; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G13538 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G13538
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionMads-box transcription factor 57
Genome locationctg1838:8635843..8636572
RNA-Seq ExpressionCucsat.G13538
SyntenyCucsat.G13538
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608122.1 MADS-box transcription factor 27, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.41e-31100Show/hide
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RVW56204.1 MADS-box transcription factor ANR1 [Vitis vinifera]1.69e-2985.71Show/hide
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RVW65697.1 MADS-box transcription factor ANR1 [Vitis vinifera]1.69e-2985.71Show/hide
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TYK31253.1 mads-box transcription factor 57 [Cucumis melo var. makuwa]6.41e-31100Show/hide
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XP_022940467.1 MADS-box transcription factor 27-like isoform X5 [Cucurbita moschata]2.73e-29100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251TFZ2 Putative transcription factor, MADS-box2.04e-3089.23Show/hide
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A0A438F857 MADS-box transcription factor ANR18.16e-3085.71Show/hide
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A0A438G0F5 MADS-box transcription factor ANR18.16e-3085.71Show/hide
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A0A5D3E554 Mads-box transcription factor 573.10e-31100Show/hide
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A0A6J1FJP3 MADS-box transcription factor 27-like isoform X51.32e-29100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL166.6e-2183.33Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 273.5e-2286.67Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 573.5e-2285Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR11.2e-2291.53Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL211.5e-2081.67Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 448.6e-2491.53Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 175.8e-2076.67Show/hide
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 164.7e-2283.33Show/hide
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AT3G57230.2 AGAMOUS-like 164.7e-2283.33Show/hide
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AT4G37940.1 AGAMOUS-like 211.0e-2181.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTCAGTACAACGCTCCGTAAAAAAGCGCTGATTCTGTTTGATCTCTCACTTTGCCTTGACTCCAACAAGCACCGCACTCATCCAGAAACAAATCGAGTTGCGGATCTAAG
TATGGGGAGAGGCAAAATTGTAATTAGGAGGATCGATAATTCGACGAGCAGACAGGTGACTTTCTCGAAGCGTAGGAGCGGATTGTTAAAGAAGGCGAAAGAACTAGCGA
TTCTCTGCGATGCGGATGTCGGAGTTATCATCTTCTCCAGTACCAGCAAGCTCTATGAATACTCCAGCACCAGGTTCTATGATATTCATTTTCTGTTTCTTCTACTTTTG
CCTTTGTTTTCTTCTACTTTTTCCATTTTCAGTTTGAATAATTGCTCCGTTTCCGTACTTAATTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCTTTGTTTTCTTCTACTTTTTCCATTTTCAGTTTGAATAATTGCTCCGTTTCCGTACTTAATTTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
FSTTLRKKALILFDLSLCLDSNKHRTHPETNRVADLSMGRGKIVIRRIDNSTSRQVTFSKRRSGLLKKAKELAILCDADVGVIIFSSTSKLYEYSSTRFYDIHFLFLLLL
PLFSSTFSIFSLNNCSVSVLNL