; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G12035 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G12035
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationctg1820:3284757..3286801
RNA-Seq ExpressionCucsat.G12035
SyntenyCucsat.G12035
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062958.1 putative serine-rich protein [Cucumis melo var. makuwa]9.69e-27991.05Show/hide
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XP_008451820.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo]5.44e-28091.67Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.96e-24584.98Show/hide
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        YFSEANSKALKYFLHR+SKSSL+SS DSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPN NPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPR
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]2.25e-26189.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXH6 Uncharacterized protein9.11e-31299.78Show/hide
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A0A1S3BT64 uncharacterized serine-rich protein C215.132.63e-28091.67Show/hide
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A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein4.69e-27991.05Show/hide
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein2.63e-28091.67Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like5.82e-24584.75Show/hide
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Query:  PKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLG-MRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV
        PKSE+NPRSTST DHH P+ATRVGRSP+RRTPG+SSSS  RLG +RGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLG-MRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV

Query:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSS
        LNVPVCSSLRGSSKS SVFGFGPL FTGTGG    RSHQ+SSS+SS
Subjt:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein8.7e-6845.59Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELL-PVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDG
        MASACV + G+S E F          SYGW  PR+S +RDD+  S+             +      DP PE+  PV DFEF L+DPV+ ML ADELF DG
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELL-PVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDG

Query:  KLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQ-----TTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEAN
        KLVPL+ S  K +     +T   ++ +       ++S RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L       N   + ++ KA+++S  +   
Subjt:  KLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQ-----TTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEAN

Query:  SKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKPRPKS
        + + K FLHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R  + N N PR+RL KPR   
Subjt:  SKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKPRPKS

Query:  ESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVL
         ++P ST + D                    SSSSS+ +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ K + GM RSYSANVR+TPVL
Subjt:  ESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVL

Query:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR
        NVPVCS   G         FG L  + +  SSSS S  N S   S+ S NR  R
Subjt:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR

AT1G79060.1 unknown protein1.8e-7349.04Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK
        MAS CVNNV +S +            +YG   PR SFSRDD   S  +G ++   P            +   +   DFEFRL++    MLPADELF DGK
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK

Query:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL
        LV  Q       + G    +C        +    VE E S   D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS            ATTT+    +++ +L
Subjt:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL

Query:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM
        K FLHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN N I    N NHN              NPPRM
Subjt:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM

Query:  RLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSY
        RLV                 +H  S T   RVGRSP+RR+ GE+S+  +    RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   +++RGMERSY
Subjt:  RLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSY

Query:  SANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRREN
        S+NVRVTPVLNVPVC S+RG S    VFG                   +SSS+SSSS +NRTG   N
Subjt:  SANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRREN

AT3G05980.1 unknown protein2.5e-0632.68Show/hide
Query:  LGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVS--LMLPADELFFDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GLKSTRCVSSPQ
        LGPR+SFS D S   +          P +   D  +      + V+DFEF   + VS   ML ADELF +GKL+P  QV   +   N  LK+     + +
Subjt:  LGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVS--LMLPADELFFDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GLKSTRCVSSPQ

Query:  TTVQSRRRVEEECSTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSN
          V+ +++ +E  + D  +        SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+
Subjt:  TTVQSRRRVEEECSTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSN

AT3G12970.1 unknown protein9.0e-5742.79Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK
        MAS CV NVG S           P HS  W   ++S +R+  P +           PA+ + D          PV DFEF L+DPV+ ML ADELF DGK
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK

Query:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL
        LVPL+ S V       +     S   T V+  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L ++    + ++      +  +S      + + 
Subjt:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL

Query:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESN
        ++FL+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP T                            N
Subjt:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESN

Query:  PRSTSTADHHHPSATR-VGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        P + S A HHH    +   R P R T   ES+ SS    +  V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K + GM RS+SANVR+TPVLNVP
Subjt:  PRSTSTADHHHPSATR-VGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR
        V SSLR   KS   FG    LF  +  +SSS S  N +   S++  NRT R
Subjt:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATCTCCTCCGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCCTATGGTTGGCTCGGCCCTCGCCTCTCCTT
CAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCGCCGGACCTTTGTCCAAGACTAAACCTCCTGCTGTTGCCGACTCCGACAGTACTCGAGATCCGGATCCTGAACTGCTTC
CGGTTACTGACTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTTTCCTTGATGCTCCCTGCGGATGAGCTGTTTTTTGATGGCAAACTCGTGCCGCTTCAGGTTTCGTCTGTTAAA
CCCTCAGTCAACGGGTTGAAGTCCACCAGGTGCGTTTCCTCGCCACAGACTACGGTTCAGTCCCGTCGAAGAGTTGAGGAAGAATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTC
TCCTAAAGCCCCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTGGGGCTCAAAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAATGGCAACGCTAAAAACGATAACCACAAAG
CCACGACCACCTCTTACTTCTCCGAAGCTAATTCGAAGGCGTTGAAGTACTTTCTTCACCGAAGTTCCAAATCGTCGTTGTCATCCTCTTTGGATTCGTCGCTGAGCCTT
CCATTACTAAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTGTCACT
CGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCCAATCACAACAATCCACCGCGGATGAGACTGGTGAAACCGAGGCCTAAATCGGAGAGTA
ATCCAAGATCAACTTCAACAGCAGATCATCATCATCCATCGGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATACGGCGTACGCCTGGAGAATCATCGTCATCCTCCAGTAGATTA
GGGATGCGAGGAGTATCGGTAGACAGTCCACGAATGAACTCATCAGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGGACC
AAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCTGCTAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTTCCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCGTCT
CTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGGACCGGCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCCACCAGAATAGCAGCAGCAACAGTAGTAGTAGTAGTAGTAACCGGACG
GGGCGGAGGGAAAATCCATTGGTGAGAGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATCTCCTCCGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCCTATGGTTGGCTCGGCCCTCGCCTCTCCTT
CAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCGCCGGACCTTTGTCCAAGACTAAACCTCCTGCTGTTGCCGACTCCGACAGTACTCGAGATCCGGATCCTGAACTGCTTC
CGGTTACTGACTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTTTCCTTGATGCTCCCTGCGGATGAGCTGTTTTTTGATGGCAAACTCGTGCCGCTTCAGGTTTCGTCTGTTAAA
CCCTCAGTCAACGGGTTGAAGTCCACCAGGTGCGTTTCCTCGCCACAGACTACGGTTCAGTCCCGTCGAAGAGTTGAGGAAGAATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTC
TCCTAAAGCCCCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTGGGGCTCAAAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAATGGCAACGCTAAAAACGATAACCACAAAG
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CCATTACTAAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTGTCACT
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CTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGGACCGGCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCCACCAGAATAGCAGCAGCAACAGTAGTAGTAGTAGTAGTAACCGGACG
GGGCGGAGGGAAAATCCATTGGTGAGAGATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVPLQVSSVK
PSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSL
PLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRL
GMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRT
GRRENPLVRD