; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G12584 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G12584
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionTF-B3 domain-containing protein
Genome locationctg1838:336884..342792
RNA-Seq ExpressionCucsat.G12584
SyntenyCucsat.G12584
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0LBH2 TF-B3 domain-containing protein2.57e-215100Show/hide
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A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X16.40e-20094.98Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X22.75e-18794.72Show/hide
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A0A6J1F8D4 B3 domain-containing protein At2g36080-like4.97e-14877.08Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like1.27e-14877.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560006.6e-4551.74Show/hide
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Q6EU30 B3 domain-containing protein Os02g06835001.0e-3757.42Show/hide
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360802.3e-5848.66Show/hide
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         GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R                             ++S  +S+RH+ S
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            S    PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115802.9e-4847.88Show/hide
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Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062505.1e-5345.7Show/hide
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        FEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G            + ++Y
Subjt:  FEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSY

Query:  PNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
         N   H     Y ++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.7e-5948.66Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDE
        MSIN +S DFH   L    Q     +    +    A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL           AAAA D+ +KGLLL FEDE
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Query:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPNSHRHLPS
         GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R                             ++S  +S+RH+ S
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Query:  PPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT
            S    PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
Subjt:  PPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.0e-4861.08Show/hide
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        MSIN +S DFH   L    Q     +    +    A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL           AAAA D+ +KGLLL FEDE
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Query:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-SAPSPTDS
         GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R  + S +DS
Subjt:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-SAPSPTDS

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein2.0e-4947.88Show/hide
Query:  VAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKR
        VA A    +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +     +    A   + +KG+LLSFEDESGK W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+K 
Subjt:  VAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKR

Query:  LDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDS-AVATGSGGVGGGGGWT------RMFCSANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGN
        LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW++R   S + + +V +    V     W+      R   ++ +YPN H+      Y +  D  HA+S      V  G+
Subjt:  LDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDS-AVATGSGGVGGGGGWT------RMFCSANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGN

Query:  SKILRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF
        S+ +RLFGV+LEC  D  EP P P + N             +H +Y  YS+P P ++ F
Subjt:  SKILRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein3.4e-5245.7Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLS
        MS+N++S D H   L+   Q     ++  + + A   H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        ++AAA   S++KG+LLS
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLS

Query:  FEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSY
        FEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G             A SY
Subjt:  FEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSY

Query:  PNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
           H        +++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
Subjt:  PNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein3.6e-5445.7Show/hide
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        MS+N++S D H   L+   Q     ++  + + A   H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        ++AAA   S++KG+LLS
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLS

Query:  FEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSY
        FEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G            + ++Y
Subjt:  FEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSY

Query:  PNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
         N   H     Y ++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
Subjt:  PNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATAAACAACTTTTCTCCTGACTTCCATCAACCACCTCTTTTCTCTACTTCCCAACTTCCCATCATGCTCAACTCCAAATCCTCTCTCTCCGTCGCCCCCGCCGA
CCACCTTCCCATGTTCGAGAAACCCTTGACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCAGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCG
CCGCAGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCGGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCT
TATTGGAATAGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGAGGCTCGATGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCGTGA
CGGTGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAAAAGAGGTCGGCACCGTCTCCAACGGACAGTGCGGTGGCTACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAA
TGTTCTGTTCTGCAAATTCATATCCTAATTCTCATCGTCATCTTCCTTCACCGCCATACCAGTCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACA
GTGTCGATTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCTGAACCACCGTCGTTGCTCAATATCGGGTCAAGTTT
AACTTTATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAAT
ATCAAGGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCATAAACAACTTTTCTCCTGACTTCCATCAACCACCTCTTTTCTCTACTTCCCAACTTCCCATCATGCTCAACTCCAAATCCTCTCTCTCCGTCGCCCCCGCCGA
CCACCTTCCCATGTTCGAGAAACCCTTGACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCAGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCG
CCGCAGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCGGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCT
TATTGGAATAGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGAGGCTCGATGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCGTGA
CGGTGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAAAAGAGGTCGGCACCGTCTCCAACGGACAGTGCGGTGGCTACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAA
TGTTCTGTTCTGCAAATTCATATCCTAATTCTCATCGTCATCTTCCTTCACCGCCATACCAGTCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACA
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AACTTTATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAAT
ATCAAGGATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYS
YWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQT
VSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDFTFSQDVNQTKYQG