; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G13136 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G13136
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionFra a 1-associated protein
Genome locationctg1838:807169..810776
RNA-Seq ExpressionCucsat.G13136
SyntenyCucsat.G13136
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]2.76e-142100Show/hide
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XP_008442953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486704 [Cucumis melo]3.63e-11989.34Show/hide
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XP_022151462.1 uncharacterized protein LOC111019393 [Momordica charantia]2.21e-8871.57Show/hide
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        S   H+P  FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSS  SMRRGIPIE DH+   F  P EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.25e-8168.18Show/hide
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        SS  E++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLFNR+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]7.79e-11485.79Show/hide
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        S  EHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNR+SSSS SMRRGIPIE DH+P FF N KEPDSGHVDLSGLARDV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein1.33e-142100Show/hide
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867041.76e-11989.34Show/hide
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193931.07e-8871.57Show/hide
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458453.50e-8167.68Show/hide
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986062.46e-8167.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein8.5e-4852.76Show/hide
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        MGWVW+DD +        A       SP    D CSTR VVR+ CKTEEVEPGKF+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV++SNKE TE+DVTDQ++  S S G
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        S  +++   +FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S  S RR IPI+       F       SG VDLSGLARDV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein3.8e-4349.5Show/hide
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        MGW+W DD+  S + A   DK     S ++++ CST  VVRS CKTEEVEPGKFVRKC++TEEILR C G+P+EV++SN E TEEDVTDQMV RS +L +
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           +  PL+FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D           ++ R GIPIE     E+H        +   SG +DLSGLA+
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Query:  DV
        DV
Subjt:  DV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GCTATAAAAACTCAAGCCGTGGCGCTCAAGAAAAACTCCACTCTAAGAGAGAATCTTGTGGCGTTGAGGAAGGTTCGCGATATCCGAGCTTCGAAAATGGGATGGGTCTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DLSGLARDV