; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G11073 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G11073
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionBAT2_N domain-containing protein
Genome locationctg1740:3841..14982
RNA-Seq ExpressionCucsat.G11073
SyntenyCucsat.G11073
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057843.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold274G001300 [Cucumis melo var. makuwa]3.38e-24496.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1E2A7 uncharacterized protein LOC1114301324.27e-21988.28Show/hide
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A0A6J1JM57 uncharacterized protein LOC1114856452.46e-21888.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48460.1 unknown protein1.8e-3432.93Show/hide
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        + G  G   F    +   E  ++  +  Q  +  FLW + P VL++S I P  +L  ++   F++  + + +  F  E +FY G+A+FL + DR +R   
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         D     +  ++   G   S+  T+ L +++P+  + + WP  G  A   + P+LVG  VQ  FE    R+ S  WP++PIVF+VYRL+Q+ RAA  V  
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        L F +K A  T        +L  L+  LQ L ++C+WS  +FLMR FPS
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AT3G60590.2 unknown protein1.8e-1028.57Show/hide
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        F S  + S E +++ +S+ Q    +       +W +GP+VL+ S + P+L+L   LS++F  S +   L L   + +F  G  +FL + D   R  +P  
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          NS    S +F    S    L +  ++PM+ +     GL   + P     +SA  L PY + + VQ   E      +S  W V P+V++ YR+ QL R 
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          L
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AT3G60590.3 unknown protein1.8e-1028.57Show/hide
Query:  FISFYNHSKEGKRIPLSSVQSNQYKF------LWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTAEPDT
        F S  + S E +++ +S+ Q    +       +W +GP+VL+ S + P+L+L   LS++F  S +   L L   + +F  G  +FL + D   R  +P  
Subjt:  FISFYNHSKEGKRIPLSSVQSNQYKF------LWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTAEPDT

Query:  LKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTM-----GL---VWPWTGPAASAT-LAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRA
          NS    S +F    S    L +  ++PM+ +     GL   + P     +SA  L PY + + VQ   E      +S  W V P+V++ YR+ QL R 
Subjt:  LKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTM-----GL---VWPWTGPAASAT-LAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRA

Query:  AQL
          L
Subjt:  AQL

AT5G63040.1 unknown protein2.8e-8854.52Show/hide
Query:  MSVKFASISCS--VPTLSSPSDGRRSFQLSFSRGLYGIGSQQRSFQNLTFAEVESIKLMYGLLRSW--SRFPRRKNVLS-AISENQSQWCEQV--ELERV
        M+ K  S S S  VP++ SP   R SFQ    R    +        +    + + I  ++   R    S   R++  L  A SE +  + E    + + V
Subjt:  MSVKFASISCS--VPTLSSPSDGRRSFQLSFSRGLYGIGSQQRSFQNLTFAEVESIKLMYGLLRSW--SRFPRRKNVLS-AISENQSQWCEQV--ELERV

Query:  NEHPTDEDISLENNSFLHYEGTGGKPGFISFYNHSKEGKRIPL-SSVQSNQYKFLWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALF
        +     E    +++S + Y    GKPGFISFYN   + + I +    QS   + LW +GPAVLV+SFI P +YLR+++S +FEDSLLTDFLILFFTEALF
Subjt:  NEHPTDEDISLENNSFLHYEGTGGKPGFISFYNHSKEGKRIPL-SSVQSNQYKFLWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALF

Query:  YCGVAVFLFLIDRSRRTA--EPDTLKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAASATLAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVI
        YCGVA FL +IDRSR+ +   P    N      +Q GQRISSVATL LSL+IPMVTMG VWPWTGPAASATLAPYLVGIVVQFAFEQYAR + S S P+I
Subjt:  YCGVAVFLFLIDRSRRTA--EPDTLKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAASATLAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVI

Query:  PIVFQVYRLHQLNRAAQLVTALSFTIKGAEMTPNNLAINSSLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLM
        PI+FQVYRLHQLNRAAQLVTALSFT+KGAE T NNLAI  SLGTLLNV+Q LG+I IWS+SSFLM
Subjt:  PIVFQVYRLHQLNRAAQLVTALSFTIKGAEMTPNNLAINSSLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLM

AT5G63040.2 unknown protein1.4e-8761.62Show/hide
Query:  SRFPRRKNVLS-AISENQSQWCEQV--ELERVNEHPTDEDISLENNSFLHYEGTGGKPGFISFYNHSKEGKRIPL-SSVQSNQYKFLWFVGPAVLVASFI
        S   R++  L  A SE +  + E    + + V+     E    +++S + Y    GKPGFISFYN   + + I +    QS   + LW +GPAVLV+SFI
Subjt:  SRFPRRKNVLS-AISENQSQWCEQV--ELERVNEHPTDEDISLENNSFLHYEGTGGKPGFISFYNHSKEGKRIPL-SSVQSNQYKFLWFVGPAVLVASFI

Query:  FPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTA--EPDTLKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAA
         P +YLR+++S +FEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVA FL +IDRSR+ +   P    N      +Q GQRISSVATL LSL+IPMVTMG VWPWTGPAA
Subjt:  FPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTA--EPDTLKNSYQTLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAA

Query:  SATLAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRAAQLVTALSFTIKGAEMTPNNLAINSSLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLM
        SATLAPYLVGIVVQFAFEQYAR + S S P+IPI+FQVYRLHQLNRAAQLVTALSFT+KGAE T NNLAI  SLGTLLNV+Q LG+I IWS+SSFLM
Subjt:  SATLAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRAAQLVTALSFTIKGAEMTPNNLAINSSLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGTTAAATTTGCTTCTATTTCTTGCTCGGTTCCTACTCTATCTTCACCCTCCGATGGCCGGAGAAGCTTTCAGCTAAGCTTTTCACGAGGATTATATGGCATTGG
CAGCCAACAACGTAGTTTCCAGAACTTAACGTTTGCTGAAGTTGAATCCATCAAGTTAATGTATGGATTGCTGAGGTCTTGGAGCAGATTTCCAAGGAGAAAAAATGTTC
TCTCTGCTATTTCAGAGAACCAGTCTCAATGGTGTGAGCAAGTTGAGCTAGAGCGAGTAAATGAGCATCCCACTGATGAAGATATCTCCCTCGAAAACAATTCATTTTTA
CATTATGAGGGTACTGGTGGGAAACCGGGTTTTATTTCTTTTTACAACCATTCTAAAGAAGGAAAACGGATCCCTTTGTCTAGTGTGCAAAGCAATCAATACAAATTCTT
ATGGTTTGTTGGTCCGGCTGTCCTCGTAGCTTCTTTCATTTTCCCCTCTCTTTATCTGCGGAAACTACTTTCAAATATCTTTGAGGACTCTCTGTTAACAGATTTCCTTA
TATTATTCTTCACGGAAGCACTATTCTATTGTGGTGTTGCGGTGTTTCTTTTTTTAATTGATCGTTCAAGGAGAACTGCTGAACCTGACACTCTGAAAAACAGTTATCAA
ACCCTGTCTAATCAATTTGGACAGAGGATCTCTTCTGTAGCTACCTTAGCACTCAGTTTAATAATACCAATGGTCACCATGGGATTAGTGTGGCCATGGACCGGCCCTGC
AGCATCTGCAACACTAGCACCTTACCTTGTTGGGATTGTTGTCCAATTTGCATTTGAACAGTATGCACGACGCAAGAAATCATGTTCATGGCCTGTTATTCCAATTGTCT
TTCAAGTTTATAGATTGCATCAACTTAACAGAGCAGCTCAACTGGTGACAGCACTTTCATTTACCATAAAAGGAGCTGAAATGACTCCGAATAACTTGGCAATAAACAGC
TCTCTCGGTACACTGTTGAATGTTCTTCAATGTCTTGGAATAATCTGTATCTGGTCTCTCTCAAGTTTTCTTATGAGGTTTTTCCCATCAAATGCTGCAACAGTGCAGTA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGTTAAATTTGCTTCTATTTCTTGCTCGGTTCCTACTCTATCTTCACCCTCCGATGGCCGGAGAAGCTTTCAGCTAAGCTTTTCACGAGGATTATATGGCATTGG
CAGCCAACAACGTAGTTTCCAGAACTTAACGTTTGCTGAAGTTGAATCCATCAAGTTAATGTATGGATTGCTGAGGTCTTGGAGCAGATTTCCAAGGAGAAAAAATGTTC
TCTCTGCTATTTCAGAGAACCAGTCTCAATGGTGTGAGCAAGTTGAGCTAGAGCGAGTAAATGAGCATCCCACTGATGAAGATATCTCCCTCGAAAACAATTCATTTTTA
CATTATGAGGGTACTGGTGGGAAACCGGGTTTTATTTCTTTTTACAACCATTCTAAAGAAGGAAAACGGATCCCTTTGTCTAGTGTGCAAAGCAATCAATACAAATTCTT
ATGGTTTGTTGGTCCGGCTGTCCTCGTAGCTTCTTTCATTTTCCCCTCTCTTTATCTGCGGAAACTACTTTCAAATATCTTTGAGGACTCTCTGTTAACAGATTTCCTTA
TATTATTCTTCACGGAAGCACTATTCTATTGTGGTGTTGCGGTGTTTCTTTTTTTAATTGATCGTTCAAGGAGAACTGCTGAACCTGACACTCTGAAAAACAGTTATCAA
ACCCTGTCTAATCAATTTGGACAGAGGATCTCTTCTGTAGCTACCTTAGCACTCAGTTTAATAATACCAATGGTCACCATGGGATTAGTGTGGCCATGGACCGGCCCTGC
AGCATCTGCAACACTAGCACCTTACCTTGTTGGGATTGTTGTCCAATTTGCATTTGAACAGTATGCACGACGCAAGAAATCATGTTCATGGCCTGTTATTCCAATTGTCT
TTCAAGTTTATAGATTGCATCAACTTAACAGAGCAGCTCAACTGGTGACAGCACTTTCATTTACCATAAAAGGAGCTGAAATGACTCCGAATAACTTGGCAATAAACAGC
TCTCTCGGTACACTGTTGAATGTTCTTCAATGTCTTGGAATAATCTGTATCTGGTCTCTCTCAAGTTTTCTTATGAGGTTTTTCCCATCAAATGCTGCAACAGTGCAGTA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVKFASISCSVPTLSSPSDGRRSFQLSFSRGLYGIGSQQRSFQNLTFAEVESIKLMYGLLRSWSRFPRRKNVLSAISENQSQWCEQVELERVNEHPTDEDISLENNSFL
HYEGTGGKPGFISFYNHSKEGKRIPLSSVQSNQYKFLWFVGPAVLVASFIFPSLYLRKLLSNIFEDSLLTDFLILFFTEALFYCGVAVFLFLIDRSRRTAEPDTLKNSYQ
TLSNQFGQRISSVATLALSLIIPMVTMGLVWPWTGPAASATLAPYLVGIVVQFAFEQYARRKKSCSWPVIPIVFQVYRLHQLNRAAQLVTALSFTIKGAEMTPNNLAINS
SLGTLLNVLQCLGIICIWSLSSFLMRFFPSNAATVQ