| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0049431.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.27e-156 | 99.18 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
R+DYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_004134179.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis sativus] | 1.15e-160 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_008438778.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo] | 7.75e-159 | 99.19 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 7.60e-150 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRR SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 3.00e-154 | 96.77 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M RYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKR+DDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGAR+EYLSPARSRSIS SRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSPTPK+NGRSPREVDNARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.75e-159 | 99.19 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.10e-156 | 99.18 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
R+DYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.03e-147 | 93.55 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.68e-150 | 95.16 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MA+YRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRR SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.68e-150 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRR SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RRDYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.6e-21 | 41.75 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSR
+ L V NL P+ LR FE++G V DVY+P++ YT E RGF FV+F DA +A ++ V+ GRE+R+ A +R+ P R S
Subjt: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSR
Query: SSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSR
GR +RSPRRR RS SRS S +R SRSR +R + S RSRS S S+S RR S+S + + R +RSRSRSP S+ S SR
Subjt: SSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSR
Query: SRSYSP
SRS SP
Subjt: SRSYSP
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 8.0e-60 | 63.6 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R R+PPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR S+ D+ SP RSRSIS S
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
Query: SPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
PR+ R+Y N RSPRE R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.7e-30 | 45.31 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
YSP RR RGR PR Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: YSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPAR-HDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRRDYSRSPT
+N GREI +V A E+RK P+EMRV +R+ R R R+RS SRS SP R DSRSR R SPA R R D RS +
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPAR-HDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRRDYSRSPT
Query: PKDNGRS------PREVDN---------ARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRS--YSPR
P G + R DN A R R + SRSPSGSRSRS SPR
Subjt: PKDNGRS------PREVDN---------ARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRS--YSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.9e-37 | 48.79 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P +PPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R RSR Y SP R S S SP+DR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
Query: --RDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
R YSRSP + +S SRSP+ RS S ++RSY+P
Subjt: --RDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 4.7e-36 | 48.06 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P R YSRS SP RSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RR YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 3.3e-37 | 48.06 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P R YSRS SP RSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RR YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 9.1e-35 | 46.12 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P R YSRS SP RSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSP-KGDSRSPSGSRSRS
RR YSRSP D +R RS +P +G SRS S ++ +
Subjt: RRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSP-KGDSRSPSGSRSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 7.7e-34 | 45.35 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISH
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R G +R R R R YSRS SP RSR +Y SP R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISH
Query: SRSPRD-----RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
S SPR+ RR YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: SRSPRD-----RRDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.4e-38 | 48.79 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P +PPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R RSR Y SP R S S SP+DR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
Query: --RDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
R YSRSP + +S SRSP+ RS S ++RSY+P
Subjt: --RDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 5.7e-61 | 63.6 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R R+PPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR S+ D+ SP RSRSIS S
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRNRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
Query: SPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
PR+ R+Y N RSPRE R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPRDRRDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
|
|
