; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G12216 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G12216
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationctg1837:2309689..2310967
RNA-Seq ExpressionCucsat.G12216
SyntenyCucsat.G12216
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137753.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X1 [Cucumis sativus]1.72e-100100Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

XP_008442495.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X1 [Cucumis melo]2.47e-8087.92Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

XP_008442497.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X2 [Cucumis melo]9.32e-7887.25Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKT G+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

XP_016899678.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X3 [Cucumis melo]1.29e-7987.67Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   S ++SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

XP_031738650.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X2 [Cucumis sativus]6.50e-9899.31Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKT GNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD07 Uncharacterized protein8.32e-101100Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X11.20e-8087.92Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X24.51e-7887.25Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKT G+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X36.26e-8087.67Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   S ++SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

A0A5D3DN19 Uncharacterized protein1.20e-8087.92Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein1.1e-1135.77Show/hide
Query:  GIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPS--GQHSEVGGKSPALSY--FPKTEGNSKYKEC-------KNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVY
        G   +SS S +HIFGP  S S+  S  G    +     A++        G +KY+         +   + ++E  S+  E+   PC+LSSSIYYGGQD Y
Subjt:  GIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPS--GQHSEVGGKSPALSY--FPKTEGNSKYKEC-------KNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVY

Query:  TQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        + +     N    +  G E DS  ASRGNWW+GS  Y
Subjt:  TQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

AT3G55646.1 unknown protein1.4e-1440.43Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYK--ECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGG
        S +SS S    +FG R +SS SS+     +F S F P     ++G +      F    G+ KY+    K   ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGG
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYK--ECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGG

Query:  QDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        Q+ Y+    T  ++  K+D G E DS  ASRGNWW+GSLYY
Subjt:  QDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).9.8e-2148.28Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKPSG-----QHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        S  SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +   KT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKPSG-----QHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        YYGG DVY Q   +  NS  K+D GGEDDSG ASRGNWWQGSLYY
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).5.6e-0840.68Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKPSG-----QHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        S  SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +   KT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKPSG-----QHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNS
        YYGG DVY Q   +  NS
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNS

AT5G59080.1 unknown protein2.3e-1740.41Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD
        S ++S SFT++LFG +D S  SS+     +FS+ F    + S   G +                  K+GS + R      QE R  PCHLSSS+YYGGQD
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD

Query:  VYTQNPATGFNSPLKRD--HGGEDDSGG-----ASRGNWWQGSLYY
        VY ++       P+K D    GEDD+ G      SRGNWWQGSLYY
Subjt:  VYTQNPATGFNSPLKRD--HGGEDDSGG-----ASRGNWWQGSLYY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAACCATCCGATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCTTCTTCTTTCAAGCCCTCCGGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACCTGCTCTTTCATACTTCCCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGA
ATGGGAGCACATCAAGCAGAGAGATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGTGGTCAGGATGTCTATACTCAA
AATCCAGCAACTGGGTTCAACTCCCCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCTGGCGGTGCTTCTAGAGGAAATTGGTGGCAAGGCTCTCTTTACTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGAGAAGAAACCATCCGATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCTTCTTCTTTCAAGCCCTCCGGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACCTGCTCTTTCATACTTCCCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGA
ATGGGAGCACATCAAGCAGAGAGATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGTGGTCAGGATGTCTATACTCAA
AATCCAGCAACTGGGTTCAACTCCCCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCTGGCGGTGCTTCTAGAGGAAATTGGTGGCAAGGCTCTCTTTACTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKPSGQHSEVGGKSPALSYFPKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVYTQ
NPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY