CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G11963
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	F-box domain-containing protein
Genome location	ctg1820:4040409..4046701
RNA-Seq Expression	Cucsat.G11963
Synteny	Cucsat.G11963
Gene Ontology terms	GO:0006281 - DNA repair (biological process) GO:0015074 - DNA integration (biological process) GO:0051276 - chromosome organization (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function) GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function) GO:0003677 - DNA binding (molecular function) GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

TYK16544.1 uncharacterized protein E5676_scaffold21G003600 [Cucumis melo var. makuwa]

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100

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9.10e-92

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XP_008451930.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493082 isoform X2 [Cucumis melo]

9.35e-94

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XP_011653222.1 uncharacterized protein LOC101208661 isoform X1 [Cucumis sativus]

1.89e-100

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KUY4 Uncharacterized protein

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A0A1S3BSL8 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X2

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A0A1S3BSP7 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X1

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A0A5D3D003 Uncharacterized protein

1.55e-90

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A0A6J1FN06 uncharacterized protein LOC111447296

6.40e-74

79.88

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G42070.1 unknown protein

5.6e-30

51.27

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        M  S+ S+  P    F + SH+SR     P+ SS  S F  + SS      ++     SSSP  +      D +D +F GC+ACGKEE E GCNG+GR+Q
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        GGIATVPGFGWWPIKAYRPCP FV +GGRY+R GQSMDEV  G G + +S SV   DS
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGAACTTCTCTTCTCTCAGTTCCTGCCCCATTCTTCCACTCCTCCCATCGTTCCCGATTCACCACTTCATTCCCATTTTCATCATCTAGACCCAGCCCCTTC
CTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCATCTTCGGTTGTTGATGAAGAACTCAATTCTTCTTCCCCAGATCAACTCTCTCTTCAATCTGAATCTGACCCAGAT
GATTCTTCCTTCAGAGGATGTAAGGCTTGTGGAAAGGAAGAAATTGAGAGGGGATGCAATGGTGAGGGAAGGATGCAAGGTGGAATTGCAACAGTCCCTGGTTTT
GGTTGGTGGCCTATAAAGGCATACAGGCCTTGTCCTGGATTTGTAGCATCAGGTGGCAGATACAAGCGGCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTACATCTGGAGGA
GGGAGGACCGATGCCTCTGCTAGTGTTGGTAGAAAGGACTCGTCGAGCAAGAAATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

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MGTSLLSVPAPFFHSSHRSRFTTSFPFSSSRPSPFLSSSSSSSSSSSVVDEELNSSSPDQLSLQSESDPDDSSFRGCKACGKEEIERGCNGEGRMQGGIATVPGF
GWWPIKAYRPCPGFVASGGRYKRRGQSMDEVTSGGGRTDASASVGRKDSSSKK

Cucsat.G11963 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome