; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G11216 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G11216
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description40S ribosomal protein S5
Genome locationctg1780:496281..498347
RNA-Seq ExpressionCucsat.G11216
SyntenyCucsat.G11216
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035568.1 40S ribosomal protein S5 [Cucumis melo var. makuwa]4.09e-15897.45Show/hide
Query:  MIRYLDMHNMFDRISAQFLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV
        M+RYL+M NMFDR SA FLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV
Subjt:  MIRYLDMHNMFDRISAQFLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV

Query:  ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI
        ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI
Subjt:  ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI

Query:  AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

XP_004139502.3 40S ribosomal protein S5 [Cucumis sativus]1.19e-139100Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_008447164.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Cucumis melo]7.69e-13997.61Show/hide
Query:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
        GIMAVE+DV +QELTQ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
Subjt:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH

Query:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
        AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
Subjt:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE

Query:  IERVAKANR
        IERVAKANR
Subjt:  IERVAKANR

XP_008463640.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5 [Cucumis melo]1.68e-13999.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

XP_038888890.1 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Benincasa hispida]5.61e-13998.09Show/hide
Query:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
        GIMAVEVDV +QELTQ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
Subjt:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH

Query:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
        AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
Subjt:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE

Query:  IERVAKANR
        IERVAKANR
Subjt:  IERVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5K0 Ribosomal_S7 domain-containing protein1.35e-13898.07Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DV +QELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A0A0LVI4 40S ribosomal protein S54.72e-13999.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVER TNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A1S3BGS9 40S ribosomal protein S5-like isoform X13.72e-13997.61Show/hide
Query:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
        GIMAVE+DV +QELTQ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
Subjt:  GIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH

Query:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
        AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
Subjt:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE

Query:  IERVAKANR
        IERVAKANR
Subjt:  IERVAKANR

A0A1S3CLA9 40S ribosomal protein S58.16e-14099.52Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5D3E4H0 40S ribosomal protein S51.98e-15897.45Show/hide
Query:  MIRYLDMHNMFDRISAQFLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV
        M+RYL+M NMFDR SA FLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV
Subjt:  MIRYLDMHNMFDRISAQFLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIV

Query:  ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI
        ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI
Subjt:  ERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTI

Query:  AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)4.6e-9794.21Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NPIQVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S55.0e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-21.3e-9686.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S55.0e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-11.2e-9786.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B8.7e-9986.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B8.7e-9986.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   ++ ++   Q  ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A9.6e-9886.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A9.6e-9886.96Show/hide
Query:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MA   DV ++      ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  MAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

ATCG01240.1 ribosomal protein S75.4e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAATATGAAAATGATTAGGTATCTGGATATGCATAACATGTTTGATCGAATTAGTGCTCAATTTCTTTGTGTAAATAAATGGTCTACAGGAATAATGGCTGTTGA
AGTTGATGTGGCAAGCCAGGAACTGACCCAGTCTCATCACGATGTGAAGCTGTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTGAACGACATCTCTCTGGTTGATTACG
TTGGGGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTATTCTGTCAAGCGCTTTCGGAAAGCTCAGTGCCCAATTGTGGAGAGGCTCACAAAT
TCACTTATGATGCATGGTAGAAACAACGGGAAGAAGCTTATGGCAGTCCGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATCATTCATCTTCTAACTGATCTCAACCCAATTCAAGT
TATTGTTGACGCCGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACCCGAATCGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGGCTGTGGATATATCCCCTCTGCGTCGTGTTA
ACCAAGCAATCTATCTCCTTACGACTGGTGCTCGCGAGGCTGCTTTCAGAAATATCAAGACAATTGCAGAATGCTTAGCTGATGAACTTATTAATGCAGCAAAGGGCTCT
TCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCTAATCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAATATGAAAATGATTAGGTATCTGGATATGCATAACATGTTTGATCGAATTAGTGCTCAATTTCTTTGTGTAAATAAATGGTCTACAGGAATAATGGCTGTTGA
AGTTGATGTGGCAAGCCAGGAACTGACCCAGTCTCATCACGATGTGAAGCTGTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTGAACGACATCTCTCTGGTTGATTACG
TTGGGGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTATTCTGTCAAGCGCTTTCGGAAAGCTCAGTGCCCAATTGTGGAGAGGCTCACAAAT
TCACTTATGATGCATGGTAGAAACAACGGGAAGAAGCTTATGGCAGTCCGGATTATTAAGCATGCAATGGAGATCATTCATCTTCTAACTGATCTCAACCCAATTCAAGT
TATTGTTGACGCCGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACCCGAATCGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGGCTGTGGATATATCCCCTCTGCGTCGTGTTA
ACCAAGCAATCTATCTCCTTACGACTGGTGCTCGCGAGGCTGCTTTCAGAAATATCAAGACAATTGCAGAATGCTTAGCTGATGAACTTATTAATGCAGCAAAGGGCTCT
TCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCTAATCGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNMKMIRYLDMHNMFDRISAQFLCVNKWSTGIMAVEVDVASQELTQSHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTN
SLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGS
SNSYAIKKKDEIERVAKANR