; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G12773 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G12773
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationctg1838:4024020..4026766
RNA-Seq ExpressionCucsat.G12773
SyntenyCucsat.G12773
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]1.53e-123100Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]1.28e-12193.43Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]2.18e-13196.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein3.19e-14399.02Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like2.13e-12399.44Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like2.13e-12399.44Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like6.19e-12293.43Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like7.26e-11593.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 66.5e-4063.64Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 26.5e-4052Show/hide
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        L    ++L +Y    I A +  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.6e-5184.68Show/hide
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 66.5e-4063.64Show/hide
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.4e-5078.23Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.2e-5284.68Show/hide
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein9.9e-5278.23Show/hide
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein9.9e-5278.23Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein9.9e-5278.23Show/hide
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein9.9e-5278.23Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQKELDATNADLIRYACSEIPAPSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSTSSYGHYYTGLYFSPWSNNNNGPCG
DGHDKGEYK