; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G12143 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G12143
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationctg1837:1031730..1034302
RNA-Seq ExpressionCucsat.G12143
SyntenyCucsat.G12143
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR005568 - Ribosomal protein L6, N-terminal
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149609.1 60S ribosomal protein L6-2 [Cucumis sativus]8.22e-157100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_008461779.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucumis melo]3.21e-15497.84Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_022935449.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita moschata]7.56e-15396.54Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_023528566.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.78e-15195.67Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPK AR SRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_038880885.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]2.17e-15296.97Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKA+APAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRK KPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAV+DLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9J7 60S ribosomal protein L63.98e-157100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A1S3CFY6 60S ribosomal protein L61.55e-15497.84Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A5D3CKB9 60S ribosomal protein L61.55e-15497.84Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1F5G0 60S ribosomal protein L63.66e-15396.54Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1J7G9 60S ribosomal protein L68.62e-15296.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34091 60S ribosomal protein L61.6e-9982.59Show/hide
Query:  VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVF
        VSRNP+L+RG+GKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFP+H  K       EKPPKFYPADDVKKP++NKRK KPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGKRVVF
Subjt:  VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVF

Query:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAV
        LKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQ+YVIATSTKVDI+GV+VEKFDDKYF K+ +KK KKGEGEFFEAEK+E + LPQ+KKDDQKAVD ALLK+IE V
Subjt:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAV

Query:  SDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
         +LK YL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  SDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

P47911 60S ribosomal protein L64.2e-4748.25Show/hide
Query:  PKTAR--VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAE--------------------APAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKP
        PK A+   SRNP L+RG+G+YSRS MY ++ L+  K K      + + K K E                        K P++YP +DV + +++  K KP
Subjt:  PKTAR--VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAE--------------------APAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKP

Query:  -----TKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEK-FDDKYFSKEVQKKKKKGEGEF
              +LRSSITPGTVLIILTGR +GKRVVFLKQL SGLLLVTGP  +N VPLRR +Q +VIATSTKVDI+ V + K   D YF K+  +K +  EGE 
Subjt:  -----TKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEK-FDDKYFSKEVQKKKKKGEGEF

Query:  FEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        F+ EK EK  + + +K DQKAVD  +L  I+AV  L+ YL ++FSL  GM PH+LVF
Subjt:  FEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-34.6e-10282.46Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKP+ N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV+++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-22.7e-10282.46Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKP+ N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV+++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-12.3e-10180.43Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKP+VN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI+GV+ EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQK VD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein1.6e-10280.43Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKP+VN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI+GV+ EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQK VD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein3.3e-10382.46Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKP+ N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV+++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein1.9e-10382.46Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKP+ N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV+++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGTCCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATCAAGGC
CAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGGCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCGCCGAAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAACCCATTGTCA
ACAAACGTAAAGCTAAGCCCACCAAACTTAGGTCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAA
CTTCCATCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCATTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTAAGACGTGTGAATCAGTCATACGTGATTGCAACCTCCACCAAGGTGGACATTAC
AGGGGTCAGCGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGAAAAAGAAGGGAGAAGGAGAATTTTTTGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTG
CACTTCCACAGGACAAAAAAGATGACCAGAAGGCAGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGTCTCAGACTTAAAGACATACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTG
AAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGTCCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATCAAGGC
CAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGGCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCGCCGAAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAACCCATTGTCA
ACAAACGTAAAGCTAAGCCCACCAAACTTAGGTCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAA
CTTCCATCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCATTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTAAGACGTGTGAATCAGTCATACGTGATTGCAACCTCCACCAAGGTGGACATTAC
AGGGGTCAGCGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGAAAAAGAAGGGAGAAGGAGAATTTTTTGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTG
CACTTCCACAGGACAAAAAAGATGACCAGAAGGCAGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGTCTCAGACTTAAAGACATACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTG
AAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKAEAPAEKPPKFYPADDVKKPIVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQ
LPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVSVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSL
KAGMKPHELVF