone deacetylase complex subunit SAP182.88e-9193.15Show/hide
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A0A6J1D024 histone deacetylase complex subunit SAP183.06e-8688.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O00422 Histone deacetylase complex subunit SAP186.3e-2347.06Show/hide
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O55128 Histone deacetylase complex subunit SAP183.7e-2347.9Show/hide
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O64644 Histone deacetylase complex subunit SAP187.2e-4363.09Show/hide
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Q3T022 Histone deacetylase complex subunit SAP182.8e-2347.9Show/hide
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Q5RDT5 Histone deacetylase complex subunit SAP186.3e-2347.06Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45640.1 SIN3 associated polypeptide P185.1e-4463.09Show/hide
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AT2G45640.2 SIN3 associated polypeptide P189.6e-4361.74Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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